47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1529 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1529  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  572  1e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  1.87706e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1562  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  572  1e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126038  normal  0.486429 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1533  hypothetical protein  99.27 
 
 
273 aa  567  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2822  hypothetical protein  99.27 
 
 
273 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.40103e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1432  hypothetical protein  92.59 
 
 
274 aa  534  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2738  hypothetical protein  92.59 
 
 
274 aa  536  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2564  hypothetical protein  93.33 
 
 
274 aa  536  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2631  hypothetical protein  91.48 
 
 
274 aa  529  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1718  hypothetical protein  89.26 
 
 
274 aa  520  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2586  hypothetical protein  79.63 
 
 
273 aa  466  1e-130  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.801355  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3170  hypothetical protein  74.81 
 
 
271 aa  448  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0508487  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1499  hypothetical protein  75.75 
 
 
284 aa  450  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  2.161e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1355  hypothetical protein  73.9 
 
 
272 aa  439  1e-122  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2752  hypothetical protein  72.79 
 
 
272 aa  434  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1689  hypothetical protein  70.33 
 
 
273 aa  426  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0105422  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02030  hypothetical protein  68.28 
 
 
315 aa  397  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003741  hypothetical protein  67.91 
 
 
274 aa  393  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.439263  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0658  hypothetical protein  66.79 
 
 
275 aa  389  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1398  hypothetical protein  64.02 
 
 
265 aa  380  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0466903  normal  0.0522494 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4399  hypothetical protein  61.51 
 
 
283 aa  363  1e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2940  hypothetical protein  54.55 
 
 
267 aa  305  5e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0231953  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2054  hypothetical protein  52.4 
 
 
277 aa  303  1e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0469689  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1548  hypothetical protein  53.53 
 
 
276 aa  301  9e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2016  hypothetical protein  53.16 
 
 
276 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3726  hypothetical protein  53.16 
 
 
276 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3789  hypothetical protein  53.96 
 
 
266 aa  298  8e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24260  hypothetical protein  51.88 
 
 
266 aa  297  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13545  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1689  hypothetical protein  53.58 
 
 
266 aa  296  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.078896  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1576  hypothetical protein  53.88 
 
 
265 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967103  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2068  hypothetical protein  51.13 
 
 
278 aa  291  7e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0821949  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3440  hypothetical protein  50 
 
 
280 aa  289  3e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.377805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2199  hypothetical protein  51.74 
 
 
265 aa  286  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1311  hypothetical protein  50.19 
 
 
286 aa  287  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.588805  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18720  hypothetical protein  50.19 
 
 
275 aa  284  1e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0277254  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01647  hypothetical protein  48.72 
 
 
279 aa  280  3e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0300107  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2166  hypothetical protein  51.28 
 
 
274 aa  278  7e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0158588 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0705  hypothetical protein  42.7 
 
 
274 aa  241  1e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000381885  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1473  hypothetical cytosolic protein  42.7 
 
 
274 aa  241  1e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1721  hypothetical protein  37.13 
 
 
279 aa  196  2e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1714  hypothetical protein  38.75 
 
 
264 aa  173  3e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00660  hypothetical protein  40.22 
 
 
264 aa  169  6e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.26692  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0366  hypothetical protein  36.74 
 
 
263 aa  148  9e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0036321  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2784  hypothetical protein  24.53 
 
 
356 aa  78.6  1e-13  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3210  hypothetical protein  24.74 
 
 
256 aa  54.3  2e-06  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.566054  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1050  hypothetical protein  25.52 
 
 
238 aa  52.8  6e-06  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1287  hypothetical protein  27.18 
 
 
250 aa  47  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2324  hypothetical protein  23.71 
 
 
251 aa  43.1  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.580961  normal  0.646475 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>