More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0064 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0069  ribokinase-like domain-containing protein  98.43 
 
 
319 aa  649    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518061  normal  0.0251177 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0068  PfkB domain protein  97.81 
 
 
319 aa  642    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4285  ribokinase-like domain-containing protein  97.81 
 
 
319 aa  645    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0064  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
319 aa  657    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0067  ribokinase-like domain-containing protein  79.94 
 
 
319 aa  535  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000323678 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  79.94 
 
 
319 aa  535  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0069  ribokinase-like domain-containing protein  79.62 
 
 
319 aa  531  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.615124  hitchhiker  0.0000000296005 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3987  ribokinase-like domain-containing protein  64.17 
 
 
319 aa  402  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0334499  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2648  carbohydrate kinase  37.46 
 
 
336 aa  206  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00340862  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0931  PfkB  39.69 
 
 
323 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0595887  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0291  carbohydrate kinase  39.7 
 
 
337 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3387  ribokinase-like domain-containing protein  37.5 
 
 
335 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4346  ribokinase-like domain-containing protein  39.38 
 
 
323 aa  179  7e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.126881 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0561  carbohydrate kinase  36.56 
 
 
343 aa  172  5e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.335543 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1777  PfkB domain protein  36.53 
 
 
331 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00666  Sugar kinase, ribokinase family protein  35.98 
 
 
322 aa  171  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  35.46 
 
 
337 aa  166  6.9999999999999995e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01230  fructokinase  35.42 
 
 
328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0230962  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1272  fructokinase  34.69 
 
 
338 aa  160  4e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1240  ribokinase-like domain-containing protein  34.8 
 
 
338 aa  159  8e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.36269  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  36.45 
 
 
311 aa  158  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  32.62 
 
 
326 aa  155  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  34.7 
 
 
307 aa  152  7e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  33.02 
 
 
298 aa  150  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  29.82 
 
 
322 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  33.13 
 
 
323 aa  149  5e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  34.69 
 
 
317 aa  149  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  33.97 
 
 
304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  33.97 
 
 
304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  28.7 
 
 
322 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  31.75 
 
 
323 aa  142  6e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  33.65 
 
 
306 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  31.53 
 
 
307 aa  138  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  33.13 
 
 
319 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  30.72 
 
 
319 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  30.43 
 
 
308 aa  135  7.000000000000001e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  30.09 
 
 
319 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  31.85 
 
 
311 aa  134  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  30.84 
 
 
309 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  30.72 
 
 
319 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  29.01 
 
 
323 aa  132  9e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  28.35 
 
 
319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  30.09 
 
 
319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  30.41 
 
 
319 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  29.45 
 
 
319 aa  129  7.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  30.98 
 
 
319 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  30.98 
 
 
319 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  29.66 
 
 
313 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  29.66 
 
 
313 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  29.66 
 
 
313 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  29.97 
 
 
313 aa  123  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  29.05 
 
 
313 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  30.96 
 
 
315 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  31.21 
 
 
320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  29.57 
 
 
315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  27.47 
 
 
321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  31.33 
 
 
323 aa  115  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  30.31 
 
 
315 aa  114  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  26.44 
 
 
314 aa  113  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  27.55 
 
 
355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  28.88 
 
 
325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  29.97 
 
 
347 aa  109  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  30.41 
 
 
307 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  31.79 
 
 
316 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  30.56 
 
 
320 aa  108  9.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  29.06 
 
 
312 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  30.51 
 
 
319 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  30.67 
 
 
316 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  27.05 
 
 
310 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  30.03 
 
 
310 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  28.93 
 
 
316 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  28.04 
 
 
322 aa  104  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  32 
 
 
316 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  30.53 
 
 
319 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  29.93 
 
 
306 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  30 
 
 
310 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00940  sugar kinase, ribokinase  28.62 
 
 
306 aa  102  6e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18371  putative carbohydrate kinase  28.11 
 
 
332 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.455738  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  32 
 
 
316 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  27.05 
 
 
323 aa  102  8e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4616  PfkB domain protein  29.79 
 
 
326 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1630  PfkB domain protein  27.39 
 
 
341 aa  99.8  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  30.16 
 
 
306 aa  99.8  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  29.25 
 
 
320 aa  99.4  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  29.17 
 
 
306 aa  99.4  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0116  fructokinase  28.88 
 
 
324 aa  99  9e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.393597  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17531  putative carbohydrate kinase  27.41 
 
 
338 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  27.41 
 
 
321 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  29.17 
 
 
306 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4085  PfkB domain protein  29.79 
 
 
322 aa  96.7  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.212948  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  28.57 
 
 
315 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0100  putative fructokinase  28.31 
 
 
318 aa  95.5  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.14054  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  29.62 
 
 
306 aa  95.1  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  28.57 
 
 
320 aa  95.1  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  25.63 
 
 
326 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  29.06 
 
 
322 aa  95.1  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  28.4 
 
 
312 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18191  putative carbohydrate kinase  27.33 
 
 
332 aa  94  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  30.74 
 
 
312 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  26.93 
 
 
308 aa  93.2  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>