More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0506 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0531  secretion protein HlyD family protein  99.69 
 
 		 324 aa  654    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0506  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 324 aa  656    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3813  secretion protein HlyD family protein  99.38 
 
 		 324 aa  650    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103325  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0527  secretion protein HlyD family protein  99.69 
 
 		 324 aa  654    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0568004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0583  secretion protein HlyD family protein  94.44 
 
 		 324 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4089  HlyD family secretion protein  91.67 
 
 		 324 aa  585  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3463  secretion protein HlyD family protein  91.36 
 
 		 324 aa  583  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0488  secretion protein HlyD family protein  91.67 
 
 		 324 aa  585  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3639  secretion protein HlyD family protein  91.98 
 
 		 324 aa  586  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3729  secretion protein HlyD family protein  75.93 
 
 		 329 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0412  secretion protein HlyD family protein  78.82 
 
 		 323 aa  498  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.604128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4393  secretion protein HlyD family protein  81.93 
 
 		 323 aa  494  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0150137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3745  secretion protein HlyD family protein  80.69 
 
 		 323 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0567  secretion protein HlyD family protein  79.13 
 
 		 323 aa  474  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.142155 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0478  HlyD family secretion protein  72.81 
 
 		 322 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.161841 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003317  membrane-fusion protein  57.46 
 
 		 326 aa  381  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1212  hypothetical protein  58.36 
 
 		 324 aa  369  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000214097  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0618  putative secretion protein, HlyD family  53.89 
 
 		 326 aa  345  7e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1840  hypothetical protein  55.38 
 
 		 332 aa  342  7e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.137202  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02435  hypothetical protein  58.23 
 
 		 326 aa  340  2e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0477  hypothetical protein  53.73 
 
 		 332 aa  319  3e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0396  secretion protein HlyD family protein  53.42 
 
 		 330 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1039  secretion protein HlyD  41.23 
 
 		 427 aa  248  1e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1026  secretion protein HlyD family protein  40.87 
 
 		 326 aa  244  9.999999999999999e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0604  secretion protein HlyD family protein  44.58 
 
 		 326 aa  241  2e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4571  secretion protein HlyD family protein  46.69 
 
 		 349 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1173  secretion protein HlyD family protein  46.18 
 
 		 337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0653  secretion protein HlyD family protein  39.94 
 
 		 357 aa  223  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0093  HlyD family secretion protein  40.62 
 
 		 331 aa  220  3e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0320304 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1189  secretion protein HlyD  38.19 
 
 		 323 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.315896  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2777  secretion protein HlyD family protein  38.19 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.991626  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2682  secretion protein HlyD family protein  38.19 
 
 		 323 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430212  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  35.02 
 
 		 323 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0499  secretion protein HlyD family protein  35.62 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  34.7 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4808  secretion protein HlyD family protein  35.53 
 
 		 330 aa  176  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2703  secretion protein HlyD family protein  35.9 
 
 		 367 aa  167  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1925  secretion protein HlyD family protein  31.94 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0178624 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  30.97 
 
 		 353 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2701  secretion protein HlyD family protein  28.84 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  30.03 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  29.25 
 
 		 335 aa  109  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2328  secretion protein HlyD  26.69 
 
 		 398 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  26.25 
 
 		 328 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0700  putative lipoprotein  31.6 
 
 		 359 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.64 
 
 		 462 aa  91.7  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  26.13 
 
 		 335 aa  87.4  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  31.86 
 
 		 349 aa  87.8  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  31.86 
 
 		 349 aa  86.7  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  26.37 
 
 		 326 aa  86.7  5e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  27.78 
 
 		 332 aa  86.3  7e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  27.24 
 
 		 331 aa  85.9  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  29.41 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2157  secretion protein HlyD family protein  28.35 
 
 		 357 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  29.07 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  25.33 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.71 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  28.01 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5975  hypothetical protein  27.8 
 
 		 382 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  28.15 
 
 		 357 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  26.22 
 
 		 335 aa  80.1  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1503  secretion protein HlyD family protein  28.86 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996003  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  28.52 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  26.22 
 
 		 375 aa  79.3  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  24.53 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  25.16 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3445  secretion protein HlyD family protein  27.99 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  23.43 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1013  secretion protein HlyD  25.78 
 
 		 394 aa  77.8  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69090  hypothetical protein  27.16 
 
 		 357 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  26.22 
 
 		 467 aa  77.4  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  25.97 
 
 		 331 aa  76.3  0.0000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003314  multidrug resistance efflux pump  26.89 
 
 		 354 aa  76.3  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  27.71 
 
 		 342 aa  75.9  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0809  secretion protein HlyD family protein  28.68 
 
 		 351 aa  75.9  0.0000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1056  multidrug resistance protein MdtN  31.32 
 
 		 349 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1943  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.04 
 
 		 450 aa  75.5  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  28.97 
 
 		 357 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  25.58 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  25.09 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0499  secretion protein HlyD family protein  25.86 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1793  hypothetical protein  27.55 
 
 		 347 aa  73.9  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0463341  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  23.72 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  24.91 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0760  secretion protein HlyD family protein  26.79 
 
 		 363 aa  72.8  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  25.89 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1794  secretion protein HlyD family protein  28.12 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  28.68 
 
 		 405 aa  72.4  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2687  HlyD family secretion protein  26.84 
 
 		 357 aa  72  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  25.58 
 
 		 339 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4577  secretion protein HlyD  24.55 
 
 		 354 aa  72  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.231546  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6207  secretion protein HlyD family protein  26.76 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  26.59 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0564  secretion protein HlyD family protein  25.55 
 
 		 343 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4698  hypothetical protein  24.57 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528303  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1744  secretion protein HlyD family protein  26.74 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348418 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3131  secretion protein HlyD  25.33 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0978227  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1949  secretion protein HlyD family protein  27.08 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.262528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1431  secretion protein HlyD  25.22 
 
 		 361 aa  70.1  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5580  multidrug resistance protein MdtN  29.84 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>