278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1776 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2502  glutaredoxin-like protein  100 
 
 
110 aa  225  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  2.30073e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1776  glutaredoxin-like protein  100 
 
 
110 aa  225  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  9.36402e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1820  glutaredoxin-like protein  99.09 
 
 
110 aa  225  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  3.69012e-06  normal  0.269643 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1783  glutaredoxin-like protein  100 
 
 
110 aa  225  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  1.51147e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1688  glutaredoxin-like protein  94.55 
 
 
110 aa  215  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  2.96306e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1640  glutaredoxin-like protein  93.64 
 
 
110 aa  214  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  5.81694e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1648  glutaredoxin-like protein  93.64 
 
 
110 aa  214  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  4.32966e-06  hitchhiker  0.000256673 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1573  glutaredoxin-like protein  93.64 
 
 
110 aa  214  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.59728e-07  normal  0.0657649 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1640  glutaredoxin-like protein  90.83 
 
 
111 aa  213  1e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  5.18322e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2880  glutaredoxin domain-containing protein  92.73 
 
 
110 aa  211  2e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1748  glutaredoxin-like protein  89.09 
 
 
113 aa  211  2e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  4.25193e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1964  glutaredoxin-like protein  87.27 
 
 
113 aa  203  6e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0459539  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1919  glutaredoxin-related protein  85.45 
 
 
110 aa  203  6e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00265167  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2160  glutaredoxin-like protein  84.4 
 
 
116 aa  198  2e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.277546  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1835  glutaredoxin-like protein  84.4 
 
 
116 aa  197  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000570749  normal  0.937939 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2444  glutaredoxin-like protein  82.57 
 
 
115 aa  192  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72039  normal  0.0565869 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03013  hypothetical protein  76.15 
 
 
116 aa  188  3e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002935  glutaredoxin-related protein  75.23 
 
 
116 aa  186  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  1.92998e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1631  hypothetical protein  75.45 
 
 
110 aa  184  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  3.52705e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02749  putative glutaredoxin like protein  74.07 
 
 
116 aa  182  1e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1732  hypothetical protein  73.15 
 
 
115 aa  182  2e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.358242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1866  hypothetical protein  73.15 
 
 
115 aa  182  2e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  3.87905e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1975  hypothetical protein  73.15 
 
 
115 aa  182  2e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010307 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2366  hypothetical protein  73.15 
 
 
115 aa  182  2e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00389248  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1850  hypothetical protein  73.15 
 
 
115 aa  182  2e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000478311  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01624  hypothetical protein  73.15 
 
 
115 aa  182  2e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.521708  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1986  glutaredoxin-like protein  73.15 
 
 
115 aa  182  2e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.235572  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1543  hypothetical protein  73.15 
 
 
115 aa  182  2e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.416029  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1603  hypothetical protein  73.15 
 
 
115 aa  182  2e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1529  hypothetical protein  73.15 
 
 
115 aa  182  2e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2386  hypothetical protein  74.07 
 
 
116 aa  182  2e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0290699  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1741  hypothetical protein  73.15 
 
 
115 aa  182  2e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  5.91153e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1910  hypothetical protein  73.15 
 
 
115 aa  182  2e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01614  hypothetical protein  73.15 
 
 
115 aa  182  2e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1544  hypothetical protein  73.15 
 
 
115 aa  182  2e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1793  hypothetical protein  71.3 
 
 
115 aa  181  4e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.169606  normal  0.0260358 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2670  hypothetical protein  72.22 
 
 
116 aa  179  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0262215  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1686  glutaredoxin-like protein  72.22 
 
 
114 aa  178  3e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1866  hypothetical protein  67.27 
 
 
116 aa  177  6e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.252998  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1758  hypothetical protein  67.27 
 
 
116 aa  177  6e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.25662e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2569  hypothetical protein  67.27 
 
 
116 aa  177  6e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0109727  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1859  putative glutaredoxin  73.33 
 
 
111 aa  176  7e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1718  hypothetical protein  69.44 
 
 
116 aa  176  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000856261  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2198  hypothetical protein  69.44 
 
 
115 aa  175  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390421  hitchhiker  5.02867e-06 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1396  glutaredoxin-like protein  71.43 
 
 
109 aa  175  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.420177  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2449  glutaredoxin-like protein  67.27 
 
 
112 aa  172  2e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.182264  normal  0.0446478 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1034  glutaredoxin-like protein  68.57 
 
 
108 aa  170  7e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000907202  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3475  glutaredoxin,-like protein  70.71 
 
 
116 aa  168  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2129  glutaredoxin-like protein  65.74 
 
 
112 aa  164  3e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.883675  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18650  hypothetical protein  66.67 
 
 
108 aa  164  3e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0667348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1614  hypothetical protein  66.67 
 
 
108 aa  164  3e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3388  glutaredoxin-like protein  65.38 
 
 
109 aa  158  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.459255  normal  0.239887 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2438  glutaredoxin-related protein  61.82 
 
 
110 aa  157  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  1.87955e-05  normal  0.0679264 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3339  glutaredoxin-like protein  61.9 
 
 
108 aa  156  7e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0384172  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14040  Glutaredoxin4 protein  61.9 
 
 
108 aa  155  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1081  glutaredoxin-related protein  64 
 
 
111 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.581257  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0086  glutaredoxin-related protein  58.72 
 
 
119 aa  150  6e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0938468  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1110  glutaredoxin-like protein  63 
 
 
111 aa  150  6e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1122  glutaredoxin-like protein  63.64 
 
 
152 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636525  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4524  glutaredoxin-like protein  63 
 
 
113 aa  150  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532221  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4331  glutaredoxin-like protein  62.63 
 
 
111 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.488621  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3898  glutaredoxin-like protein  58.65 
 
 
108 aa  148  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.713119 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4161  glutaredoxin-related protein  58.65 
 
 
108 aa  148  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3038  glutaredoxin-like protein  58.65 
 
 
115 aa  143  7e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2896  glutaredoxin-like protein  58.65 
 
 
115 aa  143  7e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0963  glutaredoxin-like protein  58.51 
 
 
111 aa  136  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  9.57456e-05 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2427  glutaredoxin-like protein  50.46 
 
 
110 aa  135  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17903  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1242  glutaredoxin-related protein  56.7 
 
 
116 aa  134  5e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.828915 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1150  glutaredoxin-like protein  56.7 
 
 
116 aa  134  5e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0596  glutaredoxin-like protein  50.93 
 
 
115 aa  132  1e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.097988  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0729  glutaredoxin-like protein  53.85 
 
 
111 aa  132  2e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2316  glutaredoxin-like protein  51.43 
 
 
129 aa  132  2e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102324  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1149  glutaredoxin-like protein  50 
 
 
112 aa  130  5e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2460  glutaredoxin-like protein  46.3 
 
 
109 aa  130  7e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0595  glutaredoxin-like protein  52.53 
 
 
109 aa  128  2e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0120135  hitchhiker  6.40079e-17 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0349  glutaredoxin-like protein  44.76 
 
 
109 aa  128  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.508433 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2078  glutaredoxin-related protein  47.57 
 
 
110 aa  125  2e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2499  glutaredoxin-like protein  50.49 
 
 
106 aa  123  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0245  glutaredoxin-like protein  53.33 
 
 
105 aa  122  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.254771  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2639  glutaredoxin-like protein  50.94 
 
 
106 aa  120  6e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.49425  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0697  glutaredoxin family protein  48.48 
 
 
99 aa  116  1e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000299958  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01315  putative glutaredoxin-like protein  44.66 
 
 
106 aa  116  1e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.359363  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2890  glutaredoxin-like protein  47.57 
 
 
103 aa  115  2e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.441106 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1480  glutaredoxin  47.47 
 
 
99 aa  115  2e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.516796  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0491  glutaredoxin-related protein  47 
 
 
107 aa  114  4e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.249105  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1945  glutaredoxin-related protein  46.08 
 
 
102 aa  113  7e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3616  putative glutaredoxin  46.08 
 
 
102 aa  113  7e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3592  putative glutaredoxin  46.08 
 
 
102 aa  113  7e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.703507  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0974  glutaredoxin-related protein  46.08 
 
 
102 aa  113  7e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104778  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0678  glutaredoxin-related protein  46.08 
 
 
102 aa  113  7e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0502  glutaredoxin-related protein  46.08 
 
 
102 aa  113  7e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3605  glutaredoxin-like protein  46.08 
 
 
102 aa  113  7e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51060  glutaredoxin-related protein  48.51 
 
 
109 aa  113  8e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0783867  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0591  glutaredoxin-like protein  47.12 
 
 
107 aa  113  9e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2647  glutaredoxin-like protein  47.17 
 
 
110 aa  113  1e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1374  glutaredoxin-like protein  45.63 
 
 
106 aa  113  1e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.431306  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2932  glutaredoxin-related protein  46.08 
 
 
102 aa  113  1e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3038  glutaredoxin-related protein  47.17 
 
 
110 aa  113  1e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2667  glutaredoxin-like protein  47.87 
 
 
115 aa  112  2e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.144494  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0480  glutaredoxin-like protein  46.6 
 
 
103 aa  112  2e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.505328 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>