More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_27170 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_27170  aspartate aminotransferase  100 
 
 
393 aa  811    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3530  aspartate aminotransferase  40.97 
 
 
395 aa  331  1e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00117906  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2311  aspartate aminotransferase  40.41 
 
 
398 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000726355  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01850  aspartate aminotransferase  42.64 
 
 
395 aa  303  4.0000000000000003e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02010  aspartate aminotransferase  40 
 
 
393 aa  301  2e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.951604 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0580  aspartate aminotransferase  38.36 
 
 
397 aa  300  3e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0522  aspartate aminotransferase  40.41 
 
 
396 aa  293  4e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.138181  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1965  aspartate aminotransferase  38.46 
 
 
393 aa  291  9e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1888  aspartate aminotransferase  39.2 
 
 
396 aa  291  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000042706  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2027  aspartate aminotransferase  41.49 
 
 
396 aa  289  8e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277317  hitchhiker  0.0077207 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1148  aspartate aminotransferase  38.4 
 
 
395 aa  286  5e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000148908  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1313  aspartate aminotransferase  36.76 
 
 
397 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211162 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2093  aspartate aminotransferase  36.8 
 
 
393 aa  283  5.000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2600  aspartate aminotransferase  39.47 
 
 
397 aa  279  5e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00026488  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0108  aspartate aminotransferase  38.38 
 
 
394 aa  278  1e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.301084 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2089  aspartate aminotransferase  39.73 
 
 
398 aa  278  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1171  aspartate aminotransferase  38.28 
 
 
396 aa  276  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3354  aspartate aminotransferase  38.03 
 
 
396 aa  275  9e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1046  aspartate aminotransferase  37.87 
 
 
398 aa  275  9e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3287  aspartate aminotransferase  37.6 
 
 
397 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0081  aspartate aminotransferase  40.69 
 
 
395 aa  271  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0248669  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2140  aspartate aminotransferase  40.74 
 
 
393 aa  270  4e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0961  aspartate aminotransferase  36.53 
 
 
397 aa  268  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.173671 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1061  aspartate aminotransferase  36.07 
 
 
398 aa  268  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0613658  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3303  aspartate aminotransferase  39.68 
 
 
397 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.597513  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0732  aspartate aminotransferase  36.27 
 
 
397 aa  259  4e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0186  aspartate aminotransferase  37.43 
 
 
393 aa  258  2e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140573  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2889  aspartate aminotransferase  37.77 
 
 
394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.425013 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0565  aspartate aminotransferase  39.9 
 
 
398 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1103  aspartate aminotransferase  38.44 
 
 
461 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0562  aspartate aminotransferase  39.39 
 
 
398 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0533  aspartate aminotransferase  40.58 
 
 
400 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.865322  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3157  aminotransferase  32.25 
 
 
405 aa  192  8e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2832  aminotransferase class I and II  32.58 
 
 
404 aa  176  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642914 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5530  aminotransferase class I and II  32.51 
 
 
397 aa  169  7e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3263  aminotransferase class I and II  31.19 
 
 
382 aa  162  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3525  aminotransferase  29.14 
 
 
403 aa  160  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  32.02 
 
 
389 aa  159  8e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0973  aminotransferase class I and II  28.2 
 
 
379 aa  153  4e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1558  aminotransferase class I and II  30.77 
 
 
389 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1633  aminotransferase class I and II  31.02 
 
 
389 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1121  aminotransferase class I and II  29.2 
 
 
381 aa  152  8.999999999999999e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2315  aminotransferase  31.02 
 
 
389 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  30.56 
 
 
367 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  27.89 
 
 
387 aa  145  9e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  28.9 
 
 
377 aa  142  9e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  28.9 
 
 
377 aa  142  9e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  26.81 
 
 
373 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  31.14 
 
 
383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  30.16 
 
 
397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  29.27 
 
 
370 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  26.6 
 
 
387 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1911  aspartate aminotransferase  27.11 
 
 
386 aa  139  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0860695  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0710  aspartate aminotransferase  28.8 
 
 
382 aa  138  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  26.72 
 
 
392 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  30.9 
 
 
404 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  28.22 
 
 
388 aa  138  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  27.2 
 
 
392 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0897  aspartate aminotransferase  27.79 
 
 
389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0789129  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1108  aminotransferase, class I and II  27.95 
 
 
384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00053469  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1131  aminotransferase class I and II  27.95 
 
 
384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220252  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0746  aminotransferase class I and II  30.38 
 
 
387 aa  134  3e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000316977  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  27.07 
 
 
396 aa  134  3e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2192  aspartate aminotransferase  29.85 
 
 
385 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2408  aminotransferase class I and II  30.3 
 
 
383 aa  132  7.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.987173  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6360  aspartate aminotransferase  29.56 
 
 
402 aa  132  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70732  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  28.68 
 
 
386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  28.18 
 
 
387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1427  hypothetical protein  27.98 
 
 
402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0770  aminotransferase, class I and II  32.02 
 
 
397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0102863 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  28.91 
 
 
393 aa  130  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0045  aromatic amino acid aminotransferase  28.25 
 
 
391 aa  131  3e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  30.46 
 
 
410 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  25.4 
 
 
385 aa  130  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1904  aminotransferase, class I and II  27.02 
 
 
392 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0832  aspartate aminotransferase  25.6 
 
 
384 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0198108  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  26.67 
 
 
399 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1760  aminotransferase class I and II  27.16 
 
 
393 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  27.79 
 
 
385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  27.75 
 
 
385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  26.82 
 
 
394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  27.62 
 
 
390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  28.14 
 
 
392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  27.57 
 
 
402 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  27.75 
 
 
387 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  27.36 
 
 
398 aa  127  3e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0545  aminotransferase class I and II  29.07 
 
 
373 aa  127  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  28.53 
 
 
404 aa  127  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  27.74 
 
 
400 aa  127  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  30.51 
 
 
393 aa  127  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  27.37 
 
 
387 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  27.5 
 
 
395 aa  127  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  29.64 
 
 
398 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  27.75 
 
 
387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  27.75 
 
 
387 aa  127  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  28.86 
 
 
396 aa  126  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  27.14 
 
 
398 aa  126  6e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  28.19 
 
 
387 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  26.62 
 
 
391 aa  126  7e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0313  aspartate aminotransferase  29.86 
 
 
401 aa  126  8.000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000311454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>