More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0568 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0592  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 
389 aa  788  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.887508 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0568  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  100 
 
 
389 aa  788  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00339328  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0599  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 
389 aa  788  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1418  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.9 
 
 
388 aa  399  1e-110  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0919  nucleotide sugar dehydrogenase  49.1 
 
 
388 aa  392  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00213667  normal  0.147124 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001761  UDP-glucose dehydrogenase  49.61 
 
 
388 aa  385  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1373  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.87 
 
 
388 aa  388  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2849  nucleotide sugar dehydrogenase  48.07 
 
 
388 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1330  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.84 
 
 
388 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.143594  decreased coverage  0.000414466 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1203  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.3 
 
 
388 aa  381  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.699954  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2961  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.84 
 
 
388 aa  380  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  2.04361e-06 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2319  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.84 
 
 
388 aa  379  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1032  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.59 
 
 
388 aa  378  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.366892 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01930  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.84 
 
 
388 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.586017  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01916  hypothetical protein  48.84 
 
 
388 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1629  nucleotide sugar dehydrogenase  48.84 
 
 
388 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00733567  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1572  nucleotide sugar dehydrogenase  47.04 
 
 
388 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1202  nucleotide sugar dehydrogenase  47.3 
 
 
389 aa  377  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.988641  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2259  udp-glucose 6-dehydrogenase  48.07 
 
 
388 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.389868  normal  0.025931 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2306  udp-glucose 6-dehydrogenase  47.81 
 
 
388 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0255325 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2418  udp-glucose 6-dehydrogenase  48.07 
 
 
388 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233828 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4687  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.48 
 
 
387 aa  375  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2205  udp-glucose 6-dehydrogenase  48.07 
 
 
388 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.638468  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00706  nucleotide sugar dehydrogenase  47.81 
 
 
388 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.56 
 
 
388 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0186642 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2929  nucleotide sugar dehydrogenase  46.79 
 
 
388 aa  374  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2641  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.04 
 
 
388 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1614  nucleotide sugar dehydrogenase  48.33 
 
 
388 aa  374  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.812894 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0591  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.3 
 
 
388 aa  372  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1349  nucleotide sugar dehydrogenase  47.56 
 
 
388 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3019  nucleotide sugar dehydrogenase  49.1 
 
 
397 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0876853 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.53 
 
 
388 aa  374  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112663  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1968  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.3 
 
 
389 aa  369  1e-101  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4088  phosphoglycerate mutase  48.19 
 
 
409 aa  368  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1387  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  48.07 
 
 
388 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.496605  hitchhiker  9.66488e-05 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1510  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  46.8 
 
 
390 aa  370  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3885  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  48.19 
 
 
409 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0800  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  46.91 
 
 
391 aa  366  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3483  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  48.07 
 
 
389 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.956099  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4273  nucleotide sugar dehydrogenase  47.67 
 
 
387 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2115  DNA gyrase, subunit A  47.04 
 
 
388 aa  363  3e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.539484 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1563  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.5 
 
 
397 aa  363  3e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.03127  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3978  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  47.41 
 
 
409 aa  362  5e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1795  nucleotide sugar dehydrogenase  44.99 
 
 
389 aa  360  2e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0071  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  47.41 
 
 
387 aa  360  3e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0720  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.02 
 
 
388 aa  360  3e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  8.75671e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4328  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  47.67 
 
 
387 aa  359  6e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4468  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  47.15 
 
 
387 aa  358  1e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2850  nucleotide sugar dehydrogenase  45.76 
 
 
388 aa  353  4e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217055  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2679  nucleotide sugar dehydrogenase  46.27 
 
 
388 aa  352  9e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00992  nucleotide sugar dehydrogenase  45.36 
 
 
395 aa  350  2e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000137814  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1067  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.85 
 
 
391 aa  343  3e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.575864  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3861  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.38 
 
 
398 aa  338  1e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0444005  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1498  nucleotide sugar dehydrogenase  43.56 
 
 
389 aa  337  2e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1737  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.79 
 
 
388 aa  325  8e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0900  hypothetical protein  41.88 
 
 
397 aa  320  2e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0374108 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1256  transcriptional regulator, XRE family  40.64 
 
 
491 aa  308  8e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0275  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase, dimerisation  39.39 
 
 
422 aa  286  4e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0309187  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0150  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.19 
 
 
372 aa  275  7e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0958685  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.56 
 
 
436 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  27.56 
 
 
436 aa  135  1e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  27.56 
 
 
435 aa  135  1e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.25 
 
 
438 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3078  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.01 
 
 
426 aa  133  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.455066  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  26.38 
 
 
438 aa  132  2e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  26.69 
 
 
467 aa  131  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0713  nucleotide sugar dehydrogenase  25.48 
 
 
437 aa  130  4e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.227984 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4994  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.65 
 
 
456 aa  130  5e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3200  UDP-glucose 6-dehydrogenase  25.76 
 
 
446 aa  129  8e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421836  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  26.2 
 
 
473 aa  129  8e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7670  nucleotide sugar dehydrogenase  25.21 
 
 
439 aa  129  9e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.888609  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.99 
 
 
451 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0400  nucleotide sugar dehydrogenase  26.04 
 
 
446 aa  127  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  26.04 
 
 
446 aa  127  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  23.55 
 
 
466 aa  127  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  25.35 
 
 
460 aa  127  4e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1513  nucleotide sugar dehydrogenase  27.78 
 
 
437 aa  127  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  25.14 
 
 
437 aa  126  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  25.42 
 
 
437 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  25.14 
 
 
437 aa  126  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29960  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase protein  23.76 
 
 
440 aa  126  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.32 
 
 
451 aa  126  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1348  UDP-glucose 6-dehydrogenase  25.99 
 
 
460 aa  126  8e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233315  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1764  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.25 
 
 
425 aa  126  8e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.796911  normal  0.409605 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  25.41 
 
 
450 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  26.55 
 
 
439 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1405  UDP-glucose 6-dehydrogenase  25.48 
 
 
440 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0875  UDP-glucose 6-dehydrogenase  25.13 
 
 
475 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180829  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  23.83 
 
 
447 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  25.63 
 
 
440 aa  124  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  25.99 
 
 
443 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5321  UDP-glucose 6-dehydrogenase  25.99 
 
 
441 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  25.48 
 
 
448 aa  124  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  25.41 
 
 
447 aa  124  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  24.93 
 
 
447 aa  124  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  24.86 
 
 
437 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  25.13 
 
 
440 aa  124  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  24.86 
 
 
437 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1719  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.2 
 
 
447 aa  123  5e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1466  UDP-glucose 6-dehydrogenase  26.32 
 
 
445 aa  123  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.434969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>