More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1736 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1779  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
289 aa  604  1e-172  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.49804e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1740  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
289 aa  604  1e-172  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.40538e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2544  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
289 aa  604  1e-172  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  3.20218e-09  hitchhiker  1.31905e-07 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1736  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
289 aa  604  1e-172  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  2.67219e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2446  OmpA/MotB domain-containing protein  93.08 
 
 
290 aa  572  1e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.91416e-06  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2539  OmpA/MotB domain-containing protein  92.73 
 
 
290 aa  569  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  5.3368e-07  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  92.39 
 
 
290 aa  567  1e-161  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  8.19929e-09  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1601  OmpA/MotB domain-containing protein  89.97 
 
 
289 aa  558  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  1.9607e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1851  OmpA/MotB domain-containing protein  74.05 
 
 
297 aa  475  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.46772e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2570  OmpA/MotB domain-containing protein  76.81 
 
 
289 aa  461  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.24837e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2738  OmpA/MotB domain-containing protein  72.66 
 
 
289 aa  459  1e-128  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00376202  hitchhiker  0.000469935 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1457  OmpA/MotB domain-containing protein  73.01 
 
 
289 aa  459  1e-128  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.298949  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1521  OmpA/MotB domain-containing protein  73.48 
 
 
286 aa  452  1e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227378  normal  0.710419 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1398  OmpA/MotB  67.47 
 
 
289 aa  434  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2092  OmpA/MotB  68.86 
 
 
289 aa  423  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.4464e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02741  sodium-type flagellar protein MotY  45.33 
 
 
290 aa  291  7e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3471  sodium-type flagellar protein MotY  45.45 
 
 
291 aa  288  8e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1400  OmpA/MotB  44.76 
 
 
287 aa  283  2e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000117865  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2753.2  sodium-type flagellar protein MotY  92.62 
 
 
122 aa  245  7e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002940  sodium-type flagellar protein MotY precursor  43.98 
 
 
293 aa  244  1e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  8.66037e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0529  sodium-type flagellar protein MotY  42.25 
 
 
294 aa  244  2e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  7.08227e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1863  sodium-type flagellar protein MotY precursor  41.03 
 
 
292 aa  241  1e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02990  hypothetical protein  41.7 
 
 
293 aa  237  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1532  OmpA/MotB domain-containing protein  36.11 
 
 
296 aa  182  6e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.975631  normal  0.253081 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2427  putative outer membrane protein  34.01 
 
 
322 aa  152  6e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.831688 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3034  hypothetical protein  29.41 
 
 
294 aa  135  8e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2504  OmpA/MotB domain-containing protein  29.17 
 
 
309 aa  133  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18720  OmpA family membrane protein  28.62 
 
 
321 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.746177  normal  0.130207 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2892  hypothetical protein  29.07 
 
 
294 aa  132  6e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1393  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 
315 aa  131  1e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.567288 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3893  OmpA/MotB  29.66 
 
 
300 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1621  outer membrane protein  27.88 
 
 
321 aa  127  2e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0517761  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4518  OmpA/MotB  27.68 
 
 
302 aa  118  1e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1128  OmpA/MotB domain-containing protein  26.64 
 
 
313 aa  114  2e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4156  sodium-type flagellar protein MotY, putative  28.85 
 
 
301 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.37097  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4325  OmpA/MotB domain-containing protein  26.99 
 
 
308 aa  113  4e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1087  OmpA family outer membrane protein  26.64 
 
 
317 aa  112  8e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.763305  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1116  OmpA/MotB domain-containing protein  27.34 
 
 
324 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001183  putative sodium-type flagellar protein MotY precursor  29.18 
 
 
339 aa  105  8e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1455  OmpA/MotB domain-containing protein  26.91 
 
 
324 aa  100  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.935476  normal  0.139769 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0080  hypothetical protein  25.9 
 
 
304 aa  89.7  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.580583  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04970  hypothetical protein  26.22 
 
 
350 aa  87  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2453  sodium-type flagellar protein MotY, putative  26.98 
 
 
280 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.230815  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0086  OmpA/MotB domain-containing protein  24.56 
 
 
303 aa  80.5  3e-14  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3567  OmpA/MotB domain-containing protein  30.71 
 
 
295 aa  80.1  4e-14  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  39 
 
 
464 aa  73.9  3e-12  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  37.72 
 
 
641 aa  73.6  4e-12  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 
459 aa  72  1e-11  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1412  OmpA/MotB domain-containing protein  23.17 
 
 
321 aa  72  1e-11  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.166227  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  31.75 
 
 
679 aa  70.5  3e-11  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  48.61 
 
 
226 aa  69.7  5e-11  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  31.43 
 
 
451 aa  69.7  6e-11  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  38.53 
 
 
890 aa  69.3  8e-11  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  38.18 
 
 
417 aa  68.2  1e-10  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  33.01 
 
 
224 aa  68.6  1e-10  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  45.07 
 
 
222 aa  68.6  1e-10  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  35.45 
 
 
261 aa  68.6  1e-10  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  35.96 
 
 
244 aa  68.6  1e-10  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  35.45 
 
 
261 aa  68.6  1e-10  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  43.24 
 
 
219 aa  67.4  2e-10  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 
210 aa  67.4  2e-10  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  2.6968e-08  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  40.82 
 
 
231 aa  67.8  2e-10  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  43.24 
 
 
218 aa  67  3e-10  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  42.7 
 
 
216 aa  67.4  3e-10  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 
217 aa  67  3e-10  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  42.7 
 
 
216 aa  67.4  3e-10  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  43.24 
 
 
218 aa  67  3e-10  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  34.09 
 
 
205 aa  67.4  3e-10  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.25 
 
 
542 aa  66.6  4e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1877  OmpA/MotB  28.57 
 
 
434 aa  66.6  4e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0777893 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  41.56 
 
 
214 aa  67  4e-10  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  3.03101e-06 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02060  hypothetical protein  45.07 
 
 
219 aa  67  4e-10  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  32.28 
 
 
670 aa  66.6  4e-10  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  41.89 
 
 
219 aa  66.6  4e-10  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  37.61 
 
 
223 aa  66.2  5e-10  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  35.85 
 
 
294 aa  66.6  5e-10  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  41.56 
 
 
242 aa  65.9  7e-10  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  38.78 
 
 
230 aa  66.2  7e-10  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  38.78 
 
 
230 aa  66.2  7e-10  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  5.54839e-06 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 
264 aa  65.9  7e-10  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  5.60377e-06 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3984  ompA family protein  31.78 
 
 
278 aa  65.9  7e-10  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  38.78 
 
 
230 aa  65.9  8e-10  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  37.74 
 
 
509 aa  65.5  9e-10  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  35.58 
 
 
537 aa  65.9  9e-10  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  33.02 
 
 
656 aa  65.9  9e-10  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  43.24 
 
 
219 aa  65.1  1e-09  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  41.56 
 
 
212 aa  65.1  1e-09  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  32.06 
 
 
517 aa  65.1  1e-09  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  35.45 
 
 
260 aa  65.1  1e-09  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  35.77 
 
 
224 aa  64.7  2e-09  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.06819e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  34.55 
 
 
261 aa  64.3  2e-09  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  37.89 
 
 
330 aa  64.7  2e-09  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  4.10155e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  37.17 
 
 
320 aa  64.3  2e-09  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  42.47 
 
 
320 aa  64.7  2e-09  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  33.65 
 
 
229 aa  64.3  2e-09  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  39.33 
 
 
223 aa  64.3  2e-09  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  31.82 
 
 
694 aa  64.3  2e-09  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  45.07 
 
 
229 aa  64.3  2e-09  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  7.93596e-05 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 
543 aa  64.7  2e-09  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  42.22 
 
 
227 aa  64.7  2e-09  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>