More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1306 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2846  TonB-dependent receptor  86.5 
 
 
823 aa  1481  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000571125  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1482  TonB-dependent receptor, putative  85.09 
 
 
815 aa  1450  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2930  TonB-dependent receptor plug  78.2 
 
 
810 aa  1353  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1315  TonB-dependent receptor plug  92.08 
 
 
821 aa  1560  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  5.29097e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2768  TonB-dependent receptor  86.74 
 
 
823 aa  1486  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000855789  normal  0.291776 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3803  TonB-dependent receptor, plug  49.76 
 
 
807 aa  783  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1445  TonB-dependent receptor, plug  72.95 
 
 
825 aa  1237  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  4.76077e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3375  TonB-dependent receptor plug  75.24 
 
 
824 aa  1295  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31809  normal  0.581234 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1342  TonB-dependent receptor plug  98.66 
 
 
820 aa  1665  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00424571  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2440  TonB-dependent receptor, plug  74.4 
 
 
825 aa  1280  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  3.51973e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1347  TonB-dependent receptor  75.18 
 
 
820 aa  1294  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475888  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2690  TonB-dependent receptor, plug  74.39 
 
 
812 aa  1295  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.228232 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1237  TonB-dependent receptor, plug  86.6 
 
 
814 aa  1481  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.115199  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2944  TonB-dependent receptor  87.47 
 
 
823 aa  1497  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.78601e-05  normal  0.742035 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1306  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 
820 aa  1684  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  1.96501e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3242  TonB-dependent receptor  76.25 
 
 
811 aa  1314  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  4.14671e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3044  TonB-dependent receptor plug  92.08 
 
 
821 aa  1559  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  5.27887e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0391  TonB-dependent siderophore receptor  24.25 
 
 
712 aa  158  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196206  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  23.39 
 
 
707 aa  152  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  24.03 
 
 
737 aa  150  7e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  24.45 
 
 
776 aa  144  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  23.6 
 
 
713 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  30.52 
 
 
720 aa  138  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  30.25 
 
 
720 aa  136  2e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  30.25 
 
 
720 aa  135  4e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  30.19 
 
 
720 aa  134  7e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 
715 aa  132  2e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  30.83 
 
 
723 aa  131  5e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  32.23 
 
 
724 aa  130  1e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  32.23 
 
 
724 aa  129  2e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  30.47 
 
 
714 aa  126  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  34.92 
 
 
738 aa  125  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  8.35907e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  31.27 
 
 
702 aa  122  2e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  31.27 
 
 
702 aa  122  2e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  34.68 
 
 
742 aa  121  4e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.35 
 
 
713 aa  122  4e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  30.71 
 
 
712 aa  121  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  33.72 
 
 
749 aa  121  7e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  34.48 
 
 
740 aa  120  8e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  34.44 
 
 
742 aa  120  1e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  1.85534e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  34.43 
 
 
748 aa  119  2e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  3.12172e-05  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  34.43 
 
 
748 aa  119  2e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  7.00289e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  30.83 
 
 
722 aa  119  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  32.4 
 
 
757 aa  117  8e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  32.3 
 
 
701 aa  116  2e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  30.62 
 
 
722 aa  116  2e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  32.32 
 
 
701 aa  110  7e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0946  TonB-dependent siderophore receptor  33.07 
 
 
706 aa  110  8e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  31.08 
 
 
699 aa  109  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  2.19924e-07  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  32.55 
 
 
770 aa  108  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  32.57 
 
 
713 aa  108  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.08759e-07 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  32.55 
 
 
710 aa  108  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  32.77 
 
 
707 aa  107  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  31.9 
 
 
795 aa  107  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  30.6 
 
 
715 aa  107  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  36.08 
 
 
810 aa  107  8e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0594  TonB-dependent siderophore receptor  30.68 
 
 
708 aa  106  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  37.02 
 
 
881 aa  106  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  37.02 
 
 
881 aa  106  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1180  TonB-dependent siderophore receptor  37.44 
 
 
679 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14569  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  37.44 
 
 
921 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  31.4 
 
 
815 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  37.44 
 
 
882 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  37.44 
 
 
921 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  37.44 
 
 
881 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  37.91 
 
 
710 aa  105  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  33.2 
 
 
806 aa  104  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  28.04 
 
 
711 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  33.5 
 
 
703 aa  103  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  31.76 
 
 
711 aa  103  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  31.76 
 
 
710 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3640  TonB-dependent siderophore receptor  21.97 
 
 
767 aa  103  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0918046  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  32.5 
 
 
721 aa  103  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  32.51 
 
 
701 aa  103  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  32.51 
 
 
701 aa  103  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  34.17 
 
 
719 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  32.51 
 
 
701 aa  103  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2461  TonB-dependent siderophore receptor  31.62 
 
 
713 aa  102  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01528  TonB-dependent receptor  31.08 
 
 
720 aa  102  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  28.7 
 
 
837 aa  102  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  33.18 
 
 
817 aa  101  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  29.52 
 
 
710 aa  100  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  36.14 
 
 
719 aa  100  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  29.69 
 
 
701 aa  99.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  29.69 
 
 
701 aa  99.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  29.29 
 
 
701 aa  99.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  35.83 
 
 
796 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  36.49 
 
 
742 aa  99.8  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.3 
 
 
711 aa  99  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  29.86 
 
 
806 aa  99.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  33.79 
 
 
796 aa  99  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6108  TonB-dependent siderophore receptor  34.38 
 
 
796 aa  99.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296471  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  33.79 
 
 
796 aa  99  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  33.64 
 
 
796 aa  98.6  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1028  TonB-dependent siderophore receptor  30.47 
 
 
718 aa  98.6  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.289591  normal  0.407367 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3560  TonB-dependent siderophore receptor  34.62 
 
 
710 aa  98.6  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  27.68 
 
 
709 aa  98.2  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0917  TonB-dependent siderophore receptor  32.22 
 
 
696 aa  97.8  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1281  TonB-dependent siderophore receptor  36 
 
 
699 aa  97.8  7e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  33.78 
 
 
724 aa  97.8  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>