32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1089 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1089  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  321  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000360525  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1020  hypothetical protein  99.35 
 
 
155 aa  320  5e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000462608  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1122  hypothetical protein  98.71 
 
 
155 aa  318  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000205985  normal  0.233923 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3269  hypothetical protein  97.42 
 
 
155 aa  315  1e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000575849  normal  0.0306422 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1025  hypothetical protein  90.97 
 
 
155 aa  295  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000544137  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3071  hypothetical protein  65.16 
 
 
154 aa  207  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0110904  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3168  hypothetical protein  65.16 
 
 
154 aa  207  4e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000633672  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2990  hypothetical protein  63.87 
 
 
154 aa  204  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000446281  normal  0.422538 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3576  hypothetical protein  62.58 
 
 
154 aa  196  7.999999999999999e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2946  hypothetical protein  54.55 
 
 
151 aa  155  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125573  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0670  hypothetical protein  53.68 
 
 
147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00376699  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3162  hypothetical protein  49.35 
 
 
187 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000326454  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3496  hypothetical protein  56.06 
 
 
144 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00242449  hitchhiker  0.00393071 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2860  hypothetical protein  48.03 
 
 
150 aa  140  7e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013794  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3719  hypothetical protein  52.67 
 
 
148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000989384  normal  0.0383104 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2601  hypothetical protein  38.97 
 
 
151 aa  111  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000020827  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1127  hypothetical protein  27.27 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0795312  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42530  hypothetical protein  27.27 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0881  hypothetical protein  23.53 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00160834  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4789  hypothetical protein  31.34 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0307864  hitchhiker  0.00167919 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0845  hypothetical protein  30.3 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287816 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62170  hypothetical protein  26.72 
 
 
150 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.157561 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001906  hypothetical protein  32.65 
 
 
193 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.661466  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0980  hypothetical protein  29.13 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00586  hypothetical protein  31.29 
 
 
193 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1795  hypothetical protein  26.92 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5412  hypothetical protein  27.59 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1728  hypothetical protein  26.92 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0528  hypothetical protein  28.12 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.485368  normal  0.376375 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2319  hypothetical protein  27.33 
 
 
196 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1005  hypothetical protein  26.77 
 
 
144 aa  41.2  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.368062  hitchhiker  0.00000000000106362 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1142  hypothetical protein  23.72 
 
 
156 aa  41.2  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.310409 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>