215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1735 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1735  ribonuclease T  100 
 
 
223 aa  461  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  7.54481e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1778  ribonuclease T  99.55 
 
 
223 aa  459  1e-128  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  7.46493e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1739  ribonuclease T  99.55 
 
 
223 aa  458  1e-128  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  7.63816e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2545  ribonuclease T  99.55 
 
 
223 aa  458  1e-128  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.25683e-09  hitchhiker  1.75262e-08 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2755  ribonuclease T  92.79 
 
 
222 aa  429  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2540  ribonuclease T  93.24 
 
 
222 aa  428  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.00926e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2447  ribonuclease T  92.79 
 
 
222 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.16461e-06  normal  0.258904 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2375  ribonuclease T  92.79 
 
 
222 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  3.51163e-09  normal  0.329752 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1600  ribonuclease T  91.93 
 
 
224 aa  404  1e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  7.38709e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1850  ribonuclease T  85.65 
 
 
223 aa  400  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  5.91528e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2739  ribonuclease T  85.78 
 
 
222 aa  397  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000161836  hitchhiker  0.000451945 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1397  ribonuclease T  84.68 
 
 
226 aa  390  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.20149e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1520  ribonuclease T  85.12 
 
 
257 aa  388  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0577175  normal  0.681349 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1456  ribonuclease T  84.68 
 
 
221 aa  384  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.527776  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2093  ribonuclease T  80.27 
 
 
258 aa  381  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  1.54544e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2571  ribonuclease T  81 
 
 
232 aa  379  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  7.96721e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1759  ribonuclease T  69.77 
 
 
215 aa  318  4e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  5.23182e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1868  ribonuclease T  69.77 
 
 
226 aa  318  6e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.216303  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1719  ribonuclease T  71.77 
 
 
226 aa  317  7e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00130888  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2568  ribonuclease T  70.42 
 
 
226 aa  317  1e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000324213  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002938  ribonuclease T  72.51 
 
 
214 aa  316  2e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  3.94372e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2199  ribonuclease T  69.86 
 
 
226 aa  313  1e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.595371  hitchhiker  5.81969e-06 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2385  ribonuclease T  69.86 
 
 
223 aa  313  1e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0167921  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2669  ribonuclease T  67.42 
 
 
223 aa  313  1e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0134256  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1687  ribonuclease T  69.27 
 
 
225 aa  313  1e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1794  ribonuclease T  69.86 
 
 
224 aa  308  3e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.109049  normal  0.0279286 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02991  ribonuclease T  71.56 
 
 
214 aa  308  5e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2364  ribonuclease T  69.63 
 
 
215 aa  306  1e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.087389  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1729  ribonuclease T  69.63 
 
 
215 aa  306  1e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1977  ribonuclease T  69.63 
 
 
215 aa  306  1e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170755  hitchhiker  0.00113879 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0527  ribonuclease T  71.09 
 
 
243 aa  306  1e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.01499e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1546  ribonuclease T  69.63 
 
 
215 aa  306  1e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.49714  normal  0.657229 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3473  ribonuclease T  69.05 
 
 
231 aa  306  1e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01612  hypothetical protein  69.63 
 
 
215 aa  306  1e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0578049  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1844  ribonuclease T  69.63 
 
 
215 aa  306  1e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01622  ribonuclease T  69.63 
 
 
215 aa  306  1e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0540348  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1988  ribonuclease T  69.63 
 
 
215 aa  307  1e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  4.8723e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1863  ribonuclease T  69.63 
 
 
215 aa  306  1e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.135732  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1544  ribonuclease T  69.38 
 
 
215 aa  304  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.554445  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1604  ribonuclease T  69.38 
 
 
215 aa  304  8e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1909  ribonuclease T  69.38 
 
 
215 aa  304  8e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1531  ribonuclease T  69.38 
 
 
215 aa  304  8e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.81711  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1740  ribonuclease T  69.38 
 
 
215 aa  304  8e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00194443  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1862  ribonuclease T  66.82 
 
 
221 aa  300  1e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.31939  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02742  ribonuclease T  65.5 
 
 
210 aa  290  9e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0085  ribonuclease T  65.22 
 
 
218 aa  289  3e-77  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.169544  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2450  ribonuclease T  64.39 
 
 
207 aa  287  7e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.299626  normal  0.086285 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0501  ribonuclease T  63.46 
 
 
218 aa  284  7e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1399  ribonuclease T  63.32 
 
 
211 aa  278  5e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0415119  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1531  ribonuclease T  61.14 
 
 
222 aa  271  5e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.197134  normal  0.241323 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4520  ribonuclease T  64.62 
 
 
224 aa  268  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.02449 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1619  ribonuclease T  63.13 
 
 
224 aa  268  6e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79735  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18700  ribonuclease T  63.13 
 
 
224 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.145132 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1391  ribonuclease T  65.13 
 
 
224 aa  266  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.396287 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2506  ribonuclease T  61.72 
 
 
221 aa  265  3e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2429  ribonuclease T  61.84 
 
 
231 aa  265  3e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.759564  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3895  ribonuclease T  64.1 
 
 
225 aa  264  6e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14060  ribonuclease T  62.12 
 
 
202 aa  263  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4158  ribonuclease T  63.59 
 
 
225 aa  261  6e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1126  ribonuclease T  63.08 
 
 
224 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2128  ribonuclease T  60.37 
 
 
221 aa  260  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1114  ribonuclease T  62.56 
 
 
224 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1085  ribonuclease T  63.08 
 
 
203 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106932  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4327  ribonuclease T  62.56 
 
 
224 aa  257  9e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2458  ribonuclease T  52.15 
 
 
216 aa  241  8e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2268  ribonuclease T  51.98 
 
 
216 aa  235  4e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.862019  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1633  ribonuclease T  55.72 
 
 
239 aa  229  2e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  3.60038e-15  hitchhiker  0.000696557 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1866  ribonuclease T  54.73 
 
 
246 aa  226  2e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00131644  normal  0.0390394 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1661  ribonuclease T  53.92 
 
 
274 aa  222  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  1.09903e-09  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0597  ribonuclease T  55.96 
 
 
207 aa  221  9e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0238382  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0728  ribonuclease T  52 
 
 
226 aa  217  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2077  ribonuclease T  53.33 
 
 
209 aa  216  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3036  ribonuclease T  51.76 
 
 
207 aa  214  1e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2894  ribonuclease T  51.26 
 
 
207 aa  212  4e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0350  ribonuclease T  46.41 
 
 
228 aa  210  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.42903 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1302  ribonuclease T  51.56 
 
 
194 aa  201  8e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0251  ribonuclease T  55.73 
 
 
201 aa  200  2e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0427  ribonuclease T  55.73 
 
 
201 aa  200  2e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0923721  hitchhiker  4.15989e-10 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0300  ribonuclease T  50.26 
 
 
224 aa  197  1e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0645  ribonuclease T  49.25 
 
 
241 aa  191  8e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.677543  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00538  ribonuclease T  46.86 
 
 
211 aa  186  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0528077  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1287  ribonuclease T  46.88 
 
 
210 aa  181  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1351  ribonuclease T  46.88 
 
 
210 aa  181  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0135397  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3213  DNA polymerase III subunit epsilon  31.58 
 
 
242 aa  66.6  3e-10  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0006  DNA polymerase III subunit epsilon  30.39 
 
 
236 aa  62.8  4e-09  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0849  DNA polymerase III subunit epsilon  30.43 
 
 
231 aa  60.8  1e-08  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.577786  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3939  DNA polymerase III subunit epsilon  25.74 
 
 
245 aa  60.8  2e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.945097  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  29.5 
 
 
1440 aa  60.8  2e-08  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4265  DNA polymerase III subunit epsilon  26.73 
 
 
240 aa  60.5  2e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4426  DNA polymerase III subunit epsilon  27.66 
 
 
244 aa  58.2  9e-08  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  4.36585e-05  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  27.96 
 
 
1436 aa  58.2  1e-07  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1173  DNA polymerase III subunit epsilon  27.66 
 
 
244 aa  57.8  1e-07  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  normal  0.138843 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1751  DNA polymerase III subunit epsilon  28.72 
 
 
242 aa  57.8  1e-07  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2073  DNA polymerase III subunit epsilon  28.19 
 
 
242 aa  57.4  2e-07  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  30.11 
 
 
1438 aa  57  2e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3482  DNA polymerase III subunit epsilon  28.18 
 
 
242 aa  57.4  2e-07  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  30.11 
 
 
1438 aa  57  2e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  27 
 
 
1402 aa  57  2e-07  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1161  DNA polymerase III subunit epsilon  27.66 
 
 
244 aa  57  2e-07  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1465  DNA polymerase III subunit epsilon  26.4 
 
 
253 aa  56.2  4e-07  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>