74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0255 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0255  protein of unknown function Spy-related  100 
 
 
174 aa  357  4e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  4.30973e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0262  protein of unknown function Spy-related  97.13 
 
 
174 aa  325  2e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00734825  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0257  protein of unknown function Spy-related  97.13 
 
 
174 aa  323  7e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  6.63543e-06  decreased coverage  1.15808e-05 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0262  hypothetical protein  97.13 
 
 
174 aa  323  7e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  5.18811e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0253  protein of unknown function, Spy-related  79.31 
 
 
163 aa  264  4e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  2.05349e-05  hitchhiker  0.000372635 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0254  protein of unknown function, Spy-related  77.59 
 
 
163 aa  261  4e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  5.50011e-05  hitchhiker  1.61676e-09 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0368  protein of unknown function, Spy-related  75.86 
 
 
163 aa  258  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  5.28053e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4476  spheroplast protein y precursor, putative  72.57 
 
 
163 aa  245  3e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0280  protein of unknown function, Spy-related  49.69 
 
 
168 aa  140  1e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  5.25037e-06  unclonable  8.29203e-11 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0313  spheroplast protein y precursor, putative  43.35 
 
 
163 aa  129  2e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.63608e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0282  protein of unknown function Spy-related  43.83 
 
 
154 aa  128  4e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.26692e-08  unclonable  2.42912e-08 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3569  protein of unknown function, Spy-related  41.14 
 
 
147 aa  116  2e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  2.21664e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3932  protein of unknown function Spy-related  41.88 
 
 
160 aa  115  2e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.05476e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3431  spheroplast protein y precursor, putative  42.86 
 
 
163 aa  107  7e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  1.29305e-05  normal  0.324571 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3460  spheroplast protein y precursor, putative  37.65 
 
 
181 aa  106  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  6.6442e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01700  hypothetical protein  38.84 
 
 
161 aa  79.7  2e-14  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01712  envelope stress induced periplasmic protein  38.84 
 
 
161 aa  79.7  2e-14  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3500  protein of unknown function Spy-related  36.36 
 
 
158 aa  77.4  8e-14  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1825  periplasmic protein  38.02 
 
 
161 aa  77  1e-13  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1899  protein of unknown function Spy-related protein  38.02 
 
 
161 aa  77  1e-13  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185725  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1987  periplasmic protein  37.19 
 
 
156 aa  75.5  3e-13  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.243751  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1448  periplasmic protein  37.19 
 
 
161 aa  75.5  4e-13  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.351784 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1889  periplasmic protein  37.19 
 
 
161 aa  75.1  5e-13  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2461  periplasmic protein  37.19 
 
 
161 aa  75.1  5e-13  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.771279 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1964  periplasmic protein  37.19 
 
 
161 aa  75.1  5e-13  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1864  periplasmic protein  36.72 
 
 
161 aa  72.8  2e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.978086  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1421  periplasmic protein  36.72 
 
 
161 aa  73.2  2e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.168395  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2037  periplasmic protein  36.72 
 
 
161 aa  72.8  2e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195484  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1436  periplasmic protein  36.72 
 
 
161 aa  72.8  2e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1404  periplasmic protein  36.72 
 
 
161 aa  72.4  3e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.181136 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1701  periplasmic protein  36.59 
 
 
162 aa  72.4  3e-12  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3377  protein of unknown function Spy-related  30.86 
 
 
157 aa  67  1e-10  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4131  periplasmic stress adaptor protein CpxP  32.1 
 
 
162 aa  62.4  3e-09  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  3.37772e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0082  periplasmic stress adaptor protein CpxP  32.1 
 
 
162 aa  62.4  3e-09  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0085  periplasmic stress adaptor protein CpxP  32.1 
 
 
162 aa  62.4  3e-09  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.359879  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0539  periplasmic protein  29.92 
 
 
162 aa  58.5  4e-08  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4059  periplasmic repressor CpxP  31.43 
 
 
166 aa  57  1e-07  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  3.56086e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2796  putative periplasmic protein CpxP  38 
 
 
168 aa  57  1e-07  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  2.03252e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00148  periplasmic repressor CpxP  36.84 
 
 
169 aa  56.6  2e-07  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4393  periplasmic repressor CpxP  27.63 
 
 
170 aa  56.6  2e-07  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4459  protein of unknown function, Spy-related  33.33 
 
 
159 aa  55.8  3e-07  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002220  P pilus assembly/Cpx signaling pathway, periplasmic inhibitor/zinc- resistance associated protein  32.26 
 
 
170 aa  55.5  4e-07  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  2.85493e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4741  periplasmic protein  30.61 
 
 
166 aa  55.1  5e-07  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0756  periplasmic protein  31.09 
 
 
162 aa  54.7  7e-07  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276898  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4104  periplasmic repressor CpxP  28.48 
 
 
166 aa  53.9  1e-06  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.477556  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4447  periplasmic repressor CpxP  28.48 
 
 
166 aa  53.9  1e-06  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4144  periplasmic repressor CpxP  28.48 
 
 
166 aa  53.9  1e-06  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4071  protein of unknown function Spy-related protein  28.48 
 
 
166 aa  53.9  1e-06  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4306  periplasmic repressor CpxP  28.48 
 
 
167 aa  53.9  1e-06  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24903  normal  0.013655 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5368  periplasmic repressor CpxP  28.48 
 
 
166 aa  53.9  1e-06  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4277  periplasmic repressor CpxP  27.21 
 
 
166 aa  52.8  2e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.5664 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4306  periplasmic repressor CpxP  27.21 
 
 
166 aa  53.5  2e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03799  periplasmic protein combats stress  26.97 
 
 
166 aa  53.1  2e-06  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.37018  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4458  periplasmic repressor CpxP  27.21 
 
 
166 aa  53.5  2e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4391  periplasmic repressor CpxP  27.21 
 
 
166 aa  53.5  2e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03748  hypothetical protein  26.97 
 
 
166 aa  53.1  2e-06  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.493824  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1751  hypothetical protein  31.4 
 
 
152 aa  52.8  2e-06  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  7.49705e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4347  periplasmic repressor CpxP  27.21 
 
 
166 aa  53.5  2e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.470719  hitchhiker  6.13131e-08 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1376  envelope stress induced periplasmic protein, Spy-related  33.01 
 
 
185 aa  50.8  9e-06  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3847  hypothetical protein  28.95 
 
 
149 aa  47.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.354276  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4809  periplasmic repressor of cpx regulon by interaction with CpxA, rescue from transitory stresses  27.67 
 
 
147 aa  46.6  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000567342 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3144  hypothetical protein  31.86 
 
 
178 aa  46.2  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0363  hypothetical protein  31.13 
 
 
180 aa  45.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0677  hypothetical protein  27.95 
 
 
159 aa  44.7  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  3.64222e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0129  putative stress resistance protein  28.89 
 
 
174 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.291155  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0137  putative stress resistance protein  30.17 
 
 
174 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0717  hypothetical protein  29.5 
 
 
170 aa  42.7  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2263  periplasmic repressor CpxP  27.15 
 
 
167 aa  42.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  7.48096e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1561  periplasmic repressor CpxP  29.81 
 
 
166 aa  42.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  2.04071e-08  unclonable  1.90173e-12 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2662  hypothetical protein  28.3 
 
 
162 aa  42  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.117533  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1674  hypothetical protein  28.87 
 
 
136 aa  41.2  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0320  hypothetical protein  26.49 
 
 
185 aa  41.2  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  4.49922e-06  hitchhiker  1.08776e-08 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1680  hypothetical protein  29.13 
 
 
136 aa  40.8  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1143  hypothetical protein  29.14 
 
 
178 aa  40.8  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>