More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1021 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  85.63 
 
 
695 aa  1248  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  3.86167e-06  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3669  heme transport protein  85.08 
 
 
697 aa  1226  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  69.47 
 
 
688 aa  1002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0952  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  99.14 
 
 
696 aa  1421  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  3.91517e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1054  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  97.7 
 
 
696 aa  1405  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.47815e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  68.68 
 
 
681 aa  1001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1021  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  100 
 
 
696 aa  1432  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  3.7848e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0790  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  65.86 
 
 
690 aa  959  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  1.10471e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  96.12 
 
 
696 aa  1379  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  7.19833e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0966  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  87.5 
 
 
696 aa  1283  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942987  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  32.93 
 
 
676 aa  347  3e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0672  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.67 
 
 
694 aa  224  3e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41127  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1741  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.33 
 
 
661 aa  213  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  1.6514e-06  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0650  hemin receptor precursor  27.11 
 
 
676 aa  212  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.332086 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4857  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  28.44 
 
 
660 aa  211  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.803267 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3802  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  28.44 
 
 
660 aa  211  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.241464 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4191  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.96 
 
 
734 aa  211  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398881  normal  0.278972 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3801  TonB-dependent hemin receptor HmuR  27.14 
 
 
676 aa  209  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0122148  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3889  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.14 
 
 
676 aa  209  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  3.56309e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2169  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.19 
 
 
694 aa  202  2e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.108589 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1858  heme transport protein HugA  25.65 
 
 
683 aa  199  2e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4591  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.17 
 
 
743 aa  196  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880102  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1973  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  26.76 
 
 
783 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41369  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2415  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.31 
 
 
779 aa  189  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3446  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.18 
 
 
717 aa  186  2e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494808  decreased coverage  0.00031135 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4201  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.7 
 
 
686 aa  184  4e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.325691  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3532  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.71 
 
 
657 aa  179  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339275  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0162  TonB-dependent iron siderophore receptor  26.58 
 
 
778 aa  179  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1935  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.1 
 
 
722 aa  178  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1017  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.75 
 
 
704 aa  175  2e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0112436  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1440  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.28 
 
 
685 aa  176  2e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0111178  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3918  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 
681 aa  176  2e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0796  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 
649 aa  175  3e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0550386  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2354  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  25.14 
 
 
778 aa  174  6e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548378  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06114  hypothetical protein  28.21 
 
 
490 aa  157  7e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1519  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.64 
 
 
677 aa  148  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1912  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  26.36 
 
 
697 aa  148  4e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0648198 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1814  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.77 
 
 
892 aa  143  9e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3082  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.92 
 
 
730 aa  140  9e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.25355  normal  0.407735 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1602  TonB-dependent receptor, plug  24.85 
 
 
652 aa  137  6e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000326  enterobactin receptor VctA  25.07 
 
 
668 aa  136  2e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000334593  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1411  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.13 
 
 
892 aa  135  2e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3623  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.11 
 
 
669 aa  133  1e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3414  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 
687 aa  132  2e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  23.99 
 
 
698 aa  132  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2503  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.52 
 
 
744 aa  130  9e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.955771  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  26.42 
 
 
859 aa  129  2e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2159  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 
684 aa  129  2e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1746  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 
668 aa  127  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.35 
 
 
867 aa  126  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4089  putative heme utilization protein precursor  23.86 
 
 
851 aa  127  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0996  enterobactin receptor VctA  23.8 
 
 
659 aa  125  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  4.20276e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  26.17 
 
 
764 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47380  putative heme utilization protein precursor  23.86 
 
 
851 aa  125  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0440985  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.6 
 
 
750 aa  123  1e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4401  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 
756 aa  123  1e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.78723  normal  0.0995472 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1110  TonB-dependent receptor domain-containing protein  23.05 
 
 
716 aa  121  4e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4195  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.87 
 
 
849 aa  120  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0435  heavy metal transport/detoxification protein  25.74 
 
 
668 aa  120  7e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  25.3 
 
 
764 aa  120  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004277  TonB-dependent heme receptor  22.82 
 
 
730 aa  120  7e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1239  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.79 
 
 
646 aa  120  1e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.09 
 
 
862 aa  120  1e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1420  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.73 
 
 
739 aa  119  2e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.330075  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3124  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 
791 aa  119  2e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1564  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 
654 aa  118  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.364337  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1720  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  26.38 
 
 
885 aa  117  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95463  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1603  TonB-dependent receptor, plug  30 
 
 
771 aa  117  9e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0535477  unclonable  5.14373e-07 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1599  TonB-dependent receptor, plug  23.92 
 
 
800 aa  116  1e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  3.04489e-07  unclonable  4.04036e-07 
 
 
 
NC_011663  Sbal223_2957  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.03 
 
 
739 aa  116  1e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.910627 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1397  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.14 
 
 
739 aa  115  2e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1308  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.58 
 
 
737 aa  115  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1381  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.14 
 
 
739 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20010  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  25.89 
 
 
891 aa  115  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0486368  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 
679 aa  115  4e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03722  outer membrane hemin receptor signal peptide protein  25.64 
 
 
741 aa  114  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000281288  normal  0.0836882 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3030  putaive Fe-regulated protein B precursor  24.79 
 
 
693 aa  114  8e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  3.10305e-05  hitchhiker  0.000241006 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4086  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.04 
 
 
783 aa  113  1e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3638  TonB-dependent receptor, putative  25.32 
 
 
739 aa  113  1e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240989 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3894  TonB-dependent heme receptor HasR  25.04 
 
 
830 aa  112  2e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1580  TonB-dependent heme receptor  21.82 
 
 
737 aa  112  2e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0130  TonB-dependent heme receptor HasR  25.32 
 
 
830 aa  112  2e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2862  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.13 
 
 
737 aa  112  2e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0664764 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 
662 aa  112  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0389  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 
667 aa  111  4e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  23.09 
 
 
639 aa  110  8e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  24.37 
 
 
635 aa  110  8e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  24.79 
 
 
653 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1093  TonB dependent receptor domain-containing protein  23.59 
 
 
654 aa  110  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 
649 aa  110  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.54 
 
 
728 aa  110  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 
653 aa  110  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1190  TonB dependent receptor domain-containing protein  22.83 
 
 
661 aa  108  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0340628  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1206  putative TonB-dependent receptor  23.37 
 
 
688 aa  109  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  31.9 
 
 
712 aa  109  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 
662 aa  108  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2622  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 
743 aa  108  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00560047  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2139  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.59 
 
 
766 aa  107  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  31.6 
 
 
861 aa  107  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2132  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  22.85 
 
 
689 aa  105  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100193  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>