More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1754 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1754  dithiobiotin synthetase  100 
 
 
246 aa  494  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.235022  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1798  dithiobiotin synthetase  98.37 
 
 
246 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121118  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1761  dithiobiotin synthetase  97.97 
 
 
246 aa  461  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2524  dithiobiotin synthetase  97.56 
 
 
246 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.161209  normal  0.3539 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2342  dithiobiotin synthetase  89.67 
 
 
247 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2516  dithiobiotin synthetase  70.29 
 
 
231 aa  345  3e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000238987 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2737  dithiobiotin synthetase  70.29 
 
 
231 aa  345  4e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2356  dithiobiotin synthetase  69.04 
 
 
231 aa  344  8.999999999999999e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2428  dithiobiotin synthetase  68.62 
 
 
231 aa  342  2e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0142166 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1804  dethiobiotin synthase  61.18 
 
 
221 aa  271  7e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.511205  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2773  dethiobiotin synthase  55.19 
 
 
226 aa  270  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0046697  hitchhiker  0.00857242 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1869  dethiobiotin synthase  57.87 
 
 
222 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000332608  decreased coverage  0.000000281099 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1722  dethiobiotin synthase  57.49 
 
 
237 aa  268  8e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000192281  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1441  dithiobiotin synthetase  58.58 
 
 
230 aa  258  8e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00254947  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1661  dithiobiotin synthetase  55.65 
 
 
231 aa  255  3e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1478  dithiobiotin synthetase  53.2 
 
 
236 aa  249  4e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4683  dithiobiotin synthetase  52.36 
 
 
226 aa  235  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.462604  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0498  dethiobiotin synthetase  51.48 
 
 
226 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.545472  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4836  dithiobiotin synthetase  51.72 
 
 
226 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.519377 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3135  histidinol dehydrogenase  47.9 
 
 
230 aa  227  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0392  dithiobiotin synthetase  50.64 
 
 
226 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5172  dithiobiotin synthetase  51.72 
 
 
226 aa  224  8e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0206613  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0396  dithiobiotin synthetase  49.36 
 
 
226 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.887363 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0366  dithiobiotin synthetase  50.21 
 
 
226 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.55843  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45930  dithiobiotin synthetase  50.63 
 
 
231 aa  221  7e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1163  dethiobiotin synthase  47.95 
 
 
237 aa  212  3.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4084  dithiobiotin synthetase  50.91 
 
 
228 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610971  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1921  dethiobiotin synthase  44.64 
 
 
235 aa  204  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0147663  decreased coverage  0.00139462 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01810  dithiobiotin synthetase  41.67 
 
 
227 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06570  dithiobiotin synthetase  50.21 
 
 
228 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803425  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1045  dethiobiotin synthetase  42.37 
 
 
242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  45.68 
 
 
228 aa  196  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3453  dethiobiotin synthase  48.62 
 
 
225 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003868  dethiobiotin synthetase  42.08 
 
 
228 aa  194  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0874118  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0604  dithiobiotin synthetase  50.21 
 
 
228 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  46.96 
 
 
225 aa  193  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  45.8 
 
 
226 aa  192  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  44.68 
 
 
226 aa  192  4e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  46.96 
 
 
225 aa  192  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  47.39 
 
 
225 aa  192  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  46.96 
 
 
225 aa  192  6e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  45.61 
 
 
230 aa  191  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  46.96 
 
 
225 aa  192  6e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02208  cobyrinic acid a,c-diamide synthase:dethiobiotin synthase  48.03 
 
 
233 aa  192  6e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.020926  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  46.96 
 
 
225 aa  192  6e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  45.61 
 
 
228 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  46.52 
 
 
225 aa  190  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  45.19 
 
 
228 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  46.52 
 
 
225 aa  190  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  46.52 
 
 
225 aa  190  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  45.19 
 
 
228 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0833  dithiobiotin synthetase  44.77 
 
 
230 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108766  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2753  dithiobiotin synthetase  46.12 
 
 
234 aa  187  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11733  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  44.44 
 
 
245 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  44.77 
 
 
240 aa  187  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2554  dethiobiotin synthase  43.7 
 
 
287 aa  187  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0309873  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  44.03 
 
 
240 aa  185  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  45.27 
 
 
238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  42.31 
 
 
243 aa  182  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1868  putative dithiobiotin synthetase  42.49 
 
 
222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218738  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1980  putative dithiobiotin synthetase  42.49 
 
 
222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0857  dithiobiotin synthetase  40 
 
 
227 aa  182  6e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  41.53 
 
 
227 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2284  dethiobiotin synthase  42.5 
 
 
223 aa  179  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.165561 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1508  dithiobiotin synthetase  41.1 
 
 
226 aa  177  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1895  putative dithiobiotin synthetase  41.84 
 
 
221 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2439  dethiobiotin synthase  42.06 
 
 
227 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0633  dithiobiotin synthetase  37.92 
 
 
238 aa  176  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000700922  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2132  putative dithiobiotin synthetase  39.42 
 
 
223 aa  175  5e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  43.78 
 
 
221 aa  174  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  41.87 
 
 
245 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  42.28 
 
 
247 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1920  putative dithiobiotin synthetase  39.91 
 
 
231 aa  165  5.9999999999999996e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2346  putative dithiobiotin synthetase  40.33 
 
 
221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.237745  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  40.93 
 
 
266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2045  putative dithiobiotin synthetase  40 
 
 
221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.154785  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  39.68 
 
 
239 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  39.82 
 
 
230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1580  dithiobiotin synthetase  42.73 
 
 
270 aa  162  7e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0294479  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0292  dethiobiotin synthase  41.74 
 
 
237 aa  161  7e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0765643  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1850  putative dithiobiotin synthetase  38.4 
 
 
231 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1600  putative dithiobiotin synthetase  38.4 
 
 
231 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  38.33 
 
 
226 aa  160  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1591  putative dithiobiotin synthetase  38.4 
 
 
231 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0571345 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0249  dithiobiotin synthetase  39.24 
 
 
225 aa  160  2e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1683  putative dithiobiotin synthetase  38.4 
 
 
231 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.809322  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1659  putative dithiobiotin synthetase  38.4 
 
 
231 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1637  dithiobiotin synthetase  42.27 
 
 
226 aa  159  4e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  42.08 
 
 
238 aa  158  7e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1799  putative dithiobiotin synthetase  39.21 
 
 
231 aa  157  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1608  putative dithiobiotin synthetase  39.21 
 
 
231 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1778  putative dithiobiotin synthetase  39.21 
 
 
231 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1373  dithiobiotin synthetase  40.93 
 
 
235 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.409918  normal  0.0708007 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0959  dethiobiotin synthase  41.1 
 
 
236 aa  157  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0323  dethiobiotin synthase  38.02 
 
 
227 aa  156  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0117307 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01562  predicted dethiobiotin synthetase  37.07 
 
 
231 aa  155  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2050  dethiobiotin synthase  37.07 
 
 
231 aa  155  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.583234  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2302  putative dithiobiotin synthetase  37.07 
 
 
231 aa  155  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0414413 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01552  hypothetical protein  37.07 
 
 
231 aa  155  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2037  putative dithiobiotin synthetase  37.07 
 
 
231 aa  155  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>