238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1034 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1067  uracil-DNA glycosylase  99.55 
 
 
221 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000655251  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1034  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 
221 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000379797  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3325  uracil-DNA glycosylase  98.64 
 
 
221 aa  454  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00364236  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0965  uracil-DNA glycosylase  98.19 
 
 
221 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0201981  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3221  uracil-DNA glycosylase  81.45 
 
 
221 aa  385  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00088309  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0893  uracil-DNA glycosylase  80.28 
 
 
219 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00328532  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3129  uracil-DNA glycosylase  79.82 
 
 
219 aa  377  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000726683  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0977  uracil-DNA glycosylase  79.64 
 
 
221 aa  377  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00168707  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3654  uracil-DNA glycosylase  78.8 
 
 
218 aa  372  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3314  uracil-DNA glycosylase  76.61 
 
 
222 aa  362  2e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.518113  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3688  uracil-DNA glycosylase  69.68 
 
 
222 aa  340  1e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3988  uracil-DNA glycosylase  70.37 
 
 
222 aa  331  6e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.409874 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2831  uracil-DNA glycosylase  70.59 
 
 
221 aa  330  1e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00406873  normal  0.934783 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3073  uracil-DNA glycosylase  69.37 
 
 
222 aa  327  7e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.906111  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  61.99 
 
 
221 aa  303  2.0000000000000002e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2929  uracil-DNA glycosylase  64.52 
 
 
219 aa  301  4.0000000000000003e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000416129  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3091  uracil-DNA glycosylase  65.28 
 
 
220 aa  301  4.0000000000000003e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  62.61 
 
 
226 aa  297  9e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3577  uracil-DNA glycosylase  59.91 
 
 
222 aa  295  4e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1938  uracil-DNA glycosylase  62.96 
 
 
226 aa  290  9e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104572  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  60.09 
 
 
228 aa  288  3e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  61.75 
 
 
226 aa  288  5.0000000000000004e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  61.93 
 
 
227 aa  288  6e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000721221  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  60.55 
 
 
228 aa  286  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  60.55 
 
 
228 aa  286  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  60.09 
 
 
228 aa  284  7e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0613  uracil-DNA glycosylase  59.07 
 
 
222 aa  278  7e-74  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0481  uracil-DNA glycosylase  58.53 
 
 
223 aa  275  4e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0802006  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3595  uracil-DNA glycosylase  61.11 
 
 
228 aa  275  5e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1173  uracil-DNA glycosylase  61.11 
 
 
228 aa  275  6e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0255291  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1121  uracil-DNA glycosylase  61.11 
 
 
228 aa  274  7e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0977602  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2551  uracil-DNA glycosylase  56.22 
 
 
224 aa  274  8e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2867  uracil-DNA glycosylase  57.8 
 
 
229 aa  271  5.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0155178  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2733  uracil-DNA glycosylase  57.8 
 
 
229 aa  271  5.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00800854  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1088  uracil-DNA glycosylase  57.8 
 
 
229 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0467841  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2956  uracil-DNA glycosylase  57.8 
 
 
229 aa  271  8.000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0497126  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1097  uracil-DNA glycosylase  57.8 
 
 
229 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00580941  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2737  uracil-DNA glycosylase  57.8 
 
 
229 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000100069  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3817  uracil-DNA glycosylase  57.34 
 
 
229 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.01333  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02474  uracil-DNA glycosylase  57.34 
 
 
229 aa  268  4e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.386825  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02438  hypothetical protein  57.34 
 
 
229 aa  268  4e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.372619  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  57.67 
 
 
225 aa  268  5e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1229  putative uracil-DNA glycosylase  55.56 
 
 
218 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4288  uracil-DNA glycosylase  56.56 
 
 
225 aa  268  7e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2975  uracil-DNA glycosylase  56.88 
 
 
229 aa  267  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2841  uracil-DNA glycosylase  56.88 
 
 
229 aa  267  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.619436  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2863  uracil-DNA glycosylase  56.88 
 
 
229 aa  267  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466868  normal  0.345403 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2859  uracil-DNA glycosylase  56.88 
 
 
229 aa  267  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1283  uracil-DNA glycosylase  56.74 
 
 
216 aa  266  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0138995  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3065  uracil-DNA glycosylase  55.96 
 
 
229 aa  266  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.550581  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2757  uracil-DNA glycosylase  56.42 
 
 
229 aa  265  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00257883  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  56.74 
 
 
225 aa  265  5e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  54.67 
 
 
243 aa  254  9e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  52.05 
 
 
231 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  53.88 
 
 
231 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  53.42 
 
 
231 aa  252  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  52.51 
 
 
229 aa  250  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  52.51 
 
 
230 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  52.51 
 
 
232 aa  249  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  55.19 
 
 
218 aa  248  4e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  52.51 
 
 
230 aa  248  6e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  53.7 
 
 
230 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  52.51 
 
 
230 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  48.4 
 
 
233 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  48.86 
 
 
235 aa  240  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  53.92 
 
 
229 aa  240  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  51.58 
 
 
261 aa  239  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  52.04 
 
 
225 aa  238  4e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 
230 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 
230 aa  237  9e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  53.74 
 
 
240 aa  235  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321985  hitchhiker  0.00000000131635 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  48.4 
 
 
241 aa  235  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  47.95 
 
 
223 aa  234  6e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 
231 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 
241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5250  uracil-DNA glycosylase  54.41 
 
 
225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0465  uracil-DNA glycosylase  50.46 
 
 
226 aa  233  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5648  uracil-DNA glycosylase  54.41 
 
 
225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  49.54 
 
 
225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5521  uracil-DNA glycosylase  51.39 
 
 
225 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  49.54 
 
 
225 aa  232  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  47.03 
 
 
225 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  53.92 
 
 
225 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  53.92 
 
 
225 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  49.32 
 
 
224 aa  231  9e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  53.92 
 
 
225 aa  231  9e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  50.68 
 
 
225 aa  230  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2241  uracil-DNA glycosylase  48.86 
 
 
253 aa  228  6e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5079  uracil-DNA glycosylase  53.43 
 
 
225 aa  228  8e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000684584  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  49.32 
 
 
229 aa  227  9e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5430  uracil-DNA glycosylase  53.43 
 
 
225 aa  227  9e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2152  uracil-DNA glycosylase  48.4 
 
 
253 aa  226  1e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.957234  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3454  uracil-DNA glycosylase  48.88 
 
 
229 aa  226  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0594128 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5493  uracil-DNA glycosylase  52.94 
 
 
225 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3580  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
271 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3561  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
262 aa  222  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3588  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
262 aa  222  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5297  uracil-DNA glycosylase  50.68 
 
 
225 aa  222  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355342  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0649  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
259 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0945  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
259 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>