More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1659 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_1766  signal transduction histidine kinase, LytS  79.71 
 
 
558 aa  903  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.420125  hitchhiker  0.00747728 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2328  signal transduction histidine kinase, LytS  77.2 
 
 
565 aa  877  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0659282  normal  0.34431 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1674  signal transduction histidine kinase, LytS  99.47 
 
 
565 aa  1150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0178726  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0866  sensor histidine kinase  57.66 
 
 
561 aa  641  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0956  signal transduction histidine kinase, LytS  58.62 
 
 
563 aa  647  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324121  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1282  signal transduction histidine kinase, LytS  79.4 
 
 
569 aa  910  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0211527 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2593  signal transduction histidine kinase, LytS  93.74 
 
 
560 aa  1049  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0091271  hitchhiker  0.0052142 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02013  hypothetical protein  58.02 
 
 
561 aa  645  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2433  signal transduction histidine kinase, LytS  80.51 
 
 
558 aa  863  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.618184  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2501  signal transduction histidine kinase, LytS  93.2 
 
 
560 aa  1015  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.443565  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2431  signal transduction histidine kinase, LytS  93.2 
 
 
560 aa  1015  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000324417  normal  0.0100076 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0222  signal transduction histidine kinase, LytS  57.3 
 
 
561 aa  649  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0958  signal transduction histidine kinase, LytS  58.05 
 
 
563 aa  637  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  60.65 
 
 
572 aa  706  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1084  histidine kinase internal region  54.41 
 
 
575 aa  635  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0370265  normal  0.975996 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1549  signal transduction histidine kinase, LytS  92.82 
 
 
560 aa  1031  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0225  hypothetical protein  58.05 
 
 
558 aa  679  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1659  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 
565 aa  1156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.13246e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0918  sensor histidine kinase  58.2 
 
 
561 aa  647  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.817517 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1521  signal transduction histidine kinase, LytS  58.02 
 
 
561 aa  645  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0146  signal transduction histidine kinase, LytS  58.26 
 
 
565 aa  654  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889074  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4117  sensor histidine kinase  58.08 
 
 
565 aa  653  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.645201 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1319  membrane receptor, histidine kinase  60.18 
 
 
560 aa  672  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3113  sensor histidine kinase  58.02 
 
 
561 aa  641  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2684  signal transduction histidine kinase, LytS  99.82 
 
 
565 aa  1157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.287497  hitchhiker  0.00116896 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1696  signal transduction histidine kinase, LytS  99.82 
 
 
565 aa  1157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0311025  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1480  signal transduction histidine kinase, LytS  77.8 
 
 
557 aa  887  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336148  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2882  signal transduction histidine kinase, LytS  82.07 
 
 
558 aa  920  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0010106  unclonable  6.62994e-11 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2414  sensor histidine kinase  58.02 
 
 
561 aa  645  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2260  sensor histidine kinase  58.02 
 
 
561 aa  645  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00985  hypothetical protein  55.52 
 
 
556 aa  642  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4007  sensor histidine kinase  57.89 
 
 
565 aa  654  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2453  histidine kinase internal protein  58.83 
 
 
568 aa  640  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278514  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2822  sensor histidine kinase  92.67 
 
 
560 aa  1029  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0377  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  58.56 
 
 
576 aa  665  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2094  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase internal region:5TM Receptors of the LytS-YhcK type, transmembrane region  55.78 
 
 
577 aa  635  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004413  autolysin sensor kinase  55.15 
 
 
556 aa  635  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  60.57 
 
 
572 aa  709  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1532  signal transduction histidine kinase, LytS  58.02 
 
 
561 aa  645  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.363202  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02055  predicted sensory kinase in two-component system with YehT  58.02 
 
 
561 aa  645  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2305  sensor histidine kinase  57.94 
 
 
561 aa  634  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4588  signal transduction histidine kinase, LytS  58.23 
 
 
561 aa  632  1e-180  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2398  sensor histidine kinase  57.94 
 
 
561 aa  634  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79648  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2394  sensor histidine kinase  57.94 
 
 
561 aa  634  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764867  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2349  sensor histidine kinase  57.94 
 
 
561 aa  634  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896071  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2506  sensor histidine kinase  57.94 
 
 
561 aa  631  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454206  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2724  signal transduction histidine kinase, LytS  57.58 
 
 
562 aa  630  1e-179  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3342  signal transduction histidine kinase, LytS  56.94 
 
 
556 aa  619  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.891854 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0276  signal transduction histidine kinase, LytS  55.41 
 
 
561 aa  592  1e-168  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1441  signal transduction histidine kinase, LytS  49.37 
 
 
559 aa  531  1e-149  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645903  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3061  signal transduction histidine kinase, LytS  47.29 
 
 
560 aa  512  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3169  signal transduction histidine kinase, LytS  47.11 
 
 
560 aa  508  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3417  signal transduction histidine kinase, LytS  46.59 
 
 
559 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.23462  normal  0.076956 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  36.65 
 
 
576 aa  387  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  37.81 
 
 
578 aa  385  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.4237e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  37.97 
 
 
572 aa  374  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  34.79 
 
 
576 aa  344  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2958  signal transduction histidine kinase, LytS  37.35 
 
 
568 aa  343  4e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.177996  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2792  signal transduction histidine kinase, LytS  33.63 
 
 
564 aa  337  4e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  2.75265e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0160  ATP-binding region, ATPase-like  34.16 
 
 
567 aa  321  3e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  32.98 
 
 
568 aa  318  2e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  32.8 
 
 
580 aa  313  6e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3959  signal transduction histidine kinase, LytS  32.42 
 
 
591 aa  302  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5566  sensor histidine kinase LytS  33.05 
 
 
589 aa  301  3e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5123  sensor histidine kinase  33.05 
 
 
589 aa  300  4e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5138  sensor histidine kinase  33.05 
 
 
589 aa  300  4e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5537  sensor histidine kinase LytS  33.05 
 
 
589 aa  300  4e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5692  sensor histidine kinase LytS  33.05 
 
 
589 aa  300  4e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5296  sensor histidine kinase LytS  33.05 
 
 
589 aa  300  4e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1017  sensor histidine kinase, putative  33.84 
 
 
579 aa  300  7e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5235  signal transduction histidine kinase, LytS  32.53 
 
 
589 aa  298  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5622  sensor histidine kinase LytS  32.87 
 
 
589 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5574  sensor histidine kinase LytS  32.53 
 
 
589 aa  295  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1225  signal transduction histidine kinase, LytS  30.47 
 
 
603 aa  285  1e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.247489 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5383  sensor histidine kinase LytS  34.84 
 
 
522 aa  285  1e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.498572  normal  0.326696 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0903  signal transduction histidine kinase, LytS  31.98 
 
 
587 aa  283  6e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0182  sensor histidine kinase, putative  32.12 
 
 
581 aa  273  6e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0245  signal transduction histidine kinase, LytS  30.56 
 
 
584 aa  266  9e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0251  5TM Receptors of the LytS-YhcK type transmembrane region  30.56 
 
 
584 aa  266  9e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0115  signal transduction histidine kinase, LytS  30.32 
 
 
552 aa  265  1e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.368367  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0884  membrane signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 
579 aa  266  1e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3404  signal transduction histidine kinase, LytS  29.39 
 
 
563 aa  263  7e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.823402  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2024  sensor histidine kinase LytS  30.52 
 
 
591 aa  258  2e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  30.07 
 
 
557 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2444  signal transduction histidine kinase, LytS  29.96 
 
 
566 aa  248  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2170  signal transduction histidine kinase, LytS  29.89 
 
 
581 aa  249  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  30.07 
 
 
557 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  1.26428e-07 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  30.07 
 
 
557 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0059  signal transduction histidine kinase, LytS  30.07 
 
 
557 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.996795  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0058  signal transduction histidine kinase, LytS  30.07 
 
 
557 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  35.41 
 
 
450 aa  243  6e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4300  signal transduction histidine kinase, LytS  29.89 
 
 
557 aa  243  8e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131803  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2358  signal transduction histidine kinase, LytS  29.49 
 
 
566 aa  242  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551334  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  33.89 
 
 
465 aa  242  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1878  signal transduction histidine kinase, LytS  29.52 
 
 
581 aa  239  7e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.770711  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  36.99 
 
 
446 aa  239  9e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02290  predicted sensory kinase in two-component system with YpdB  28.91 
 
 
565 aa  237  4e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  28.91 
 
 
565 aa  237  4e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3612  sensor histidine kinase  28.97 
 
 
559 aa  237  4e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1289  signal transduction histidine kinase, LytS  28.97 
 
 
559 aa  237  4e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>