More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0409 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  61.83 
 
 
909 aa  1142  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0194  preprotein translocase subunit SecA  47.96 
 
 
931 aa  818  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1478  preprotein translocase, SecA subunit  53.75 
 
 
970 aa  901  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130752 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2218  protein translocase subunit secA  50.16 
 
 
886 aa  897  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.96185e-05  hitchhiker  1.70911e-09 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  59.89 
 
 
912 aa  1103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3079  preprotein translocase subunit SecA  57.97 
 
 
934 aa  1089  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3461  preprotein translocase subunit SecA  60.53 
 
 
936 aa  1110  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126577  decreased coverage  0.000173777 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0092  preprotein translocase subunit SecA  71.81 
 
 
901 aa  1355  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.05239e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  50 
 
 
866 aa  849  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2664  preprotein translocase subunit SecA  59.81 
 
 
936 aa  1117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3254  preprotein translocase, SecA subunit  50 
 
 
956 aa  914  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1959  preprotein translocase subunit SecA  60.33 
 
 
914 aa  1118  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0497  preprotein translocase subunit SecA  60.38 
 
 
931 aa  1123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433884  normal  0.665829 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  58.85 
 
 
921 aa  1091  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0745  preprotein translocase, SecA subunit  60.2 
 
 
919 aa  1120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.864781 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2039  preprotein translocase subunit SecA  60.22 
 
 
914 aa  1117  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1791  preprotein translocase, SecA subunit  51.39 
 
 
958 aa  934  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29973  normal  0.0159583 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2490  preprotein translocase subunit SecA  52.8 
 
 
899 aa  928  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0287  preprotein translocase subunit SecA  48.65 
 
 
964 aa  772  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.196625  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0511  preprotein translocase subunit SecA  51.19 
 
 
946 aa  918  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1410  preprotein translocase, SecA subunit  50.06 
 
 
787 aa  787  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.269916  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5352  preprotein translocase subunit SecA  48.46 
 
 
835 aa  852  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3540  preprotein translocase subunit SecA  54.51 
 
 
905 aa  965  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1220  preprotein translocase subunit SecA  53.97 
 
 
916 aa  944  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.811127 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0106  preprotein translocase subunit SecA  71.92 
 
 
901 aa  1357  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000279351  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2637  preprotein translocase subunit SecA  72.97 
 
 
907 aa  1376  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.064807  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0401  preprotein translocase, SecA subunit  59.4 
 
 
914 aa  1123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0753123 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0145  preprotein translocase subunit SecA  70.93 
 
 
901 aa  1347  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0153  preprotein translocase subunit SecA  70.93 
 
 
901 aa  1347  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00245139  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  50.83 
 
 
962 aa  914  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03250  preprotein translocase subunit SecA  70.45 
 
 
902 aa  1357  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0990  preprotein translocase subunit SecA  45.3 
 
 
944 aa  742  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  71.26 
 
 
901 aa  1352  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0148  preprotein translocase subunit SecA  70.93 
 
 
901 aa  1347  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541074 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0148  preprotein translocase subunit SecA  70.93 
 
 
901 aa  1347  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0611  preprotein translocase subunit SecA  60.09 
 
 
910 aa  1121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0539  preprotein translocase subunit SecA  60.66 
 
 
932 aa  1135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117164  normal  0.600522 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  89.1 
 
 
907 aa  1655  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  4.05863e-05  unclonable  6.59986e-08 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0737  preprotein translocase, SecA subunit  50.46 
 
 
963 aa  921  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0793771  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3567  preprotein translocase subunit SecA  49.84 
 
 
908 aa  891  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  54.66 
 
 
859 aa  959  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5838  preprotein translocase subunit SecA  48.07 
 
 
1018 aa  770  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198512  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  88.11 
 
 
907 aa  1653  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  5.17033e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  70.74 
 
 
910 aa  1339  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  88.55 
 
 
907 aa  1662  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  8.08939e-05  hitchhiker  2.70752e-06 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1072  preprotein translocase subunit SecA  49.29 
 
 
868 aa  823  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0016593  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0100  preprotein translocase subunit SecA  71.81 
 
 
901 aa  1355  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  3.73806e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0104  preprotein translocase subunit SecA  71.7 
 
 
901 aa  1353  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.13856e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00909  preprotein translocase subunit SecA  70.3 
 
 
909 aa  1303  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0657  preprotein translocase, SecA subunit  46.92 
 
 
1024 aa  808  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0383257  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1958  preprotein translocase subunit SecA  62.85 
 
 
916 aa  1193  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0512  preprotein translocase, SecA subunit  53 
 
 
931 aa  948  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.171651  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1730  preprotein translocase, SecA subunit  55.02 
 
 
935 aa  978  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1859  preprotein translocase subunit SecA  49.67 
 
 
869 aa  835  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0385967  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0938  preprotein translocase subunit SecA  50.93 
 
 
884 aa  853  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0910  preprotein translocase, SecA subunit  46.11 
 
 
971 aa  808  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.822535  normal  0.604814 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3205  preprotein translocase, SecA subunit  43.58 
 
 
1032 aa  739  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 
908 aa  1872  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  8.62629e-06 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0952  preprotein translocase subunit SecA  62.95 
 
 
911 aa  1182  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0825875  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0103  preprotein translocase subunit SecA  71.81 
 
 
901 aa  1355  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  7.42397e-05  normal  0.588036 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3559  preprotein translocase subunit SecA  71.81 
 
 
901 aa  1355  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0691587  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  71.22 
 
 
904 aa  1336  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2080  preprotein translocase subunit SecA  49.52 
 
 
903 aa  889  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.240841  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0922  preprotein translocase subunit SecA  53.06 
 
 
921 aa  922  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.666696  normal  0.803255 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4504  preprotein translocase subunit SecA  62.84 
 
 
911 aa  1181  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.626117  normal  0.321906 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  48.46 
 
 
897 aa  875  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  2.53416e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4982  preprotein translocase subunit SecA  47.65 
 
 
835 aa  838  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1478  preprotein translocase, SecA subunit  54.43 
 
 
970 aa  904  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.301651  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  71.22 
 
 
904 aa  1336  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0239  preprotein translocase subunit SecA  62.75 
 
 
913 aa  1191  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.684893  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2827  preprotein translocase subunit SecA  60.02 
 
 
932 aa  1126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235252  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0863  preprotein translocase subunit SecA  46.49 
 
 
824 aa  756  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0619112  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5497  preprotein translocase subunit SecA  60.11 
 
 
915 aa  1131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.441973  normal  0.259871 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0256  preprotein translocase, SecA subunit  47.05 
 
 
858 aa  800  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  9.54938e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  71.22 
 
 
904 aa  1336  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3738  preprotein translocase, SecA subunit  46.92 
 
 
947 aa  833  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.361446  normal  0.764216 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3628  preprotein translocase, SecA subunit  46.13 
 
 
950 aa  778  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0804577  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  51.94 
 
 
1067 aa  775  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1999  preprotein translocase, SecA subunit  58.77 
 
 
920 aa  1095  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.974197  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3771  preprotein translocase subunit SecA  69.53 
 
 
916 aa  1313  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0995653  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  48.9 
 
 
837 aa  845  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  49.41 
 
 
888 aa  880  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1366  preprotein translocase, SecA subunit  49.76 
 
 
997 aa  768  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.779073  normal  0.444827 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  53.34 
 
 
836 aa  908  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  50.77 
 
 
872 aa  878  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.11083e-06  unclonable  3.74715e-10 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2553  preprotein translocase, SecA subunit  51.39 
 
 
796 aa  839  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2000  preprotein translocase, SecA subunit  46.11 
 
 
934 aa  785  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  1.1814e-06 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1290  preprotein translocase, SecA subunit  46.24 
 
 
916 aa  793  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.793107 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1822  preprotein translocase, SecA subunit  48.17 
 
 
906 aa  769  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  51.69 
 
 
838 aa  899  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20600  protein translocase subunit secA  47.13 
 
 
985 aa  756  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.648191  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1249  preprotein translocase, SecA subunit  45.97 
 
 
904 aa  747  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004483  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  70.3 
 
 
909 aa  1310  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4035  preprotein translocase, SecA subunit  49.53 
 
 
954 aa  819  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1388  preprotein translocase, SecA subunit  48.35 
 
 
859 aa  820  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0777  preprotein translocase subunit SecA  48.83 
 
 
933 aa  837  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.648887  normal  0.618411 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1081  preprotein translocase, SecA subunit  47.77 
 
 
917 aa  761  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2325  preprotein translocase, SecA subunit  48.71 
 
 
933 aa  770  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0666996  hitchhiker  1.17576e-05 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1857  preprotein translocase SecA subunit  46.19 
 
 
955 aa  799  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.137741  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2191  preprotein translocase, SecA subunit  61.24 
 
 
928 aa  1120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>