38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0936 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_0675  hypothetical protein  75.06 
 
 
481 aa  708  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0234348 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0936  hypothetical protein  100 
 
 
468 aa  969  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  1.04038e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0810  hypothetical protein  77.37 
 
 
467 aa  753  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.682214  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0721  hypothetical protein  73.12 
 
 
491 aa  745  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  4.60382e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3793  hypothetical protein  73.93 
 
 
465 aa  714  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  1.78587e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0670  hypothetical protein  73.35 
 
 
469 aa  711  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0970  hypothetical protein  99.36 
 
 
468 aa  964  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  2.1772e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0790  hypothetical protein  76.67 
 
 
461 aa  730  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0693  hypothetical protein  49.2 
 
 
454 aa  405  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1184  hypothetical protein  25.82 
 
 
410 aa  128  2e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0905  hypothetical protein  23.95 
 
 
451 aa  114  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2247  hypothetical protein  26.48 
 
 
431 aa  112  1e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.310158 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0930  hypothetical protein  25 
 
 
419 aa  110  8e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.08303e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2973  hypothetical protein  28.87 
 
 
490 aa  107  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000455039  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1315  putative signal peptide protein  23.98 
 
 
372 aa  102  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  3.48515e-12  n/a   
 
 
 
NC_008700  Sama_0589  phosphate-selective porin O and P  24.84 
 
 
391 aa  99.8  9e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  4.99281e-08  unclonable  1.11386e-05 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0447  hypothetical protein  23.1 
 
 
413 aa  97.1  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1905  hypothetical protein  27.44 
 
 
505 aa  95.5  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0425  hypothetical protein  22.84 
 
 
413 aa  94.4  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  1.66547e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1567  hypothetical protein  25 
 
 
447 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3120  phosphate-selective porin O and P  23.86 
 
 
390 aa  90.1  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  4.6634e-07  unclonable  5.72585e-06 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0706  putative signal peptide protein  24.83 
 
 
407 aa  89  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.278446  normal  0.126589 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0712  phosphate-selective porin O and P  24.3 
 
 
392 aa  88.6  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  9.88796e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0638  phosphate-selective porin O and P  24.57 
 
 
393 aa  88.2  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  2.22961e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2944  hypothetical protein  22.25 
 
 
420 aa  87  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.40156e-08  hitchhiker  0.0032138 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3788  phosphate-selective porin O and P  24.84 
 
 
395 aa  85.9  1e-15  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  2.64942e-07  decreased coverage  6.8158e-07 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2384  hypothetical protein  23.68 
 
 
450 aa  83.6  6e-15  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2296  hypothetical protein  23.68 
 
 
448 aa  83.6  7e-15  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.744575  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01730  putative signal peptide protein  22.13 
 
 
457 aa  83.2  9e-15  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3889  phosphate-selective porin O and P  24.41 
 
 
395 aa  82  2e-14  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.9269e-07  decreased coverage  0.000370882 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1559  phosphate-selective porin O and P  24.32 
 
 
458 aa  80.9  4e-14  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.186929 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1888  phosphate-selective porin O and P  24.32 
 
 
458 aa  80.9  4e-14  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00748844  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4035  phosphate-selective porin O and P  24.09 
 
 
391 aa  78.2  3e-13  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2014  phosphate-selective porin O and P  24.09 
 
 
393 aa  78.2  3e-13  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.637056  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4602  hypothetical protein  21.75 
 
 
392 aa  67  7e-10  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2437  hypothetical protein  23.81 
 
 
398 aa  66.6  1e-09  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  3.06411e-11  normal  0.0118778 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2608  hypothetical protein  29.41 
 
 
567 aa  65.9  2e-09  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1834  hypothetical protein  25.23 
 
 
471 aa  56.2  1e-06  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>