More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1286 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1286  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
392 aa  783  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.49738e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1320  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  95.92 
 
 
387 aa  746  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0173853  decreased coverage  0.000998378 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3069  histidine kinase  97.45 
 
 
392 aa  763  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0020907  hitchhiker  1.36293e-09 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1242  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  97.96 
 
 
392 aa  767  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000812126  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1153  putative signal transduction histidine kinase  61.15 
 
 
386 aa  419  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1152  putative signal transduction histidine kinase  60.9 
 
 
386 aa  416  1e-115  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1223  putative signal transduction histidine kinase  61.15 
 
 
386 aa  415  1e-115  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3054  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  50.79 
 
 
382 aa  316  4e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 
398 aa  150  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04460  two-component system sensor protein  32.02 
 
 
378 aa  144  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3803  histidine kinase  30.21 
 
 
374 aa  119  8e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.263208  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1679  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.15 
 
 
426 aa  89.7  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0888  sensor histidine kinase, putative  27.27 
 
 
364 aa  89  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000307966  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5532  sensor histidine kinase  29.91 
 
 
376 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5476  sensor histidine kinase  26.58 
 
 
376 aa  85.9  1e-15  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.324928  hitchhiker  3.47721e-11 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5476  sensor histidine kinase  27.63 
 
 
376 aa  85.5  1e-15  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412372  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2958  histidine kinase  27.98 
 
 
405 aa  84.7  2e-15  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00418093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5598  sensor histidine kinase  29.52 
 
 
376 aa  85.1  2e-15  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5201  sensor histidine kinase  29.52 
 
 
376 aa  85.1  2e-15  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5035  sensor histidine kinase  29.52 
 
 
376 aa  85.1  2e-15  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5445  sensor histidine kinase  29.96 
 
 
376 aa  85.5  2e-15  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5051  sensor histidine kinase  29.52 
 
 
376 aa  84.3  3e-15  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5483  sensor histidine kinase  29.96 
 
 
376 aa  84  4e-15  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3872  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 
376 aa  84.3  4e-15  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0238476  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 
404 aa  84  4e-15  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5151  histidine kinase  27.23 
 
 
376 aa  84  4e-15  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4752  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.76 
 
 
393 aa  83.2  7e-15  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 
363 aa  82.8  1e-14  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 
401 aa  81.3  3e-14  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3023  response regulator  28.57 
 
 
597 aa  81.3  3e-14  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  1.1368e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0654  histidine kinase  28.08 
 
 
385 aa  80.9  3e-14  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 
389 aa  79.7  9e-14  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0906  histidine kinase  26.44 
 
 
381 aa  79.3  1e-13  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.74 
 
 
397 aa  78.2  2e-13  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  32.13 
 
 
413 aa  79  2e-13  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3924  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 
363 aa  78.2  3e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4573  histidine kinase  28.33 
 
 
396 aa  77.8  3e-13  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159455  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1872  sensor histidine kinase  28.5 
 
 
1046 aa  77.4  4e-13  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0289  putative two-component system sensor kinase  27 
 
 
423 aa  77  6e-13  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.159302  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1623  histidine kinase  26.09 
 
 
383 aa  76.6  6e-13  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244207  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 
412 aa  76.3  9e-13  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 
799 aa  76.3  1e-12  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 
748 aa  76.3  1e-12  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 
450 aa  75.9  1e-12  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0194  putative signal transduction histidine kinase  30 
 
 
398 aa  74.7  2e-12  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.141704 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1587  sensor protein  26.03 
 
 
493 aa  75.5  2e-12  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.234957  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  25.93 
 
 
392 aa  75.1  2e-12  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2634  histidine kinase  31.48 
 
 
343 aa  75.1  2e-12  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  1.75326e-06  hitchhiker  0.00557176 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0184  putative signal transduction histidine kinase  25.1 
 
 
390 aa  75.1  2e-12  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709555  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 
385 aa  75.5  2e-12  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.884966 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  28.24 
 
 
422 aa  74.3  3e-12  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3482  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 
489 aa  74.3  3e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.063872  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0106  membrane-associated sensory histidine kinase-like ATPase  25 
 
 
632 aa  74.7  3e-12  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100844  normal  0.392929 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1142  Signal transduction histidine kinase  23.96 
 
 
402 aa  74.7  3e-12  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 
367 aa  74.3  3e-12  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  2.14794e-08 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1721  histidine kinase  26.32 
 
 
399 aa  74.3  3e-12  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  30.05 
 
 
463 aa  74.7  3e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  27.23 
 
 
325 aa  73.9  4e-12  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 
407 aa  73.6  5e-12  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0504  histidine kinase  26.89 
 
 
407 aa  73.9  5e-12  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.991268 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 
402 aa  73.9  5e-12  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2064  histidine kinase  25.98 
 
 
400 aa  73.2  7e-12  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 
372 aa  73.2  7e-12  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 
671 aa  73.2  7e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.773791  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5480  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.52 
 
 
404 aa  73.2  7e-12  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.500623  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6313  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 
448 aa  72.8  9e-12  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 
418 aa  72.8  1e-11  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1587  histidine kinase  25.39 
 
 
439 aa  72.8  1e-11  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.230024  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4738  histidine kinase  25.7 
 
 
264 aa  72.4  1e-11  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.977544  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 
665 aa  72.4  1e-11  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163996  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  32.34 
 
 
683 aa  72.4  1e-11  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 
425 aa  71.6  2e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0762  histidine kinase  25.67 
 
 
437 aa  72  2e-11  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.332583 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 
359 aa  71.6  2e-11  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  24.15 
 
 
421 aa  72  2e-11  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03850  signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 
418 aa  71.6  2e-11  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  0.231181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  24.54 
 
 
380 aa  71.6  2e-11  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0699  histidine kinase  28.57 
 
 
526 aa  71.6  2e-11  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00253859  normal  0.376247 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2714  putative signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 
614 aa  71.6  2e-11  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1265  histidine kinase  28.02 
 
 
386 aa  72  2e-11  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 
370 aa  71.6  2e-11  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4365  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 
468 aa  71.2  3e-11  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.665132  normal  0.714097 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4060  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.76 
 
 
552 aa  71.2  3e-11  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.666301  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1644  histidine kinase  31.07 
 
 
296 aa  70.5  4e-11  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.518526  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00220  signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 
391 aa  70.9  4e-11  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  29.96 
 
 
402 aa  70.9  4e-11  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0754  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 
384 aa  70.5  4e-11  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.961024  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01000  signal transduction histidine kinase  26.12 
 
 
372 aa  70.5  5e-11  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.64 
 
 
391 aa  70.5  5e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00405521  normal  0.0184903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6031  Histidine kinase  27.57 
 
 
338 aa  70.5  5e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0358  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  26.34 
 
 
364 aa  70.1  6e-11  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1409  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  20 
 
 
363 aa  70.1  6e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00593294  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20 
 
 
363 aa  70.1  6e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000104287  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 
490 aa  70.1  6e-11  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  27.49 
 
 
351 aa  70.1  6e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  27.49 
 
 
351 aa  70.1  6e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0356  histidine kinase  27.47 
 
 
359 aa  70.5  6e-11  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  decreased coverage  1.13905e-08 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  27.49 
 
 
351 aa  70.1  6e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.75238e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02210  signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
372 aa  69.7  7e-11  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 
364 aa  69.7  8e-11  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>