101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1578 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  98.92 
 
 
650 aa  1330  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  7.31399e-07 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  52.59 
 
 
653 aa  689  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2510  decaheme cytochrome c  64.08 
 
 
655 aa  829  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178218  hitchhiker  0.000666167 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  92.15 
 
 
650 aa  1254  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  65.86 
 
 
656 aa  918  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  99.23 
 
 
650 aa  1333  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  2.35795e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  64.29 
 
 
663 aa  863  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  2.54716e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  99.54 
 
 
650 aa  1334  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  91.08 
 
 
650 aa  1242  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  100 
 
 
650 aa  1340  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.05402e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1525  decaheme cytochrome c  53.65 
 
 
660 aa  649  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  50.51 
 
 
667 aa  622  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.045e-05  hitchhiker  6.06277e-06 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2525  decaheme cytochrome c  49.56 
 
 
656 aa  603  1e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  8.37992e-05  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  49.28 
 
 
671 aa  583  1e-165  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2698  decaheme cytochrome c  46.91 
 
 
671 aa  541  1e-152  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0681671  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  33.58 
 
 
639 aa  330  4e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  34.11 
 
 
639 aa  327  5e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  33.54 
 
 
639 aa  320  6e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  33.33 
 
 
639 aa  319  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  34.4 
 
 
639 aa  317  5e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  32.58 
 
 
639 aa  310  7e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  32.43 
 
 
639 aa  309  1e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  32.92 
 
 
639 aa  308  2e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  4.44921e-05 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  32.43 
 
 
639 aa  306  8e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.58979e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  34.3 
 
 
640 aa  306  8e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  33.59 
 
 
639 aa  291  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  31.72 
 
 
646 aa  272  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4048  hypothetical protein  27.76 
 
 
764 aa  196  9e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  34.04 
 
 
785 aa  174  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.724503 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  26.33 
 
 
724 aa  139  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  23.79 
 
 
722 aa  129  1e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  25.2 
 
 
729 aa  127  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  24.02 
 
 
725 aa  127  8e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  25.5 
 
 
730 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  25.47 
 
 
730 aa  124  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  4.52412e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  25.23 
 
 
720 aa  123  8e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  25.34 
 
 
730 aa  122  2e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.96014e-05  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  23.64 
 
 
727 aa  120  8e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  25.51 
 
 
724 aa  118  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  7.33685e-05  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  25.47 
 
 
731 aa  117  7e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.84393e-06  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  23.22 
 
 
719 aa  117  7e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  28.31 
 
 
782 aa  115  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  24.44 
 
 
741 aa  113  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  4.2193e-05 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  29.4 
 
 
745 aa  110  7e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  24.29 
 
 
731 aa  110  7e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  24.3 
 
 
735 aa  107  9e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  24.23 
 
 
745 aa  106  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  27.45 
 
 
738 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  27.31 
 
 
893 aa  104  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  23.57 
 
 
764 aa  101  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  27.83 
 
 
714 aa  99.4  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  4.68411e-07 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  25.13 
 
 
762 aa  99  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  7.40819e-06 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  26.67 
 
 
895 aa  94.7  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  30.07 
 
 
898 aa  94.7  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  25.7 
 
 
885 aa  94.4  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  29.74 
 
 
898 aa  94.4  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  29.74 
 
 
898 aa  93.2  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  25.03 
 
 
762 aa  90.1  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  6.43351e-05 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  25.55 
 
 
809 aa  89.7  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  23.17 
 
 
766 aa  87.8  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  24.41 
 
 
762 aa  86.7  1e-15  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  23.07 
 
 
833 aa  84.7  5e-15  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  25.13 
 
 
729 aa  83.6  1e-14  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  2.80036e-08 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  24.48 
 
 
761 aa  82.4  2e-14  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  24.48 
 
 
761 aa  83.2  2e-14  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  24.39 
 
 
764 aa  82  3e-14  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  8.91097e-06 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  24.26 
 
 
764 aa  80.9  7e-14  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  26.63 
 
 
945 aa  79.3  2e-13  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1421  hypothetical protein  24.28 
 
 
657 aa  79.3  2e-13  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  24.29 
 
 
770 aa  78.6  4e-13  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  20.32 
 
 
822 aa  76.6  1e-12  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  23.32 
 
 
755 aa  75.1  4e-12  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  25.24 
 
 
820 aa  73.2  1e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  27.05 
 
 
716 aa  72.8  2e-11  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  22.42 
 
 
731 aa  72.8  2e-11  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  25.97 
 
 
758 aa  68.9  2e-10  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  28.88 
 
 
741 aa  67.4  7e-10  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  22.37 
 
 
789 aa  65.1  4e-09  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  23.4 
 
 
788 aa  62.4  2e-08  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  23.31 
 
 
788 aa  62.4  2e-08  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  25.71 
 
 
789 aa  62.8  2e-08  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  24.04 
 
 
765 aa  58.2  4e-07  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2990  hypothetical protein  21.98 
 
 
680 aa  57.4  7e-07  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2379  hypothetical protein  31.39 
 
 
1111 aa  56.2  2e-06  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.49944  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  21.73 
 
 
778 aa  56.2  2e-06  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0447  hypothetical protein  22.08 
 
 
612 aa  55.8  2e-06  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.476837 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0963  hypothetical protein  26.29 
 
 
816 aa  54.3  7e-06  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.830117  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  24.54 
 
 
843 aa  53.9  8e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  8.08171e-07 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0450  hypothetical protein  25.81 
 
 
687 aa  53.5  1e-05  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  26.73 
 
 
936 aa  52.4  3e-05  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4517  hypothetical protein  25.82 
 
 
642 aa  52  4e-05  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.247929 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1409  hypothetical protein  25.74 
 
 
696 aa  50.4  9e-05  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2523  hypothetical protein  36.47 
 
 
757 aa  50.4  9e-05  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  20.5 
 
 
754 aa  50.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1356  hypothetical protein  25.41 
 
 
696 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0734371 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  27.27 
 
 
742 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2580  hypothetical protein  22.33 
 
 
677 aa  46.6  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  26.84 
 
 
742 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2507  hypothetical protein  27.6 
 
 
700 aa  45.4  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116766  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  26.95 
 
 
742 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>