29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0780 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_3579  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  503  1e-142  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  1.10891e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0780  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  503  1e-142  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  7.62567e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0812  hypothetical protein  99.59 
 
 
245 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  5.86351e-08  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0805  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  474  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  4.15651e-10  hitchhiker  6.3684e-11 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0767  hypothetical protein  90.04 
 
 
231 aa  438  1e-122  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  8.36076e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0724  hypothetical protein  89.18 
 
 
231 aa  433  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  1.5789e-07  hitchhiker  0.00185842 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3237  hypothetical protein  89.18 
 
 
231 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  7.95933e-08  hitchhiker  1.10881e-05 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0752  hypothetical protein  88.31 
 
 
231 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  1.04845e-05  normal  0.017498 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3905  hypothetical protein  88.74 
 
 
231 aa  430  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3564  hypothetical protein  72.24 
 
 
245 aa  381  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.9199e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3333  hypothetical protein  69.8 
 
 
244 aa  352  3e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0150205  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4196  hypothetical protein  66.67 
 
 
249 aa  345  4e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000215538  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0773  hypothetical protein  64.17 
 
 
254 aa  338  7e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0548647  unclonable  7.96342e-11 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0543  hypothetical protein  66.4 
 
 
252 aa  337  8e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  7.18066e-06  normal  0.604176 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3226  hypothetical protein  59.59 
 
 
247 aa  310  2e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000725415  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3049  hypothetical protein  59.76 
 
 
246 aa  282  4e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00345897  normal  0.661514 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03591  hypothetical protein  37.3 
 
 
251 aa  160  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4757  hypothetical protein  36.55 
 
 
238 aa  150  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4040  hypothetical protein  32.28 
 
 
252 aa  143  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2088  hypothetical protein  28.63 
 
 
256 aa  99  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.100249  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1690  hypothetical protein  25.49 
 
 
231 aa  72  8e-12  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1688  hypothetical protein  27.09 
 
 
246 aa  71.6  1e-11  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136062  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3433  hypothetical protein  27.31 
 
 
209 aa  68.2  1e-10  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305533 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0133  hypothetical protein  26.56 
 
 
250 aa  65.1  1e-09  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3608  hypothetical protein  27.51 
 
 
199 aa  61.2  1e-08  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  2.90926e-05  normal  0.0278483 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00007  hypothetical protein  23.79 
 
 
221 aa  58.9  7e-08  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002348  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system component  22.94 
 
 
219 aa  55.5  9e-07  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2792  hypothetical protein  22.96 
 
 
221 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.17249  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0400  hypothetical protein  21.83 
 
 
232 aa  42.4  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.458276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>