25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1184 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  97.99 
 
 
1296 bp  2363  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1184    100 
 
 
1296 bp  2569  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  7.35175e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  98.92 
 
 
1296 bp  2458  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  8.54879e-05  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  96.91 
 
 
1296 bp  2252  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  88.62 
 
 
1308 bp  180  7e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  78.46 
 
 
1287 bp  135  4e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  83.25 
 
 
1308 bp  125  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  94.74 
 
 
1263 bp  60  2e-06  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  86.67 
 
 
1272 bp  56  3e-05  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2214    84.72 
 
 
1050 bp  56  3e-05  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  87.04 
 
 
1272 bp  52  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  87.04 
 
 
1272 bp  52  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  90.48 
 
 
1407 bp  52  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  86.79 
 
 
1272 bp  50.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  86.79 
 
 
1272 bp  50.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  84.62 
 
 
1272 bp  50.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  90 
 
 
1287 bp  48.1  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  90 
 
 
1272 bp  48.1  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  96.43 
 
 
1239 bp  48.1  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  85 
 
 
1266 bp  48.1  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  90 
 
 
1272 bp  48.1  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  87.5 
 
 
1248 bp  48.1  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  87.5 
 
 
1248 bp  48.1  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0172    85.71 
 
 
1238 bp  48.1  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.018644  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0190    85.71 
 
 
1239 bp  48.1  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>