More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1257 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1290  50S ribosomal protein L19  100 
 
 
117 aa  236  8e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  3.977e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3100  50S ribosomal protein L19  100 
 
 
117 aa  236  8e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  2.6861e-09  normal  0.106468 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1360  50S ribosomal protein L19  100 
 
 
117 aa  236  8e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1171  50S ribosomal protein L19  100 
 
 
117 aa  236  8e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  2.51517e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1213  50S ribosomal protein L19  100 
 
 
117 aa  236  8e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  8.88328e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2835  50S ribosomal protein L19  100 
 
 
117 aa  236  8e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.48121e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2917  50S ribosomal protein L19  100 
 
 
117 aa  236  8e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.28835e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1257  50S ribosomal protein L19  100 
 
 
117 aa  236  8e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  5.04967e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3014  50S ribosomal protein L19  100 
 
 
117 aa  236  8e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  5.50721e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0892  50S ribosomal protein L19  95.73 
 
 
117 aa  227  5e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00545492  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2917  50S ribosomal protein L19  95.73 
 
 
117 aa  226  6e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  5.37691e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2751  50S ribosomal protein L19  94.87 
 
 
117 aa  224  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  8.96071e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1066  50S ribosomal protein L19  94.78 
 
 
116 aa  207  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  2.85851e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1162  50S ribosomal protein L19  91.45 
 
 
117 aa  204  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  2.63892e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1052  50S ribosomal protein L19  90.6 
 
 
117 aa  204  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000268898  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1257  50S ribosomal protein L19  89.74 
 
 
117 aa  202  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  9.65232e-09  hitchhiker  5.25185e-05 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002539  LSU ribosomal protein L19p  82.91 
 
 
117 aa  199  1e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.31397e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03477  50S ribosomal protein L19  82.91 
 
 
117 aa  199  1e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  82.05 
 
 
117 aa  197  4e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.54416e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0652  50S ribosomal protein L19  80.34 
 
 
117 aa  196  1e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.520317  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1580  50S ribosomal protein L19  82.3 
 
 
120 aa  190  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01708  50S ribosomal protein L19  80.53 
 
 
120 aa  189  9e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0189538  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3200  50S ribosomal protein L19  78.95 
 
 
115 aa  183  8e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000327928  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1127  50S ribosomal protein L19  78.95 
 
 
115 aa  182  1e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.658651  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2857  50S ribosomal protein L19  78.95 
 
 
115 aa  181  2e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0994  50S ribosomal protein L19  78.95 
 
 
115 aa  181  2e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.205285  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4066  50S ribosomal protein L19  74.36 
 
 
117 aa  180  5e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3364  50S ribosomal protein L19  73.73 
 
 
119 aa  180  7e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.734932  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2758  50S ribosomal protein L19  77.19 
 
 
115 aa  179  8e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0531203  normal  0.0143177 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02459  hypothetical protein  77.19 
 
 
115 aa  179  8e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0136468  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2995  50S ribosomal protein L19  77.19 
 
 
115 aa  179  8e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0184061  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1068  ribosomal protein L19  77.19 
 
 
115 aa  179  8e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  8.54887e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0879  50S ribosomal protein L19  77.39 
 
 
115 aa  179  8e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387585  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1077  50S ribosomal protein L19  77.19 
 
 
115 aa  179  8e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00292053  hitchhiker  0.00675829 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2765  50S ribosomal protein L19  77.19 
 
 
115 aa  179  8e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.15914e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3361  50S ribosomal protein L19  77.39 
 
 
115 aa  179  8e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.407849  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3225  50S ribosomal protein L19  77.39 
 
 
115 aa  179  8e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.639554  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02495  50S ribosomal protein L19  77.19 
 
 
115 aa  179  8e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0233029  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2890  50S ribosomal protein L19  77.19 
 
 
115 aa  179  8e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00198618  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3845  50S ribosomal protein L19  77.19 
 
 
115 aa  179  8e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0054034  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0855  50S ribosomal protein L19  78.07 
 
 
118 aa  179  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  1.74926e-07  hitchhiker  5.79637e-05 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3087  50S ribosomal protein L19  76.52 
 
 
115 aa  179  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.228152  normal  0.0603569 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3767  50S ribosomal protein L19  73.68 
 
 
120 aa  178  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  1.16222e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3398  50S ribosomal protein L19  74.56 
 
 
116 aa  179  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.976851  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  76.99 
 
 
115 aa  177  3e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2887  50S ribosomal protein L19  76.32 
 
 
115 aa  177  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00407134  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2889  50S ribosomal protein L19  76.32 
 
 
115 aa  177  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.317443  normal  0.332648 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2818  50S ribosomal protein L19  76.32 
 
 
115 aa  177  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.241725  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3001  50S ribosomal protein L19  76.32 
 
 
115 aa  177  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2868  50S ribosomal protein L19  76.32 
 
 
115 aa  177  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0111282 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2473  ribosomal protein L19  73.45 
 
 
114 aa  175  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2852  ribosomal protein L19  73.45 
 
 
114 aa  175  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151423  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3013  50S ribosomal protein L19  75.44 
 
 
119 aa  175  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.028124  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2376  50S ribosomal protein L19  73.73 
 
 
126 aa  174  4e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.488088 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39530  50S ribosomal protein L19  72.81 
 
 
116 aa  174  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0334012  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3063  50S ribosomal protein L19  72.88 
 
 
126 aa  173  8e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.73894e-23  unclonable  2.80297e-08 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16000  50S ribosomal protein L19  72.57 
 
 
116 aa  173  9e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  9.73438e-05  normal  0.502722 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1377  50S ribosomal protein L19  72.57 
 
 
116 aa  173  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.134338  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0430  ribosomal protein L19  71.05 
 
 
121 aa  172  1e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575588  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0849  ribosomal protein L19  73.68 
 
 
117 aa  172  1e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2003  ribosomal protein L19  74.56 
 
 
115 aa  172  2e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  2.53757e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1022  50S ribosomal protein L19  73.68 
 
 
116 aa  172  2e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132061  normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4256  50S ribosomal protein L19  72.81 
 
 
116 aa  171  3e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1465  50S ribosomal protein L19  72.81 
 
 
116 aa  171  3e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0559636  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1070  50S ribosomal protein L19  72.81 
 
 
116 aa  171  3e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1476  ribosomal protein L19  72.81 
 
 
116 aa  171  4e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735287  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1285  50S ribosomal protein L19  72.81 
 
 
116 aa  171  4e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.329  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4154  50S ribosomal protein L19  71.93 
 
 
116 aa  171  4e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.237739  normal  0.417935 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0650  50S ribosomal protein L19  71.93 
 
 
115 aa  170  5e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0345381  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0203  50S ribosomal protein L19  73.11 
 
 
138 aa  170  5e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000333718  normal  0.100248 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2319  50S ribosomal protein L19  72.41 
 
 
142 aa  169  8e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.556938  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2016  50S ribosomal protein L19  72.41 
 
 
130 aa  169  9e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113436  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0296  50S ribosomal protein L19  72.17 
 
 
116 aa  169  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  1.30489e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2277  50S ribosomal protein L19  73.45 
 
 
118 aa  169  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122186  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2784  50S ribosomal protein L19  69.17 
 
 
135 aa  169  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0887  50S ribosomal protein L19  73.04 
 
 
117 aa  169  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00504476  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0395  50S ribosomal protein L19  72.57 
 
 
114 aa  169  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1887  50S ribosomal protein L19  69.49 
 
 
128 aa  167  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000459449  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2700  50S ribosomal protein L19  68.64 
 
 
127 aa  167  7e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3352  50S ribosomal protein L19  68.64 
 
 
127 aa  167  7e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459545  normal  0.21243 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1206  50S ribosomal protein L19  71.93 
 
 
118 aa  166  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  4.37176e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5342  ribosomal protein L19  67.8 
 
 
146 aa  164  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1693  50S ribosomal protein L19  67.8 
 
 
121 aa  162  1e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0439  50S ribosomal protein L19  68.64 
 
 
121 aa  162  1e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0827  50S ribosomal protein L19  68.64 
 
 
128 aa  162  1e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0463  50S ribosomal protein L19  68.64 
 
 
121 aa  162  1e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1464  50S ribosomal protein L19  67.8 
 
 
130 aa  162  2e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.889205 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0549  50S ribosomal protein L19  68.7 
 
 
115 aa  161  2e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  8.95937e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1632  50S ribosomal protein L19  68.7 
 
 
115 aa  161  2e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  1.60789e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1107  50S ribosomal protein L19  69.83 
 
 
117 aa  162  2e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0936  50S ribosomal protein L19  65.83 
 
 
128 aa  160  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0118366 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0572  50S ribosomal protein L19  70.34 
 
 
135 aa  160  7e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0280317  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2974  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 
129 aa  160  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185414  normal  0.0681768 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1009  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 
128 aa  159  8e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359648  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1476  ribosomal protein L19  67.8 
 
 
127 aa  159  9e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.466303  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0878  50S ribosomal protein L19  65.83 
 
 
128 aa  159  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.714575  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0772  50S ribosomal protein L19  65.83 
 
 
127 aa  158  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123982  normal  0.100319 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0231  50S ribosomal protein L19  65.83 
 
 
129 aa  158  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2231  50S ribosomal protein L19  65.83 
 
 
130 aa  159  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133079  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0807  50S ribosomal protein L19  65.83 
 
 
128 aa  158  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.410607  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>