187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1329 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1329  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 253 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1365  extracellular solute-binding protein  94.86 
 
 		 322 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.975535 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3019  extracellular solute-binding protein family 3  95.65 
 
 		 253 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.683657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1339  extracellular solute-binding protein  95.65 
 
 		 253 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1256  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  71.83 
 
 		 253 aa  365  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1503  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  69.2 
 
 		 258 aa  339  2e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2926  extracellular solute-binding protein  64.94 
 
 		 258 aa  339  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.441987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2828  extracellular solute-binding protein  64.54 
 
 		 258 aa  338  4e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2750  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  64.14 
 
 		 258 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3932  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.59 
 
 		 262 aa  102  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0387  extracellular solute-binding protein family 3  24 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0823  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.36 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1176  extracellular solute-binding protein family 3  22.97 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.975063 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  20.92 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2131  extracellular solute-binding protein  23.47 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3734  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0100  extracellular solute-binding protein family 3  29.84 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.246862  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2771  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.92 
 
 		 860 aa  62.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0051  extracellular solute-binding protein family 3  23.76 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5028  extracellular solute-binding protein  22.45 
 
 		 262 aa  62  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0482  hypothetical protein  23.81 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0726  histidine kinase  25.81 
 
 		 570 aa  59.3  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.408803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0461  hypothetical protein  23.33 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0485  hypothetical protein  23.33 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3293  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.56 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4852  extracellular solute-binding protein  20.82 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157097  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4979  periplasmic binding protein, putative  21.22 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0537  hypothetical protein  23.2 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1213  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 292 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0526  hypothetical protein  21.33 
 
 		 268 aa  57  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.601603  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0325  extracellular solute-binding protein  21.79 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1143  extracellular solute-binding protein  22.33 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00243654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2584  hypothetical protein  29.61 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.685098  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1583  ABC transporter periplasmic-binding protein  18.8 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0436102  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0331  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.17 
 
 		 843 aa  55.5  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0459  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.32 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1923  amino acid ABC transporter permease/periplasmic protein  21.6 
 
 		 714 aa  54.3  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.132292  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0521  hypothetical protein  23.36 
 
 		 247 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.282401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0247  extracellular solute-binding protein  20.08 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000342463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1231  extracellular solute-binding protein  22.86 
 
 		 285 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000126239  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1142  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 		 292 aa  52.8  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4742  hypothetical protein  24.21 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.177685  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1461  ABC-type amino acid transport system, periplasmic and permease components  24.44 
 
 		 736 aa  52.8  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3858  hypothetical protein  22.49 
 
 		 257 aa  52.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 		 252 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2470  solute-binding family 1 protein  24.24 
 
 		 245 aa  52.4  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.162983  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0574  hypothetical protein  23.11 
 
 		 247 aa  52  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54230  hypothetical protein  22.56 
 
 		 250 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.638501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1275  extracellular solute-binding protein  22.71 
 
 		 285 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000731969  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2571  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0744474  hitchhiker  0.0010566 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3082  extracellular solute-binding protein family 3  21.84 
 
 		 285 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00109919  hitchhiker  0.00184496 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1308  extracellular solute-binding protein  22.71 
 
 		 285 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.178396  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  28.57 
 
 		 2035 aa  51.6  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0290  ABC transporter, substrate-binding protein  19.92 
 
 		 270 aa  50.8  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2109  extracellular solute-binding protein  20.83 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.467134 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3857  hypothetical protein  23.67 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0556  hypothetical protein  24.3 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0201  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1466  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein/permease protein  22.48 
 
 		 727 aa  50.4  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2353  extracellular solute-binding protein family 3  22.55 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.09811e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6269  hypothetical protein  20.7 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0716  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 		 272 aa  50.1  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0567  hypothetical protein  21.96 
 
 		 247 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.230648  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2474  solute-binding family 1 protein  24.07 
 
 		 265 aa  49.3  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.734477  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0594  hypothetical protein  24.56 
 
 		 245 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.744113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1794  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.44 
 
 		 589 aa  48.9  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000132214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1767  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 276 aa  48.9  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.99488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0082  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.53 
 
 		 946 aa  49.3  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3850  hypothetical protein  22.46 
 
 		 256 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.388139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1920  diguanylate cyclase  24.48 
 
 		 893 aa  48.1  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.75 
 
 		 1410 aa  48.1  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3038  extracellular solute-binding protein  23.02 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0052  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 		 1080 aa  48.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1093  extracellular solute-binding protein family 3  22.96 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.019092 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05910  putative periplasmic transport system  20.87 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.760752 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1070  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.703712 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1063  diguanylate cyclase  30 
 
 		 458 aa  48.5  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.868006  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2972  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.56 
 
 		 761 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.542463  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4072  hypothetical protein  20.92 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00123999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0906  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.663665  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7494  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0124491  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3624  hypothetical protein  21.02 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.78712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4844  extracellular solute-binding protein family 3  22.22 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.732367  normal  0.095648 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0717  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.65 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00506919  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4452  hypothetical protein  21.37 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.485601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2397  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3191  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 		 274 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.29 
 
 		 1322 aa  46.6  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1698  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  24.55 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.176126  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3962  hypothetical protein  21.99 
 
 		 241 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2080  diguanylate cyclase  23.36 
 
 		 934 aa  46.6  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1655  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  20.33 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.568539 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3869  hypothetical protein  21.99 
 
 		 241 aa  46.2  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.013789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3146  extracellular solute-binding protein family 3  20.93 
 
 		 288 aa  46.2  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  22.67 
 
 		 565 aa  45.8  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3063  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.14 
 
 		 264 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.898818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0477  extracellular solute-binding protein  20.1 
 
 		 246 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>