More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1724 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  59.3 
 
 
711 aa  834  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  83.56 
 
 
742 aa  1281  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  1.85534e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
748 aa  1547  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  3.12172e-05  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  98.38 
 
 
749 aa  1512  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  83.94 
 
 
738 aa  1290  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  8.35907e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
748 aa  1547  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  7.00289e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  95.95 
 
 
740 aa  1474  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  83.71 
 
 
742 aa  1291  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0391  TonB-dependent siderophore receptor  62.65 
 
 
712 aa  875  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196206  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  90.15 
 
 
737 aa  1383  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01148  TonB-dependent outer membrane Receptor  42.72 
 
 
708 aa  517  1e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0846293  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2461  TonB-dependent siderophore receptor  41.07 
 
 
713 aa  504  1e-141  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1527  TonB-dependent siderophore receptor  39.62 
 
 
714 aa  504  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.698269  normal  0.163231 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  28.65 
 
 
814 aa  258  3e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  30.62 
 
 
724 aa  250  5e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  28.42 
 
 
710 aa  250  6e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  28.42 
 
 
770 aa  250  6e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  30.34 
 
 
723 aa  249  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  31.78 
 
 
714 aa  249  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  30.68 
 
 
720 aa  249  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  30.68 
 
 
720 aa  246  9e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  30.2 
 
 
724 aa  245  2e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  28.69 
 
 
710 aa  245  2e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  30.42 
 
 
720 aa  244  5e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  30.26 
 
 
720 aa  242  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 
715 aa  241  5e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  28.94 
 
 
712 aa  238  4e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  27.15 
 
 
824 aa  233  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  31.19 
 
 
817 aa  233  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  29.28 
 
 
850 aa  231  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  27.35 
 
 
792 aa  229  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 
757 aa  225  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  28.28 
 
 
689 aa  224  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  29.04 
 
 
701 aa  224  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  29.18 
 
 
701 aa  224  5e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  29.18 
 
 
701 aa  224  5e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  29.14 
 
 
721 aa  224  6e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  28.44 
 
 
719 aa  224  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  27.86 
 
 
707 aa  223  1e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  28.74 
 
 
707 aa  220  9e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3331  TonB-dependent siderophore receptor  27.41 
 
 
766 aa  219  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153274  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  29.13 
 
 
701 aa  219  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4483  TonB-dependent siderophore receptor  29.88 
 
 
712 aa  219  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.88322e-05  hitchhiker  1.71512e-05 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  28.99 
 
 
701 aa  216  1e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4743  TonB-dependent receptor, putative  29.58 
 
 
690 aa  216  1e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  27.25 
 
 
694 aa  216  1e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3953  TonB-dependent siderophore receptor  28.59 
 
 
701 aa  216  2e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  7.31032e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  26.88 
 
 
722 aa  215  2e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.67 
 
 
706 aa  216  2e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  29.32 
 
 
701 aa  215  3e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3641  TonB-dependent receptor, putative  29.14 
 
 
697 aa  214  4e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  7.83326e-06  normal  0.0764781 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  27.66 
 
 
860 aa  214  4e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  2.75089e-07 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  28.31 
 
 
724 aa  213  8e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  27.02 
 
 
738 aa  213  8e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  27.06 
 
 
715 aa  213  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  28.63 
 
 
815 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  28.16 
 
 
696 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  27.76 
 
 
696 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  26.97 
 
 
789 aa  211  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  28.32 
 
 
825 aa  210  8e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  27.62 
 
 
859 aa  210  9e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  28.45 
 
 
809 aa  210  9e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4236  TonB-dependent siderophore receptor  28.39 
 
 
710 aa  210  9e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  6.95536e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  28.32 
 
 
825 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  30.23 
 
 
796 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  26.52 
 
 
722 aa  209  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  28.51 
 
 
689 aa  208  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3841  TonB-dependent siderophore receptor  29.78 
 
 
712 aa  208  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  2.49714e-05  hitchhiker  0.000312087 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  28.96 
 
 
703 aa  207  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  26.01 
 
 
695 aa  207  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  27.42 
 
 
734 aa  207  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.43 
 
 
703 aa  207  8e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  27.98 
 
 
709 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4307  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 
706 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  2.34699e-05  hitchhiker  2.25287e-10 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  25.95 
 
 
706 aa  205  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  25.95 
 
 
706 aa  205  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  27.93 
 
 
708 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4363  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 
706 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  3.23777e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  27.11 
 
 
708 aa  205  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  28.22 
 
 
705 aa  204  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  27.11 
 
 
828 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4894  TonB-dependent siderophore receptor  28.46 
 
 
714 aa  204  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142345  normal  0.811526 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  26.87 
 
 
829 aa  203  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  27.75 
 
 
701 aa  203  9e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4014  TonB-dependent siderophore receptor  27.97 
 
 
709 aa  202  1e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00017833  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  27.3 
 
 
802 aa  203  1e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4362  TonB-dependent siderophore receptor  28.28 
 
 
706 aa  203  1e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.3504e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  28.51 
 
 
703 aa  202  2e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  28.3 
 
 
702 aa  202  2e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 
794 aa  202  2e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  28.3 
 
 
702 aa  202  2e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  27.73 
 
 
692 aa  202  2e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3922  TonB-dependent siderophore receptor  27.97 
 
 
709 aa  202  2e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal  0.0397715 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  26.54 
 
 
703 aa  202  2e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  27.67 
 
 
711 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4504  TonB-dependent siderophore receptor  27.54 
 
 
703 aa  202  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000141313  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  27.09 
 
 
821 aa  201  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  28.39 
 
 
732 aa  202  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.02 
 
 
711 aa  201  4e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 
820 aa  201  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  2.2757e-05 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>