18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_27530 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_27530  predicted membrane protein  100 
 
 
669 aa  1382  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00352231  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0093  membrane protein-like protein  42.43 
 
 
667 aa  492  1e-137  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12710  predicted membrane protein  35.73 
 
 
662 aa  416  1e-115  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.942677  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1023  membrane protein-like protein  30.83 
 
 
660 aa  266  8e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0361  hypothetical protein  24.13 
 
 
607 aa  118  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0735  hypothetical protein  22.61 
 
 
598 aa  104  5e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0169011 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1844  membrane protein-like protein  21.23 
 
 
598 aa  97.4  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.478995  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1067  hypothetical protein  22.93 
 
 
756 aa  71.6  4e-11  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1259  membrane protein-like protein  22.11 
 
 
649 aa  69.3  2e-10  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2842  hypothetical protein  21.17 
 
 
675 aa  55.5  3e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00272449  normal  0.0507641 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0119  hypothetical protein  30.16 
 
 
567 aa  53.5  1e-05  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00804511  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1065  hypothetical protein  29.46 
 
 
604 aa  52  3e-05  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2431  ribosomal protein S14  30.77 
 
 
561 aa  49.7  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0721  membrane protein-like protein  20.66 
 
 
573 aa  49.7  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2765  hypothetical protein  20.76 
 
 
634 aa  48.1  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0433  hypothetical protein  19.91 
 
 
613 aa  45.8  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.398189  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0605  hypothetical protein  19.61 
 
 
606 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.307495 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2446  hypothetical protein  22.11 
 
 
613 aa  45.4  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.767851  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>