110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1473 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  79.4 
 
 		 758 aa  1184    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  81.91 
 
 		 762 aa  1245    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  0.00000740819 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  82.44 
 
 		 762 aa  1229    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  0.0000643351 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  82.57 
 
 		 762 aa  1231    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  53.6 
 
 		 755 aa  767    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  99.74 
 
 		 761 aa  1555    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  47.09 
 
 		 764 aa  650    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  76.99 
 
 		 765 aa  1148    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  100 
 
 		 761 aa  1558    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  98.95 
 
 		 764 aa  1492    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  0.00000891097 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  98.95 
 
 		 764 aa  1492    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  46.07 
 
 		 766 aa  611  1e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  46.35 
 
 		 770 aa  567  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  25.78 
 
 		 822 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  26.29 
 
 		 639 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  25.39 
 
 		 789 aa  132  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  24.41 
 
 		 789 aa  128  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  24.59 
 
 		 778 aa  126  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  24.38 
 
 		 639 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  24.57 
 
 		 788 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  24.91 
 
 		 788 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  25 
 
 		 653 aa  117  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  25.06 
 
 		 639 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  24.44 
 
 		 639 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  24.44 
 
 		 639 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  25.26 
 
 		 656 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  25.35 
 
 		 639 aa  112  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  25.13 
 
 		 639 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000158979  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  24.57 
 
 		 639 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  24.51 
 
 		 639 aa  106  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  23.15 
 
 		 667 aa  103  9e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00001045  hitchhiker  0.00000606277 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  26.11 
 
 		 820 aa  101  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  24.45 
 
 		 646 aa  100  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  23.98 
 
 		 650 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  24.74 
 
 		 650 aa  99.8  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  36.79 
 
 		 898 aa  99.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  36.79 
 
 		 898 aa  99  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  24.61 
 
 		 650 aa  99  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  24.56 
 
 		 782 aa  98.6  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  24.61 
 
 		 650 aa  98.2  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  36.27 
 
 		 898 aa  98.2  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  25.24 
 
 		 826 aa  97.8  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  24.65 
 
 		 650 aa  96.7  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  23.58 
 
 		 639 aa  96.3  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  22.73 
 
 		 809 aa  95.9  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  24.9 
 
 		 650 aa  95.9  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  25.7 
 
 		 742 aa  94.7  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  23.22 
 
 		 885 aa  94.4  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  22.15 
 
 		 895 aa  94.4  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  23.42 
 
 		 893 aa  93.2  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  24.7 
 
 		 742 aa  89.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  25.63 
 
 		 663 aa  89.4  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000254716  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  24.96 
 
 		 742 aa  89.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  23.62 
 
 		 640 aa  88.6  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  27.69 
 
 		 745 aa  88.2  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2698  decaheme cytochrome c  23.54 
 
 		 671 aa  87.4  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0681671  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  24.08 
 
 		 843 aa  87  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  0.000000808171 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  23.98 
 
 		 671 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  25.77 
 
 		 716 aa  84.3  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2525  decaheme cytochrome c  23.64 
 
 		 656 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  24.56 
 
 		 741 aa  81.3  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2510  decaheme cytochrome c  26.67 
 
 		 655 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178218  hitchhiker  0.000666167 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  22.37 
 
 		 720 aa  77  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  23.16 
 
 		 727 aa  75.1  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0963  hypothetical protein  23.85 
 
 		 816 aa  74.3  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.830117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  22.92 
 
 		 936 aa  73.9  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  24.64 
 
 		 754 aa  73.9  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  21.7 
 
 		 725 aa  72  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1525  decaheme cytochrome c  22.72 
 
 		 660 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  23.24 
 
 		 714 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  0.000000468411 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  26.22 
 
 		 945 aa  68.9  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1257  hypothetical protein  24.32 
 
 		 762 aa  68.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  22.82 
 
 		 719 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  21.92 
 
 		 729 aa  65.9  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  28.23 
 
 		 833 aa  65.5  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  23.55 
 
 		 724 aa  65.1  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  21.24 
 
 		 722 aa  63.5  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  21.97 
 
 		 724 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000733685  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  22.09 
 
 		 729 aa  59.7  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  23.43 
 
 		 731 aa  59.3  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1356  hypothetical protein  35.11 
 
 		 696 aa  58.9  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0734371 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2507  hypothetical protein  24.44 
 
 		 700 aa  58.2  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116766  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  25.84 
 
 		 785 aa  58.2  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.724503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1409  hypothetical protein  34.04 
 
 		 696 aa  57  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  22.63 
 
 		 741 aa  55.8  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  0.000042193 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3163  hypothetical protein  23.4 
 
 		 857 aa  55.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  21.55 
 
 		 738 aa  55.1  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4517  hypothetical protein  34.62 
 
 		 642 aa  54.7  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.247929 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0447  hypothetical protein  34.38 
 
 		 612 aa  52.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.476837 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2523  hypothetical protein  30.27 
 
 		 757 aa  51.2  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2580  hypothetical protein  33.03 
 
 		 677 aa  50.4  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2862  hypothetical protein  33.33 
 
 		 698 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3263  hypothetical protein  29.15 
 
 		 655 aa  49.7  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3353  hypothetical protein  23.73 
 
 		 856 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1421  hypothetical protein  31 
 
 		 657 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2843  hypothetical protein  33.33 
 
 		 701 aa  49.3  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1157  alkaline phosphatase  46.55 
 
 		 545 aa  49.3  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798229 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0450  hypothetical protein  33.98 
 
 		 687 aa  48.9  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2991  hypothetical protein  33.33 
 
 		 701 aa  49.3  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1515  hypothetical protein  33.33 
 
 		 701 aa  49.3  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>