More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0430 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  70.01 
 
 
797 aa  1155  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  88.96 
 
 
817 aa  1460  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  100 
 
 
797 aa  1622  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.61093e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  88.67 
 
 
803 aa  1470  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  99.25 
 
 
797 aa  1611  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  9.41597e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  91.97 
 
 
812 aa  1504  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  92.1 
 
 
812 aa  1505  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  5.60682e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  99.37 
 
 
797 aa  1612  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  92.35 
 
 
812 aa  1509  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  97.24 
 
 
797 aa  1569  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  1.40414e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  42.55 
 
 
843 aa  622  1e-177  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  42.74 
 
 
853 aa  608  1e-172  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  38.92 
 
 
918 aa  529  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  38.15 
 
 
853 aa  524  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  37.66 
 
 
948 aa  522  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  38.34 
 
 
933 aa  513  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  39.72 
 
 
795 aa  496  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  39.67 
 
 
800 aa  495  1e-138  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  39.75 
 
 
803 aa  493  1e-138  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  40.61 
 
 
795 aa  495  1e-138  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  40.82 
 
 
800 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  5.69019e-05 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  39.54 
 
 
784 aa  491  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  38.54 
 
 
788 aa  481  1e-134  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  1.20084e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  38.29 
 
 
788 aa  477  1e-133  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  4.56142e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  37.82 
 
 
811 aa  475  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  36.43 
 
 
870 aa  465  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  1.76254e-05  unclonable  3.3388e-08 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  35.7 
 
 
848 aa  462  1e-128  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  36.19 
 
 
847 aa  458  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  34.9 
 
 
817 aa  450  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  35.95 
 
 
874 aa  445  1e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  38.11 
 
 
924 aa  445  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  37.73 
 
 
811 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  37.52 
 
 
793 aa  443  1e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  36.26 
 
 
961 aa  440  1e-122  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  35.6 
 
 
811 aa  440  1e-122  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  37.27 
 
 
793 aa  438  1e-121  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  35.8 
 
 
840 aa  436  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  36.48 
 
 
924 aa  436  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  34.22 
 
 
851 aa  427  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  36.59 
 
 
795 aa  424  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  35.67 
 
 
884 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  33.72 
 
 
857 aa  416  1e-115  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  36.74 
 
 
799 aa  416  1e-115  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  34.51 
 
 
868 aa  416  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  32.68 
 
 
861 aa  408  1e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  32.99 
 
 
858 aa  408  1e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  35 
 
 
835 aa  409  1e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  34.89 
 
 
867 aa  408  1e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  7.92676e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  33.1 
 
 
870 aa  403  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  6.3349e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  33.83 
 
 
864 aa  400  1e-110  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  33.79 
 
 
821 aa  402  1e-110  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  35.07 
 
 
883 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  35.21 
 
 
823 aa  396  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  33.66 
 
 
815 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  33.29 
 
 
871 aa  390  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  34.77 
 
 
842 aa  392  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  32.17 
 
 
1015 aa  392  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.9 
 
 
832 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  34.36 
 
 
887 aa  391  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  32 
 
 
867 aa  389  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  35.67 
 
 
850 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  34.52 
 
 
804 aa  375  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  33.79 
 
 
815 aa  369  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  33.93 
 
 
947 aa  362  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  33.29 
 
 
818 aa  360  5e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  30.85 
 
 
833 aa  350  8e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  31.34 
 
 
872 aa  346  1e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 
987 aa  344  4e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  33.88 
 
 
800 aa  340  5e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  32.99 
 
 
847 aa  335  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 
849 aa  334  4e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  31.53 
 
 
816 aa  331  3e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 
858 aa  317  7e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  30.9 
 
 
813 aa  300  6e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  29.61 
 
 
885 aa  288  4e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  33.66 
 
 
948 aa  285  3e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  29.65 
 
 
842 aa  279  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  26.81 
 
 
873 aa  259  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 
852 aa  258  4e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  33.46 
 
 
869 aa  246  1e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  32.75 
 
 
867 aa  245  2e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  33.47 
 
 
856 aa  238  3e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  33.01 
 
 
877 aa  234  5e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  5.78647e-05  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 
879 aa  232  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 
817 aa  191  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 
869 aa  179  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  27.59 
 
 
834 aa  173  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 
838 aa  166  2e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 
841 aa  160  7e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  28.06 
 
 
853 aa  156  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 
907 aa  153  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  1.65135e-05 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  25.25 
 
 
880 aa  153  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 
904 aa  147  6e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 
904 aa  144  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 
904 aa  136  1e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 
867 aa  130  8e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  37.1 
 
 
872 aa  123  1e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  38.05 
 
 
843 aa  122  2e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  40.89 
 
 
883 aa  122  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  40.89 
 
 
883 aa  122  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0195918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>