More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1183 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  96.45 
 
 
451 aa  907  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  66.06 
 
 
443 aa  644  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  73.08 
 
 
443 aa  695  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1147  beta-galactosidase  71.72 
 
 
446 aa  684  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.94123 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2607  Beta-glucosidase  75.57 
 
 
443 aa  711  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776876  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  98 
 
 
451 aa  922  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3174  beta-galactosidase  99.11 
 
 
451 aa  931  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00114145  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  100 
 
 
451 aa  937  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  62.22 
 
 
444 aa  606  1e-172  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  59.77 
 
 
452 aa  576  1e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03797  beta-glucosidase  61.68 
 
 
452 aa  565  1e-160  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  56.63 
 
 
447 aa  522  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  53.93 
 
 
449 aa  501  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  52.13 
 
 
470 aa  468  1e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  51.86 
 
 
440 aa  463  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  49.66 
 
 
463 aa  453  1e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4320  beta-galactosidase  50.68 
 
 
460 aa  436  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  52.33 
 
 
443 aa  432  1e-120  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  48.49 
 
 
444 aa  422  1e-117  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  5.31793e-05  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  47.03 
 
 
452 aa  406  1e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  46.34 
 
 
448 aa  401  1e-110  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08390  broad-specificity cellobiase  45.05 
 
 
494 aa  392  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.817528  normal  0.180996 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  48.65 
 
 
467 aa  389  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  47.08 
 
 
462 aa  386  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  47.44 
 
 
458 aa  387  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  1.80548e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  46.2 
 
 
472 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  44.6 
 
 
453 aa  382  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  43.97 
 
 
446 aa  384  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  1.88458e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  46 
 
 
484 aa  382  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1683  beta-galactosidase  47.4 
 
 
467 aa  381  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  42.86 
 
 
478 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  44.18 
 
 
459 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  43.32 
 
 
439 aa  378  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  41.94 
 
 
456 aa  378  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  41.53 
 
 
451 aa  372  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.25524e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  43.45 
 
 
474 aa  373  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  2.77167e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  43.92 
 
 
457 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  43.47 
 
 
457 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  45.93 
 
 
447 aa  373  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2614  beta-galactosidase  44.87 
 
 
517 aa  370  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  47.03 
 
 
448 aa  370  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  43.28 
 
 
446 aa  367  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  3.26763e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3827  beta-glucosidase  45.48 
 
 
457 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  46.93 
 
 
453 aa  366  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  43.25 
 
 
446 aa  365  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  45.62 
 
 
468 aa  364  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  41.36 
 
 
487 aa  363  3e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  44.03 
 
 
478 aa  363  3e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  42.3 
 
 
450 aa  363  5e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  43.29 
 
 
438 aa  361  1e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  1.11423e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  41.28 
 
 
476 aa  359  5e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  43.62 
 
 
478 aa  359  6e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  43.81 
 
 
446 aa  358  1e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1084  beta-galactosidase  44.52 
 
 
482 aa  358  1e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106414  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  44.95 
 
 
436 aa  357  2e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1879  beta-galactosidase  46.15 
 
 
488 aa  357  3e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251034  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3917  Beta-glucosidase  43.81 
 
 
455 aa  356  4e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  44.32 
 
 
472 aa  356  6e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  44.14 
 
 
458 aa  355  9e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  44.26 
 
 
453 aa  355  1e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  44.49 
 
 
467 aa  354  2e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2184  beta-galactosidase  43.83 
 
 
471 aa  354  2e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108551  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  43.71 
 
 
455 aa  352  8e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  44.04 
 
 
485 aa  352  8e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  42.04 
 
 
474 aa  352  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  43.18 
 
 
456 aa  350  4e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  40.49 
 
 
471 aa  344  1e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2534  beta-galactosidase  45.21 
 
 
468 aa  344  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.574019 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  42.56 
 
 
439 aa  342  6e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  41.52 
 
 
488 aa  342  8e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6279  beta-galactosidase  43.14 
 
 
463 aa  342  8e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  43.13 
 
 
500 aa  342  9e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  41.01 
 
 
440 aa  342  1e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  44.34 
 
 
437 aa  341  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  40.78 
 
 
440 aa  341  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  44.87 
 
 
472 aa  341  2e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  42.44 
 
 
489 aa  339  6e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7170  Beta-glucosidase  42.31 
 
 
474 aa  337  2e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0420556 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  43.78 
 
 
445 aa  338  2e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  43.13 
 
 
494 aa  336  5e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0326  Beta-glucosidase  43.96 
 
 
466 aa  334  1e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  42.54 
 
 
482 aa  333  3e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  40.47 
 
 
491 aa  333  3e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6477  putative beta-glucosidase  41.38 
 
 
450 aa  333  4e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.87446  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  42.32 
 
 
470 aa  332  7e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0808  beta-galactosidase  44.91 
 
 
466 aa  332  7e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2046  beta-galactosidase  42.73 
 
 
457 aa  331  1e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  41.71 
 
 
465 aa  330  3e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  42.7 
 
 
479 aa  330  4e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  41.47 
 
 
448 aa  329  8e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  37.96 
 
 
452 aa  327  2e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  7.53308e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  39.82 
 
 
463 aa  328  2e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  39.05 
 
 
470 aa  327  3e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1654  beta-glucosidase A  42.26 
 
 
435 aa  325  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.484784  hitchhiker  3.45699e-05 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3225  beta-galactosidase  41.08 
 
 
444 aa  323  3e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1629  beta-glucosidase  46.98 
 
 
463 aa  323  4e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.011647  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  40.78 
 
 
458 aa  322  7e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1936  beta-galactosidase  38.96 
 
 
458 aa  322  1e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111209  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1840  Beta-glucosidase  41.01 
 
 
458 aa  321  2e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185877  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4086  beta-galactosidase  40.14 
 
 
486 aa  313  3e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0681352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>