More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0194 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_0048  elongation factor Tu  76.52 
 
 
396 aa  639  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  2.6192e-12  decreased coverage  9.37064e-25 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0319  elongation factor Tu  77.53 
 
 
397 aa  644  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  4.67982e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  78.73 
 
 
396 aa  650  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  1.51927e-06  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  78.73 
 
 
396 aa  650  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  4.5907e-07  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0198  elongation factor Tu  100 
 
 
394 aa  805  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  3.78702e-07  unclonable  1.27922e-05 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0186  elongation factor Tu  99.75 
 
 
394 aa  804  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  1.52251e-05  hitchhiker  0.000684703 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0182  elongation factor Tu  90.86 
 
 
394 aa  716  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  3.66988e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0170  elongation factor Tu  90.86 
 
 
394 aa  716  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  2.10333e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4548  elongation factor Tu  89.09 
 
 
394 aa  697  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  3.12961e-08  normal  0.015065 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0270  elongation factor Tu  88.32 
 
 
394 aa  692  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.76369e-08  normal  0.0281528 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4319  elongation factor Tu  92.13 
 
 
394 aa  722  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  2.3337e-07  unclonable  1.08013e-10 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4519  elongation factor Tu  87.31 
 
 
394 aa  690  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  3.4313e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3808  elongation factor Tu  87.31 
 
 
394 aa  689  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.7346e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4213  elongation factor Tu  87.31 
 
 
394 aa  689  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.91099e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0335  elongation factor Tu  77.53 
 
 
397 aa  644  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  3.34885e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2803  elongation factor Tu  89.06 
 
 
394 aa  695  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.8967e-08  normal  0.0748006 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3674  elongation factor Tu  89.34 
 
 
394 aa  700  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.19951e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0035  elongation factor Tu  76.77 
 
 
396 aa  643  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  7.75684e-07  hitchhiker  1.48389e-10 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3874  elongation factor Tu  77.27 
 
 
396 aa  643  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3864  elongation factor Tu  77.27 
 
 
396 aa  643  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0325  elongation factor Tu  79.24 
 
 
396 aa  654  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0223104  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0312  elongation factor Tu  79.24 
 
 
396 aa  654  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  8.14669e-07  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4704  elongation factor Tu  91.62 
 
 
394 aa  719  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  3.92421e-07  hitchhiker  3.9393e-05 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4692  elongation factor Tu  91.88 
 
 
394 aa  720  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  2.01844e-07  unclonable  3.72179e-08 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4428  elongation factor Tu  87.31 
 
 
394 aa  689  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  3.75004e-09  hitchhiker  9.74336e-06 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3620  elongation factor Tu  87.31 
 
 
394 aa  689  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  3.72822e-05  hitchhiker  0.00440714 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4045  elongation factor Tu  87.31 
 
 
394 aa  689  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  2.76048e-05  hitchhiker  0.00334828 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0374  elongation factor Tu  87.31 
 
 
394 aa  689  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00309992  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0332  elongation factor Tu  89.06 
 
 
394 aa  695  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000132948  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0278  elongation factor Tu  89.34 
 
 
394 aa  700  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  4.12884e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3535  elongation factor Tu  87.31 
 
 
394 aa  689  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000296499  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00233  elongation factor Tu  86.77 
 
 
394 aa  665  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3773  elongation factor Tu  98.22 
 
 
394 aa  794  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  1.80335e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3761  elongation factor Tu  98.22 
 
 
394 aa  794  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  7.88214e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3756  elongation factor Tu  88.07 
 
 
394 aa  693  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  1.75435e-06  decreased coverage  0.00120864 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0190  elongation factor Tu  88.07 
 
 
394 aa  693  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  2.35247e-06  normal  0.27842 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0051  elongation factor Tu  78.28 
 
 
396 aa  652  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  2.52436e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0039  elongation factor Tu  78.28 
 
 
396 aa  652  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  1.35478e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0156  elongation factor Tu  94.67 
 
 
394 aa  737  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  3.13949e-06  decreased coverage  5.1786e-05 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0144  elongation factor Tu  94.67 
 
 
394 aa  736  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  1.95175e-06  normal  0.039031 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  78.73 
 
 
396 aa  652  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  7.12008e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  78.73 
 
 
396 aa  652  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  78.73 
 
 
396 aa  652  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  78.73 
 
 
396 aa  652  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  78.73 
 
 
396 aa  652  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  1.63409e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3911  elongation factor Tu  81.06 
 
 
397 aa  661  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0156728  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3923  elongation factor Tu  81.06 
 
 
397 aa  661  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.375909  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2723  elongation factor Tu  87.56 
 
 
394 aa  689  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  4.08037e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00054  elongation factor Tu  86.77 
 
 
394 aa  665  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1870  elongation factor Tu  77.53 
 
 
397 aa  644  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  8.16391e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1856  elongation factor Tu  77.53 
 
 
397 aa  644  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000358768  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3918  elongation factor Tu  89.34 
 
 
394 aa  700  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  7.13111e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3867  elongation factor Tu  89.06 
 
 
394 aa  695  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.62451e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0194  elongation factor Tu  100 
 
 
394 aa  805  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  8.23717e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0182  elongation factor Tu  100 
 
 
394 aa  805  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  5.14209e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0835  elongation factor Tu  81.82 
 
 
397 aa  667  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.010413  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0822  elongation factor Tu  81.82 
 
 
400 aa  668  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0296542  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4278  elongation factor Tu  77.34 
 
 
407 aa  644  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  2.89642e-06  unclonable  6.40465e-12 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2043  elongation factor Tu  84.52 
 
 
396 aa  658  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  6.75899e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1860  elongation factor Tu  84.26 
 
 
396 aa  655  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  1.59791e-08  hitchhiker  0.00222583 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2774  elongation factor Tu  87.56 
 
 
394 aa  689  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  4.37207e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  78.73 
 
 
396 aa  652  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  3.73215e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  79.24 
 
 
396 aa  653  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  78.23 
 
 
396 aa  646  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2952  elongation factor Tu  76.31 
 
 
402 aa  637  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00124181  hitchhiker  1.07296e-06 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06230  elongation factor Tu  82.58 
 
 
397 aa  675  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06090  elongation factor Tu  82.58 
 
 
397 aa  675  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.878067  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  79.55 
 
 
396 aa  648  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  79.55 
 
 
396 aa  648  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  1.51481e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  77.27 
 
 
397 aa  635  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  77.27 
 
 
397 aa  635  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.07786e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  76.96 
 
 
396 aa  638  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  76.96 
 
 
396 aa  638  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0325  elongation factor Tu  78.73 
 
 
396 aa  635  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.275223  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0311  elongation factor Tu  78.73 
 
 
396 aa  635  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4070  elongation factor Tu  100 
 
 
394 aa  805  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  1.21217e-07  normal  0.0221008 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4058  elongation factor Tu  100 
 
 
394 aa  805  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  3.00553e-07  hitchhiker  4.24973e-09 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2974  elongation factor Tu  77.72 
 
 
396 aa  645  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0401  elongation factor Tu  90.1 
 
 
394 aa  706  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  2.73455e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3738  elongation factor Tu  90.1 
 
 
394 aa  706  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00744191  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002300  translation elongation factor Tu  86.51 
 
 
394 aa  664  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  1.49708e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002166  translation elongation factor Tu  86.51 
 
 
394 aa  664  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  1.48186e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0321  translation elongation factor Tu  76.71 
 
 
396 aa  637  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  7.05932e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0309  translation elongation factor Tu  76.71 
 
 
396 aa  637  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000161177  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4006  translation elongation factor Tu  88.83 
 
 
394 aa  696  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  3.5404e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0203  translation elongation factor Tu  88.83 
 
 
394 aa  696  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000670775  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  78.17 
 
 
395 aa  649  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  1.52961e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3827  translation elongation factor Tu  88.83 
 
 
394 aa  696  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000173466  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0198  translation elongation factor Tu  88.83 
 
 
394 aa  696  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  9.64902e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3892  elongation factor Tu  89.85 
 
 
394 aa  704  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00189739  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0319  elongation factor Tu  89.85 
 
 
394 aa  704  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  4.44857e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03809  hypothetical protein  87.31 
 
 
394 aa  689  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  2.41403e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03141  hypothetical protein  87.31 
 
 
394 aa  689  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00215275  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5445  elongation factor Tu  87.31 
 
 
394 aa  689  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  3.164e-08  hitchhiker  0.00264412 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4648  elongation factor Tu  87.31 
 
 
394 aa  689  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  4.79625e-06  normal  0.0327099 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  79.49 
 
 
396 aa  656  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  1.50197e-05  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  79.49 
 
 
396 aa  656  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  2.8539e-09  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  76.2 
 
 
396 aa  634  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  76.2 
 
 
396 aa  634  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  78.23 
 
 
396 aa  646  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>