91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0832 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  74.3 
 
 		 889 aa  1243    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  51.22 
 
 		 849 aa  771    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  56.44 
 
 		 845 aa  858    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  95.28 
 
 		 889 aa  1680    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  52.6 
 
 		 840 aa  805    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  100 
 
 		 889 aa  1783    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  78.8 
 
 		 878 aa  1332    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  95.61 
 
 		 884 aa  1683    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  75.03 
 
 		 887 aa  1273    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  51.62 
 
 		 850 aa  746    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  54.24 
 
 		 865 aa  888    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  95.05 
 
 		 879 aa  1670    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  73.55 
 
 		 897 aa  1225    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  74.57 
 
 		 887 aa  1271    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  42.61 
 
 		 836 aa  630  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  43.19 
 
 		 836 aa  630  1e-179  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2956  putative ABC transport system permease protein  43.72 
 
 		 872 aa  550  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  30.22 
 
 		 817 aa  300  5e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  28.27 
 
 		 817 aa  279  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  28.28 
 
 		 817 aa  278  3e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  29.14 
 
 		 836 aa  266  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  29.23 
 
 		 820 aa  249  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  31 
 
 		 825 aa  241  5e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  30.71 
 
 		 826 aa  225  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  28.31 
 
 		 819 aa  223  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2172  hypothetical protein  30.32 
 
 		 820 aa  220  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78559 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  29.08 
 
 		 821 aa  214  7e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0079  hypothetical protein  30.09 
 
 		 821 aa  213  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  27.54 
 
 		 800 aa  211  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  30.6 
 
 		 819 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  30.71 
 
 		 819 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  27.63 
 
 		 850 aa  204  7e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  27.59 
 
 		 849 aa  202  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1177  hypothetical protein  29.11 
 
 		 804 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00247698  normal  0.649292 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  29.09 
 
 		 815 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3353  predicted permease FtsX  28.5 
 
 		 800 aa  195  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.381061 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  25.93 
 
 		 803 aa  195  4e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  28.27 
 
 		 820 aa  195  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  27.92 
 
 		 821 aa  193  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  25.11 
 
 		 847 aa  189  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1579  ABC-type transporter protein  25.36 
 
 		 813 aa  188  4e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15291  normal  0.104036 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6285  ABC transporter membrane spanning protein  28.96 
 
 		 802 aa  183  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  25.24 
 
 		 855 aa  182  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  27.61 
 
 		 793 aa  180  9e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4687  hypothetical protein  27.18 
 
 		 821 aa  180  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  26.15 
 
 		 847 aa  179  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  27.41 
 
 		 870 aa  166  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  26.27 
 
 		 866 aa  166  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  26.59 
 
 		 837 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01331  hypothetical protein  24.03 
 
 		 929 aa  133  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  28.25 
 
 		 839 aa  124  9e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  28.31 
 
 		 845 aa  123  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2554  hypothetical protein  31.41 
 
 		 819 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  25.21 
 
 		 843 aa  122  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3021  hypothetical protein  29.36 
 
 		 795 aa  111  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00599694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  22.42 
 
 		 858 aa  111  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  25.94 
 
 		 846 aa  107  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  24.32 
 
 		 843 aa  94.7  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  21.13 
 
 		 857 aa  87  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  23.68 
 
 		 867 aa  85.9  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  21.38 
 
 		 851 aa  85.5  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  22.84 
 
 		 858 aa  84.3  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0310  hypothetical protein  26.45 
 
 		 753 aa  80.1  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  24.07 
 
 		 842 aa  79  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  25.45 
 
 		 842 aa  77.4  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  24.62 
 
 		 842 aa  76.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  21.95 
 
 		 846 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  24.7 
 
 		 841 aa  75.1  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  21.81 
 
 		 855 aa  74.7  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  21.08 
 
 		 849 aa  71.2  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  21.02 
 
 		 857 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  21.84 
 
 		 850 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1541  ABC transporter inner membrane protein  30.26 
 
 		 795 aa  69.3  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0192  hypothetical protein  30.26 
 
 		 795 aa  67.8  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0431471  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  22.53 
 
 		 868 aa  65.9  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  23.51 
 
 		 855 aa  63.9  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  21.57 
 
 		 849 aa  63.5  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  22.06 
 
 		 884 aa  62.4  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  20.92 
 
 		 853 aa  62.4  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  21.93 
 
 		 855 aa  56.2  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  22.31 
 
 		 835 aa  55.8  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  22.31 
 
 		 835 aa  55.8  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  23.78 
 
 		 877 aa  51.6  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  20.16 
 
 		 408 aa  50.8  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  20.88 
 
 		 844 aa  50.8  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  22.2 
 
 		 870 aa  49.3  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  23.17 
 
 		 877 aa  48.5  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  21.18 
 
 		 856 aa  48.5  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1211  protein of unknown function DUF214  28.07 
 
 		 787 aa  46.2  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.818892  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  27.27 
 
 		 643 aa  45.1  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  23.08 
 
 		 390 aa  44.3  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>