More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1170 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  80.61 
 
 
428 aa  733  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  92.76 
 
 
428 aa  829  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  82.71 
 
 
428 aa  731  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
428 aa  880  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  9.18343e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  92.76 
 
 
428 aa  831  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  73.36 
 
 
427 aa  671  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  74.77 
 
 
427 aa  679  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  74.3 
 
 
427 aa  677  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  97.2 
 
 
428 aa  858  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  74.33 
 
 
427 aa  654  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  76.87 
 
 
427 aa  692  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  76.64 
 
 
427 aa  692  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  85.51 
 
 
428 aa  770  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  7.55871e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  85.28 
 
 
428 aa  769  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  92.99 
 
 
428 aa  832  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  81.78 
 
 
440 aa  747  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  74.53 
 
 
427 aa  678  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  99.77 
 
 
428 aa  879  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  92.99 
 
 
428 aa  833  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  86.45 
 
 
428 aa  783  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  72.38 
 
 
427 aa  652  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  76.87 
 
 
427 aa  693  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  99.3 
 
 
428 aa  875  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  83.18 
 
 
428 aa  762  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  75.47 
 
 
427 aa  682  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
428 aa  880  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  74.77 
 
 
427 aa  679  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  65.73 
 
 
433 aa  598  1e-170  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  66.04 
 
 
426 aa  591  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  65.42 
 
 
427 aa  593  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  66.04 
 
 
426 aa  591  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  66.04 
 
 
426 aa  590  1e-167  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  66.04 
 
 
426 aa  591  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  66.04 
 
 
426 aa  591  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  66.04 
 
 
426 aa  590  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  66.04 
 
 
426 aa  591  1e-167  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  66.04 
 
 
426 aa  591  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  66.04 
 
 
426 aa  590  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  64.86 
 
 
426 aa  579  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  61.08 
 
 
427 aa  551  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  61.92 
 
 
427 aa  543  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  53.54 
 
 
436 aa  479  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  45.97 
 
 
438 aa  393  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  46.45 
 
 
430 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  46.67 
 
 
430 aa  388  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  46.59 
 
 
439 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  46.35 
 
 
439 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  45.97 
 
 
437 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  46.92 
 
 
430 aa  386  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  45.28 
 
 
437 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  45.26 
 
 
437 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  46.68 
 
 
436 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  45.97 
 
 
430 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  44 
 
 
431 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  44 
 
 
431 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  43.6 
 
 
435 aa  377  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  44.47 
 
 
431 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  45.97 
 
 
430 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  45.97 
 
 
430 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  46.93 
 
 
433 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  43.2 
 
 
435 aa  368  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  45.99 
 
 
433 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  42.28 
 
 
435 aa  365  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  46.46 
 
 
433 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  42.42 
 
 
435 aa  365  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  46.23 
 
 
433 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  44.44 
 
 
423 aa  365  1e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  45.75 
 
 
433 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  44.31 
 
 
430 aa  363  4e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  45.71 
 
 
430 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  43.6 
 
 
435 aa  362  5e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  41.88 
 
 
431 aa  362  6e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  42 
 
 
435 aa  359  6e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  42 
 
 
435 aa  359  6e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  42 
 
 
435 aa  359  6e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  43.66 
 
 
433 aa  358  1e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  42 
 
 
435 aa  358  1e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  42 
 
 
435 aa  356  4e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  41.77 
 
 
435 aa  355  8e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  44.81 
 
 
433 aa  354  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  42.24 
 
 
434 aa  354  2e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  41.77 
 
 
435 aa  352  7e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  44.55 
 
 
430 aa  352  9e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  41.51 
 
 
435 aa  350  2e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  44.18 
 
 
433 aa  349  5e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  41.29 
 
 
435 aa  349  5e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  41.53 
 
 
435 aa  349  6e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  43.38 
 
 
430 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4365  FAD dependent oxidoreductase  40.75 
 
 
437 aa  345  9e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0778  FAD dependent oxidoreductase  41.09 
 
 
429 aa  343  3e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0594018  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  42.48 
 
 
429 aa  343  4e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4055  FAD dependent oxidoreductase  40.66 
 
 
435 aa  340  3e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.80988  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1839  FAD dependent oxidoreductase  43.33 
 
 
436 aa  338  9e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131772  normal  0.38658 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  41.27 
 
 
433 aa  338  9e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2077  oxidoreductase  40 
 
 
429 aa  337  3e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1341  FAD dependent oxidoreductase  40.19 
 
 
435 aa  336  4e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268345  normal  0.168111 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3843  FAD dependent oxidoreductase  39.95 
 
 
435 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2142  FAD dependent oxidoreductase  40.57 
 
 
427 aa  335  7e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4548  FAD dependent oxidoreductase  39.95 
 
 
435 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  40.8 
 
 
433 aa  333  4e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>