More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0353 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  100 
 
 		 210 aa  436  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  100 
 
 		 210 aa  436  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  100 
 
 		 210 aa  436  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  99.52 
 
 		 210 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  96.62 
 
 		 224 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  94.2 
 
 		 207 aa  410  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  93.72 
 
 		 207 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  94.2 
 
 		 224 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  94.2 
 
 		 207 aa  409  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  86.41 
 
 		 207 aa  377  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  86.41 
 
 		 207 aa  375  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  84.47 
 
 		 207 aa  371  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  82.61 
 
 		 210 aa  365  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0365  guanylate kinase  84.47 
 
 		 207 aa  366  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3497  guanylate kinase  82.04 
 
 		 207 aa  358  2e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0266  guanylate kinase  76.7 
 
 		 207 aa  338  2.9999999999999998e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  67.32 
 
 		 207 aa  291  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  67.32 
 
 		 207 aa  291  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  67.32 
 
 		 207 aa  291  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  67.32 
 
 		 207 aa  291  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  67.32 
 
 		 207 aa  291  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  66.83 
 
 		 207 aa  289  3e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  66.83 
 
 		 207 aa  289  3e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  66.83 
 
 		 207 aa  289  3e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  66.83 
 
 		 207 aa  289  3e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  66.83 
 
 		 207 aa  289  3e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  66.83 
 
 		 207 aa  289  3e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  66.83 
 
 		 207 aa  289  3e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  66.83 
 
 		 207 aa  289  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  65.85 
 
 		 207 aa  287  9e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5020  guanylate kinase  66.34 
 
 		 207 aa  286  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  64.88 
 
 		 207 aa  281  7.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00153  guanylate kinase  66.02 
 
 		 213 aa  280  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3948  guanylate kinase  65.37 
 
 		 207 aa  276  1e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.498976  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  64.88 
 
 		 207 aa  275  3e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00630  guanylate kinase  64.88 
 
 		 207 aa  275  3e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0347  guanylate kinase  62.68 
 
 		 215 aa  274  7e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3623  guanylate kinase  62.8 
 
 		 207 aa  274  8e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4971  guanylate kinase  64.11 
 
 		 218 aa  273  2.0000000000000002e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2280  guanylate kinase  64.39 
 
 		 229 aa  271  4.0000000000000004e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0045  guanylate kinase  62.75 
 
 		 207 aa  268  4e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4176  guanylate kinase  62.25 
 
 		 207 aa  267  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0297777  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0041  guanylate kinase  62.25 
 
 		 207 aa  267  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0210  guanylate kinase  63.41 
 
 		 207 aa  266  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4867  guanylate kinase  64.39 
 
 		 207 aa  265  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807857  hitchhiker  0.00555507 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1457  guanylate kinase  60.87 
 
 		 212 aa  262  3e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4209  guanylate kinase  65.37 
 
 		 207 aa  258  3e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4492  guanylate kinase  64.88 
 
 		 207 aa  256  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5296  guanylate kinase  60.4 
 
 		 206 aa  255  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0446222  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5204  guanylate kinase  59.9 
 
 		 206 aa  255  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.952406  normal  0.288026 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5344  guanylate kinase  58.91 
 
 		 206 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3187  Guanylate kinase  55.88 
 
 		 210 aa  243  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  58.42 
 
 		 203 aa  242  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70440  guanylate kinase  57.43 
 
 		 203 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3695  guanylate kinase  56.31 
 
 		 225 aa  241  5e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0177  guanylate kinase  56.44 
 
 		 206 aa  241  7e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000695034 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6112  guanylate kinase  56.93 
 
 		 203 aa  239  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4388  guanylate kinase  55.83 
 
 		 205 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.11044 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2975  guanylate kinase  56.93 
 
 		 204 aa  236  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2138  guanylate kinase  55 
 
 		 205 aa  236  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.585915  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2003  guanylate kinase  54.19 
 
 		 216 aa  234  6e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0976  guanylate kinase  55.67 
 
 		 211 aa  234  6e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.194665  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0110  guanylate kinase  54.36 
 
 		 204 aa  234  7e-61  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.361568  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02830  guanylate kinase  53.4 
 
 		 205 aa  233  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0211  guanylate kinase  54.07 
 
 		 214 aa  231  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5549  guanylate kinase  56.44 
 
 		 206 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0075  guanylate kinase  53.59 
 
 		 214 aa  230  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4384  guanylate kinase  53.69 
 
 		 207 aa  228  4e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  55.56 
 
 		 202 aa  228  6e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0035  guanylate kinase  54.19 
 
 		 209 aa  226  1e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0048  guanylate kinase  53.47 
 
 		 202 aa  224  5.0000000000000005e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2003  guanylate kinase  52.22 
 
 		 208 aa  224  8e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1723  guanylate kinase  52.22 
 
 		 208 aa  223  1e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.671499 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4019  guanylate kinase  56.08 
 
 		 204 aa  223  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0429  guanylate kinase  54.69 
 
 		 218 aa  222  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2401  guanylate kinase  54.5 
 
 		 227 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0634  guanylate kinase  52.45 
 
 		 210 aa  221  6e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0871  guanylate kinase  54.5 
 
 		 227 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0859  guanylate kinase  54.5 
 
 		 227 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675802  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0577  guanylate kinase  50 
 
 		 204 aa  216  1e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.213259  normal  0.177715 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0959  guanylate kinase  54 
 
 		 227 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.465114  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2473  guanylate kinase  53.5 
 
 		 216 aa  216  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.276793  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0520  guanylate kinase  54 
 
 		 227 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0999  guanylate kinase  54 
 
 		 227 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1212  guanylate kinase  51.74 
 
 		 203 aa  215  5e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0815  guanylate kinase  52.5 
 
 		 227 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.605718  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2096  guanylate kinase  52.5 
 
 		 227 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3049  guanylate kinase  52.5 
 
 		 227 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3015  guanylate kinase  52.5 
 
 		 227 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1964  guanylate kinase  52.5 
 
 		 227 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.736317  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2949  guanylate kinase  52.5 
 
 		 227 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.391895  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2648  guanylate kinase  52.5 
 
 		 227 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0473  guanylate kinase  54.5 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1586  guanylate kinase  52.5 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0562043  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4107  guanylate kinase  53 
 
 		 227 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0130992  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0052  guanylate kinase  50.25 
 
 		 210 aa  212  2.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00408303  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0856  guanylate kinase  53.97 
 
 		 216 aa  212  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0717  guanylate kinase  51.96 
 
 		 212 aa  210  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116826 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0563  guanylate kinase  51.96 
 
 		 212 aa  210  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  50.77 
 
 		 220 aa  210  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>