More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1706 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_1231  TonB-dependent receptor  67.5 
 
 
521 aa  698  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1709  sulphate transporter  99.04 
 
 
519 aa  1035  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  3.77165e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2658  sulphate transporter  99.23 
 
 
519 aa  1036  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  6.74443e-06  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1592  sulphate transporter  86.13 
 
 
519 aa  876  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.795484  normal  0.0437766 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2232  putative sulfate transporter  75 
 
 
515 aa  736  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2303  sulphate transporter  89.79 
 
 
519 aa  952  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1617  sulfate permease family protein  73.11 
 
 
521 aa  719  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0125947  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2031  sulphate transporter  82.24 
 
 
518 aa  829  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.62655  normal  0.79554 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02920  hypothetical protein  74.47 
 
 
519 aa  741  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1706  sulphate transporter  100 
 
 
519 aa  1041  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.6912e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1749  sulphate transporter  99.23 
 
 
519 aa  1036  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  3.11132e-05  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2505  sulphate transporter  84.59 
 
 
519 aa  856  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2635  sulphate transporter  84.75 
 
 
518 aa  839  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  7.40978e-07  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0608  sulphate transporter  70.77 
 
 
521 aa  714  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000167283  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1315  sulphate transporter  69.87 
 
 
520 aa  705  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03661  Sulfate permease family protein  70 
 
 
521 aa  715  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002987  sulfate permease  75.9 
 
 
504 aa  731  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1080  sulphate transporter  64.95 
 
 
540 aa  665  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.610745  normal  0.0982504 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2406  sulphate transporter  91.91 
 
 
525 aa  912  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.181309  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2568  sulphate transporter  91.52 
 
 
519 aa  911  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.612653  normal  0.477584 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4141  sulfate permease family protein  69.25 
 
 
509 aa  700  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.284646  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2476  sulphate transporter  91.52 
 
 
525 aa  887  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1990  sulphate transporter  82.82 
 
 
518 aa  834  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.638858  normal  0.0857546 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0005  sulphate transporter  61.39 
 
 
511 aa  623  1e-177  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2208  sulphate transporter  60.5 
 
 
512 aa  605  1e-172  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1261  sulphate transporter  60.47 
 
 
515 aa  594  1e-168  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1105  sulphate transporter  57.63 
 
 
541 aa  581  1e-165  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0394  sulphate transporter  61.07 
 
 
512 aa  577  1e-163  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1689  sulphate transporter  58.25 
 
 
539 aa  576  1e-163  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3208  sulphate transporter  61.37 
 
 
540 aa  573  1e-162  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4452  sulphate transporter  54.26 
 
 
512 aa  570  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248248  normal  0.0871975 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0911  sulphate transporter  58.06 
 
 
539 aa  571  1e-161  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.791463  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2067  sulfate transporter  61.07 
 
 
534 aa  566  1e-160  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.701494  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0223  sulphate transporter  58.06 
 
 
539 aa  559  1e-158  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.836452  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1838  sulphate transporter  53.8 
 
 
509 aa  552  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1650  sulphate transporter  52.42 
 
 
511 aa  546  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12953  Sulfate permease family protein  57.92 
 
 
509 aa  546  1e-154  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.215491  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1533  sulphate transporter  54.08 
 
 
525 aa  540  1e-152  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2681  sulphate transporter  53.63 
 
 
504 aa  536  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.529175 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0671  sulfate transporter  52.28 
 
 
510 aa  531  1e-150  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.045325  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2321  sulphate transporter  61.78 
 
 
536 aa  524  1e-147  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4452  sulphate transporter  53.81 
 
 
495 aa  518  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000256302  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1983  sulphate transporter  49.9 
 
 
509 aa  509  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0343473 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3363  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:sulphate transporter  54.9 
 
 
481 aa  511  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3557  sulphate transporter  55.67 
 
 
481 aa  507  1e-142  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.179544 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3386  sulphate transporter  53.36 
 
 
480 aa  506  1e-142  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3685  sulphate transporter  53.77 
 
 
480 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0439224  normal  0.0112411 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1752  sulphate transporter  54.38 
 
 
480 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.516323  normal  0.0556997 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3593  sulfate permease family protein  53.67 
 
 
481 aa  498  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41950  sulphate transporter  55.51 
 
 
481 aa  488  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32829  SulP family transporter: sulfate; sulfate transporter of the Major Facilitator Superfamily (MFS)  51.63 
 
 
509 aa  461  1e-128  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0549  sulphate transporter  46.99 
 
 
483 aa  419  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2200  sulfate permease  44.51 
 
 
487 aa  410  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4649  sulfate permease family protein  44.97 
 
 
483 aa  407  1e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000779975  unclonable  1.77501e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0567  sulphate transporter  44.97 
 
 
492 aa  406  1e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0689  sulfate permease family protein  44.58 
 
 
483 aa  404  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0381157  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0564  sulfate transporter  45.76 
 
 
483 aa  403  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0031948  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0565  sulfate transporter  45.76 
 
 
483 aa  403  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4197  antisigma-factor antagonist, STAS  44.33 
 
 
496 aa  399  1e-110  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.291756  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0782  sulfate permease family protein  45.31 
 
 
483 aa  400  1e-110  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0653  sulfate permease family protein  45.56 
 
 
483 aa  399  1e-110  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0710  sulfate permease family protein  45.56 
 
 
483 aa  402  1e-110  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.152209 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0621  sulfate permease family protein  45.56 
 
 
483 aa  399  1e-110  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.822382  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0226  sulphate transporter  45.59 
 
 
484 aa  397  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660997  normal  0.925755 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0851  sulphate transporter  44.6 
 
 
502 aa  395  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.819336  normal  0.625423 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3460  UspA domain-containing protein  44.74 
 
 
496 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.833239  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0721  sulfate permease family protein  45.17 
 
 
483 aa  398  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3036  sulphate transporter  43.85 
 
 
496 aa  393  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3344  sulphate transporter  44.33 
 
 
496 aa  393  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5067  sulfate permease  43.09 
 
 
496 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4143  sulphate transporter  44.47 
 
 
496 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.508442  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2041  SulP family sulfate permease  45.14 
 
 
499 aa  391  1e-107  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0175  sulphate transporter  44.74 
 
 
500 aa  390  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.672348  normal  0.30485 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4257  antisigma-factor antagonist STAS  44.67 
 
 
496 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2773  sulphate transporter  44.98 
 
 
499 aa  386  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2344  sulphate transporter  44.33 
 
 
499 aa  387  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4600  sulfate transporter  43.26 
 
 
492 aa  385  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000140835  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4472  sulfate transporter  43.26 
 
 
492 aa  385  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0760011  normal  0.0111943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2669  putative sulfate transporter  44.02 
 
 
495 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0780  sulphate transporter  43.92 
 
 
494 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2563  sulfate transporter  42.74 
 
 
495 aa  376  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.542829  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4067  sulphate transporter  44.72 
 
 
502 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.124032  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31380  putative sulfate transporter  42.6 
 
 
495 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.114535  hitchhiker  1.46923e-13 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1853  sulphate transporter  42.47 
 
 
496 aa  372  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.770429  hitchhiker  0.00215909 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5170  sulphate transporter  42.19 
 
 
495 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1167  sulphate transporter  42.86 
 
 
496 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.422162  normal  0.0121281 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0945  sulfate transporter  42.28 
 
 
495 aa  365  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0235468  normal  0.511838 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0183  putative sulfate transporter  41.87 
 
 
495 aa  365  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3936  sulphate transporter  45.29 
 
 
501 aa  365  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.529754  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2764  sulphate transporter  42.2 
 
 
499 aa  366  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3643  sulphate transporter  45.29 
 
 
501 aa  364  2e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5890  sulfate permease  43.1 
 
 
493 aa  362  1e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401805  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0019  sulphate transporter  42.2 
 
 
514 aa  359  6e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.32634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3926  sulphate transporter  44.47 
 
 
492 aa  358  1e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0884886  normal  0.213644 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4351  sulphate transporter  41.39 
 
 
496 aa  357  2e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3234  sulfate permease family protein  42.6 
 
 
495 aa  355  8e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2102  sulphate transporter  44.24 
 
 
495 aa  354  2e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0374  sulphate transporter  44.01 
 
 
498 aa  353  3e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3086  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:sulphate transporter  42.6 
 
 
495 aa  353  4e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0024  sulfate permease family protein  40.56 
 
 
483 aa  353  5e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>