87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1475 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1475  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  305  2e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.35685e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1480  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  305  2e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  2.28441e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2872  protein of unknown function DUF583  100 
 
 
149 aa  305  2e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  3.01369e-10  hitchhiker  8.94597e-07 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1511  hypothetical protein  99.33 
 
 
149 aa  302  1e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283593  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1382  hypothetical protein  74.4 
 
 
137 aa  195  2e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2611  hypothetical protein  66.4 
 
 
148 aa  177  3e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.135268  hitchhiker  5.04618e-07 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2785  hypothetical protein  60.54 
 
 
147 aa  178  3e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.668707  hitchhiker  0.00289407 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2678  hypothetical protein  66.4 
 
 
148 aa  177  3e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.185603  hitchhiker  0.000395785 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1662  hypothetical protein  67.46 
 
 
135 aa  176  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1444  hypothetical protein  48.72 
 
 
141 aa  120  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  5.22592e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1711  hypothetical protein  44.35 
 
 
135 aa  112  2e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00527708  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1431  hypothetical protein  43.22 
 
 
151 aa  112  2e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  9.6503e-06  normal  0.140917 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2934  hypothetical protein  49.54 
 
 
131 aa  111  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  3.05173e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0871  hypothetical protein  50.96 
 
 
262 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2226  hypothetical protein  50.48 
 
 
138 aa  105  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  2.25435e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3101  hypothetical protein  50.96 
 
 
262 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0721  cell shape determination protein CcmA  47.66 
 
 
282 aa  104  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0923  protein of unknown function DUF583  53.54 
 
 
267 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.364799  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0933  hypothetical protein  53.54 
 
 
269 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0899  hypothetical protein  53.54 
 
 
270 aa  103  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3438  hypothetical protein  52.43 
 
 
173 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0706  hypothetical protein  46.3 
 
 
171 aa  95.5  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  3.00244e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3256  hypothetical protein  43.69 
 
 
265 aa  92  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0840  hypothetical protein  43.14 
 
 
278 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.332372  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1325  hypothetical protein  33.64 
 
 
119 aa  87.8  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  28 
 
 
183 aa  64.7  4e-10  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0352  hypothetical protein  28.35 
 
 
183 aa  63.2  1e-09  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  28.57 
 
 
157 aa  62.4  2e-09  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1996  hypothetical protein  33.33 
 
 
228 aa  62.4  2e-09  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.775695  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  31.67 
 
 
131 aa  61.2  4e-09  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  28.83 
 
 
154 aa  60.5  7e-09  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  26.96 
 
 
133 aa  58.9  3e-08  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2122  protein of unknown function DUF583  32.74 
 
 
131 aa  55.5  2e-07  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1271  protein of unknown function DUF583  30.15 
 
 
158 aa  56.2  2e-07  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385232  normal  0.476408 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1854  hypothetical protein  27.19 
 
 
172 aa  55.1  3e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4166  hypothetical protein  34.74 
 
 
210 aa  55.5  3e-07  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4236  hypothetical protein  34.74 
 
 
223 aa  55.5  3e-07  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1175  protein of unknown function DUF583  28.7 
 
 
185 aa  55.1  3e-07  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0118209  normal  0.643318 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  31.25 
 
 
131 aa  55.1  3e-07  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4192  hypothetical protein  34.74 
 
 
210 aa  55.5  3e-07  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.719656  hitchhiker  0.00623524 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1621  hypothetical protein  27.19 
 
 
172 aa  53.9  6e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2975  hypothetical protein  27.19 
 
 
172 aa  53.9  6e-07  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0746  hypothetical protein  35 
 
 
223 aa  53.1  1e-06  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0799  hypothetical protein  33.68 
 
 
166 aa  53.1  1e-06  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  4.0318e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1614  protein of unknown function DUF583  31.48 
 
 
130 aa  52.8  2e-06  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  31.25 
 
 
131 aa  52.8  2e-06  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1088  hypothetical protein  26.47 
 
 
173 aa  52  3e-06  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2198  hypothetical protein  29.13 
 
 
131 aa  51.2  4e-06  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1954  hypothetical protein  27.93 
 
 
159 aa  50.1  1e-05  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0585612  normal  0.0588157 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  28.57 
 
 
134 aa  49.3  2e-05  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5104  protein of unknown function DUF583  28.16 
 
 
199 aa  49.3  2e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.332211  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0724  hypothetical protein  27.27 
 
 
133 aa  48.5  3e-05  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  26 
 
 
138 aa  47.8  5e-05  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  2.252e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  24.11 
 
 
137 aa  47.4  7e-05  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0615  hypothetical protein  30 
 
 
125 aa  47  9e-05  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  1.74199e-06  hitchhiker  4.85982e-07 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4734  hypothetical protein  25.81 
 
 
160 aa  47  9e-05  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122203  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0835  hypothetical protein  22.22 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000885875  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1052  hypothetical protein  30.77 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2691  hypothetical protein  28.83 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01740  hypothetical protein  27.37 
 
 
196 aa  46.2  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1101  hypothetical protein  24.24 
 
 
220 aa  46.2  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0604  hypothetical protein  30.48 
 
 
137 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.527043  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1454  protein of unknown function DUF583  24.11 
 
 
195 aa  45.4  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0812  cell shape determination protein CcmA  26.23 
 
 
191 aa  45.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.484596 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0151  hypothetical protein  25.81 
 
 
247 aa  45.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2923  protein of unknown function DUF583  28.83 
 
 
125 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03025  hypothetical protein  28.57 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.540862  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2201  hypothetical protein  29.59 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1317  protein of unknown function DUF583  24.21 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.080306 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0191  protein of unknown function DUF583  24 
 
 
123 aa  44.7  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  25.49 
 
 
131 aa  43.9  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0653  hypothetical protein  26.4 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0935  protein of unknown function DUF583  27.59 
 
 
203 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08500  hypothetical protein  30.21 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  2.0428e-08 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0805  hypothetical protein  30.21 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1567  hypothetical protein  24.56 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3528  hypothetical protein  24.59 
 
 
147 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.195767 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0331  protein of unknown function DUF583  28.42 
 
 
138 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3931  hypothetical protein  28 
 
 
136 aa  41.6  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183778  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1402  protein of unknown function DUF583  28.74 
 
 
148 aa  41.2  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.937379  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  26.02 
 
 
143 aa  41.2  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3273  hypothetical protein  27.45 
 
 
197 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.666049  normal  0.894626 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  26.02 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  24.56 
 
 
132 aa  40.8  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  24.56 
 
 
132 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0159  protein of unknown function DUF583  25 
 
 
113 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2104  hypothetical protein  21.95 
 
 
148 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724366  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>