More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0555 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0586  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
455 aa  901  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  3.0167e-06  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0570  major facilitator transporter  84.77 
 
 
455 aa  741  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.42598e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0580  major facilitator transporter  100 
 
 
455 aa  901  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  9.44901e-05  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4029  transporter, putative  91.65 
 
 
455 aa  811  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0639  major facilitator transporter  92.31 
 
 
455 aa  815  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00996628  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3420  major facilitator transporter  94.73 
 
 
455 aa  816  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  6.01324e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3754  major facilitator transporter  100 
 
 
455 aa  901  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  1.39158e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3711  major facilitator transporter  86.59 
 
 
455 aa  763  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.34514e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4026  major facilitator transporter  87.42 
 
 
455 aa  762  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000155639  hitchhiker  3.027e-09 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3314  major facilitator transporter  83.08 
 
 
455 aa  711  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  9.2062e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3591  major facilitator transporter  94.73 
 
 
455 aa  832  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  3.19402e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0639  major facilitator transporter  86.31 
 
 
455 aa  735  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000191567  hitchhiker  4.8698e-06 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0532  major facilitator transporter  94.73 
 
 
455 aa  817  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  8.51019e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0555  major facilitator transporter  100 
 
 
455 aa  901  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  6.5492e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0534  major facilitator transporter  87.03 
 
 
455 aa  721  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  1.00009e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0515  transporter, putative  85.49 
 
 
455 aa  759  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.97153  normal  0.615177 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3390  major facilitator transporter  52.86 
 
 
455 aa  496  1e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0922  major facilitator family transporter  54.85 
 
 
454 aa  481  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2294  major facilitator family transporter  50.68 
 
 
458 aa  403  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.843575  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2228  major facilitator transporter  46.52 
 
 
461 aa  397  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.568651  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0655  major facilitator family transporter  48.98 
 
 
464 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3022  major facilitator transporter  48.67 
 
 
472 aa  390  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.358015  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4519  major facilitator transporter  47.95 
 
 
464 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal  0.140313 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5050  general substrate transporter  47.71 
 
 
465 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4719  major facilitator transporter  48.17 
 
 
464 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.210959 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0513  major facilitator transporter  48.4 
 
 
464 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0437  major facilitator transporter  47.23 
 
 
453 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.630168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0517  major facilitator transporter  48.17 
 
 
464 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0921044 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2425  major facilitator transporter  45.33 
 
 
458 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112572  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0484  major facilitator family transporter  47.95 
 
 
464 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3274  major facilitator superfamily MFS_1  42.73 
 
 
454 aa  361  1e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1037  major facilitator superfamily MFS_1  42.51 
 
 
454 aa  358  1e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0499  major facilitator transporter  42.35 
 
 
454 aa  357  2e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0349  transporter, major facilitator family  42.13 
 
 
454 aa  357  2e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0459  major facilitator transporter  42.35 
 
 
454 aa  357  2e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00379  hypothetical protein  42.35 
 
 
454 aa  357  2e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00375  predicted transporter  42.35 
 
 
454 aa  357  2e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0463  major facilitator transporter  42.35 
 
 
454 aa  357  2e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0511  transporter, major facilitator family  42.13 
 
 
454 aa  357  2e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.905004  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3877  major facilitator transporter  49.23 
 
 
464 aa  356  5e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3182  major facilitator superfamily MFS_1  41.91 
 
 
454 aa  356  6e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.565255  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3206  major facilitator transporter  41.91 
 
 
454 aa  356  6e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  9.0157e-05 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3066  major facilitator transporter  42.99 
 
 
456 aa  355  1e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  41.57 
 
 
462 aa  355  1e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  8.04058e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3246  major facilitator transporter  42.99 
 
 
454 aa  354  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3103  major facilitator transporter  42.99 
 
 
454 aa  354  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.973708  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06530  major facilitator family transporter  46.95 
 
 
462 aa  353  3e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0804742  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0422  hypothetical protein  41.29 
 
 
455 aa  353  4e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1085  major facilitator transporter  44.42 
 
 
454 aa  351  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  5.02867e-06 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0398  hypothetical protein  40.85 
 
 
455 aa  350  3e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2691  major facilitator family transporter  45.56 
 
 
454 aa  350  4e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0232907  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00225  transporter, putative  43.15 
 
 
442 aa  347  2e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0475  inner membrane transport protein YajR  42.47 
 
 
454 aa  346  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0496  inner membrane transport protein YajR  42.47 
 
 
454 aa  346  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0477  inner membrane transport protein YajR  42.02 
 
 
454 aa  346  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0483  inner membrane transport protein YajR  42.25 
 
 
454 aa  345  8e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0538  inner membrane transport protein YajR  42.25 
 
 
454 aa  345  8e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342738  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0747  major facilitator superfamily transporter  46.92 
 
 
456 aa  345  1e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.726619  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0449  major facilitator transporter  44.69 
 
 
460 aa  343  3e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.780134  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3078  major facilitator superfamily MFS_1  41.43 
 
 
457 aa  342  7e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0147  major facilitator transporter  44.37 
 
 
447 aa  340  3e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00532469  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2887  major facilitator superfamily MFS_1  40.27 
 
 
455 aa  337  3e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09195  major facilitator transporter  49.5 
 
 
462 aa  336  5e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0308711  normal  0.679663 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0867  major facilitator transporter  49.26 
 
 
454 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551059  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0894  major facilitator transporter  39.16 
 
 
453 aa  333  3e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298012  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0995  DNA polymerase III, alpha subunit  42.12 
 
 
471 aa  324  2e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  8.12271e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1822  transporter, MFS superfamily  40.37 
 
 
458 aa  320  3e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  3.42182e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0371  major facilitator family transporter  40.74 
 
 
458 aa  320  3e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  3.4034e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2141  major facilitator superfamily MFS_1  43.38 
 
 
462 aa  309  5e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.154122 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1959  major facilitator transporter  41.88 
 
 
454 aa  307  3e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00498964  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1684  sugar efflux MFS family transporter  41.19 
 
 
454 aa  303  5e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0955  major facilitator superfamily MFS_1  44.61 
 
 
465 aa  301  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.903849  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0813  major facilitator family transporter  44.61 
 
 
465 aa  301  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0421  putative multidrug-efflux transporter transmembrane protein  45.27 
 
 
387 aa  298  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107977  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0276  major facilitator superfamily MFS_1  46.04 
 
 
387 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4248  major facilitator transporter  42.6 
 
 
452 aa  298  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.718043  unclonable  2.0202e-12 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0303  major facilitator superfamily MFS_1  46.04 
 
 
394 aa  297  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189721  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0271  major facilitator transporter  37.21 
 
 
469 aa  296  6e-79  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  decreased coverage  0.00524997  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0482  major facilitator transporter  45.41 
 
 
407 aa  293  3e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3773  major facilitator transporter  43.91 
 
 
416 aa  288  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6572  major facilitator transporter  40.51 
 
 
395 aa  287  3e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2747  major facilitator transporter  47.59 
 
 
406 aa  286  5e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6108  major facilitator transporter  40.77 
 
 
395 aa  285  1e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2838  major facilitator transporter  40.77 
 
 
395 aa  283  6e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0298937  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2696  major facilitator transporter  41.09 
 
 
385 aa  282  8e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.236302 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1993  major facilitator transporter  40.93 
 
 
454 aa  280  3e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  2.56386e-08  decreased coverage  9.79309e-05 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3308  major facilitator superfamily MFS_1  45.56 
 
 
401 aa  280  5e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0575835  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0340  major facilitator transporter  41.6 
 
 
385 aa  279  7e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2778  major facilitator transporter  40.26 
 
 
395 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2164  major facilitator transporter  40.26 
 
 
395 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570545  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2789  major facilitator transporter  40.57 
 
 
385 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0499  major facilitator family transporter  41.34 
 
 
478 aa  273  7e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.788244  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0062  major facilitator family transporter  41.03 
 
 
395 aa  272  8e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.906812  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1528  major facilitator family transporter  41.03 
 
 
395 aa  272  8e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0780  major facilitator family transporter  41.34 
 
 
490 aa  272  9e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.114821  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2956  major facilitator family transporter  41.34 
 
 
385 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3094  major facilitator family transporter  41.34 
 
 
385 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.948927  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0595  major facilitator family transporter  41.34 
 
 
385 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0610  major facilitator family transporter  41.34 
 
 
385 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0537  major facilitator transporter  40.26 
 
 
395 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582222  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>