25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0704 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0704  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000186245  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3650  hypothetical protein  98.39 
 
 
62 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000159809  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0725  hypothetical protein  98.39 
 
 
62 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00541071  hitchhiker  0.0000273453 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0746  hypothetical protein  80 
 
 
66 aa  111  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000197115  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0694  hypothetical protein  82.26 
 
 
62 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000619978  hitchhiker  0.0000301023 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0734  hypothetical protein  96.88 
 
 
64 aa  107  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00001969  hitchhiker  0.0032638 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3267  hypothetical protein  79.03 
 
 
62 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000144009  hitchhiker  0.0000321766 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0680  hypothetical protein  79.03 
 
 
62 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000282056  hitchhiker  0.000229174 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3938  hypothetical protein  79.03 
 
 
62 aa  105  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0508  hypothetical protein  70.77 
 
 
90 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000452311  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3292  hypothetical protein  72.58 
 
 
62 aa  99  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341896  hitchhiker  0.00104761 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4220  hypothetical protein  64.52 
 
 
62 aa  92.8  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000695961  hitchhiker  0.000271078 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3593  hypothetical protein  62.9 
 
 
62 aa  93.2  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000773085  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0749  hypothetical protein  67.86 
 
 
56 aa  87.8  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000984241  normal  0.0216774 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3358  hypothetical protein  62.3 
 
 
62 aa  82  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000675107  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00584  hypothetical protein  53.7 
 
 
60 aa  63.5  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00090  hypothetical protein  43.55 
 
 
62 aa  60.1  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0216  hypothetical protein  50.91 
 
 
61 aa  60.1  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002263  protein YjeT  47.27 
 
 
61 aa  59.3  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011306  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2762  hypothetical protein  45.45 
 
 
68 aa  57.4  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00943153  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0496  hypothetical protein  48 
 
 
66 aa  53.9  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2773  hypothetical protein  46 
 
 
61 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0359  hypothetical protein  46.34 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.246304  hitchhiker  0.00315014 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1092  hypothetical protein  33.87 
 
 
63 aa  47  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0539  hypothetical protein  42.11 
 
 
66 aa  40  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.174202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>