More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1112 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  92.68 
 
 
369 aa  679  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  92.01 
 
 
363 aa  662  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.83072e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
369 aa  759  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
369 aa  759  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  84.15 
 
 
366 aa  624  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  83.24 
 
 
370 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  79.95 
 
 
373 aa  601  1e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  78.61 
 
 
372 aa  599  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  78.34 
 
 
372 aa  598  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  63.34 
 
 
367 aa  457  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  62.8 
 
 
367 aa  445  1e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  59.68 
 
 
368 aa  437  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  58.22 
 
 
365 aa  428  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  57.33 
 
 
376 aa  422  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  55.26 
 
 
377 aa  410  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  53.91 
 
 
373 aa  392  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4513  OmpA domain-containing protein  32.6 
 
 
341 aa  153  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.652887 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0456  OmpA domain-containing protein  30.81 
 
 
346 aa  151  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  33.22 
 
 
344 aa  143  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  1.82424e-07  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  33.77 
 
 
344 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  5.17848e-08  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  33.77 
 
 
344 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  3.49757e-05  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  33.77 
 
 
344 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  32.81 
 
 
345 aa  137  3e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  2.81488e-06  decreased coverage  1.76342e-11 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  32.57 
 
 
344 aa  136  6e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  3.00566e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  38.03 
 
 
351 aa  135  2e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  37.9 
 
 
344 aa  134  2e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  32.32 
 
 
335 aa  134  3e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  2.8398e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  37.5 
 
 
350 aa  133  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  37.5 
 
 
350 aa  133  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  4.84221e-11  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  33.08 
 
 
381 aa  131  2e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  9.77039e-05  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  36.57 
 
 
333 aa  130  4e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  1.97596e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3868  OmpA/MotB domain-containing protein  30.62 
 
 
404 aa  130  4e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599352  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  35.17 
 
 
367 aa  130  5e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  29.59 
 
 
352 aa  129  6e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  39.23 
 
 
429 aa  129  1e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  31.16 
 
 
321 aa  128  2e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  36.87 
 
 
337 aa  127  4e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  39.27 
 
 
337 aa  125  1e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  29.25 
 
 
368 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  2.80448e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  40.11 
 
 
401 aa  123  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  36.07 
 
 
345 aa  122  9e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  32.05 
 
 
394 aa  121  2e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  7.25554e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  31.42 
 
 
403 aa  121  2e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  1.08544e-07  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  37.21 
 
 
420 aa  119  9e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  28.21 
 
 
326 aa  119  1e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  4.75354e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  39.74 
 
 
447 aa  118  2e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.85785e-13  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  31.93 
 
 
392 aa  117  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  1.20544e-05  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  38.82 
 
 
380 aa  115  1e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  1.68113e-11  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  28.25 
 
 
320 aa  114  2e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  31.6 
 
 
388 aa  112  8e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  2.05838e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  33.91 
 
 
417 aa  112  1e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  7.26931e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  31.05 
 
 
366 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3909  OmpA/MotB domain protein  38.78 
 
 
202 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0018  outer membrane protein OmpA family  38.36 
 
 
201 aa  110  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3986  OmpA/MotB domain-containing protein  38.78 
 
 
202 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003405  outer membrane protein  40 
 
 
204 aa  110  4e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  27.6 
 
 
331 aa  110  4e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  28.17 
 
 
318 aa  109  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  36.31 
 
 
264 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  5.60377e-06 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  39.04 
 
 
375 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  39.31 
 
 
428 aa  108  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  2.18101e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0378  OmpA/MotB domain-containing protein  37.41 
 
 
202 aa  107  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0380  OmpA/MotB domain-containing protein  37.41 
 
 
202 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.700154  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 
202 aa  107  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02373  hypothetical protein  36.73 
 
 
208 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02380  hypothetical protein  39.73 
 
 
204 aa  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  37.41 
 
 
185 aa  106  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0432  OmpA/MotB domain-containing protein  36.54 
 
 
200 aa  107  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.161803  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003402  outer membrane protein  37.74 
 
 
204 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  5.00846e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  36.05 
 
 
201 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  32.77 
 
 
427 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  35.54 
 
 
209 aa  104  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1229  putative outer membrane protein  36.3 
 
 
212 aa  104  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  8.15007e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  35.67 
 
 
239 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  35.67 
 
 
239 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3262  OmpA/MotB  34.25 
 
 
201 aa  103  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  0.468838 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4102  OmpA/MotB domain-containing protein  36.73 
 
 
202 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4008  OmpA/MotB domain-containing protein  36.73 
 
 
202 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  26.78 
 
 
319 aa  103  5e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  4.79334e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0701  OmpA/MotB domain-containing protein  23.88 
 
 
369 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  37.66 
 
 
376 aa  102  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  1.02046e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  26.27 
 
 
342 aa  102  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  28.15 
 
 
328 aa  101  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  26.82 
 
 
330 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  4.10155e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  27.36 
 
 
319 aa  101  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001578  outer membrane protein  36.97 
 
 
205 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.672698  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  29.06 
 
 
321 aa  100  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  33.55 
 
 
237 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  41.44 
 
 
457 aa  98.6  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  27.2 
 
 
454 aa  99  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  7.20866e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0380  OmpA/MotB  34.01 
 
 
201 aa  98.2  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  42.98 
 
 
223 aa  97.1  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01404  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  38.61 
 
 
218 aa  97.4  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  37.09 
 
 
445 aa  97.1  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  26.17 
 
 
359 aa  96.7  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0309  OmpA/MotB domain-containing protein  34.01 
 
 
201 aa  96.3  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.350463  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  31.85 
 
 
240 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0473  OmpA/MotB domain-containing protein  32.65 
 
 
201 aa  95.1  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415293  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  26.65 
 
 
319 aa  95.1  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  36.61 
 
 
466 aa  93.6  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>