16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_26350 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_26350  hypothetical protein  100 
 
 
794 aa  1629    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00144555  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1370  hypothetical protein  40.54 
 
 
725 aa  571  1e-161  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.997862  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1716  hypothetical protein  41.15 
 
 
718 aa  556  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2195  hypothetical protein  33.29 
 
 
816 aa  325  3e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.111328  normal  0.300765 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0667  hypothetical protein  34.2 
 
 
783 aa  320  7.999999999999999e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0835398  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1441  hypothetical protein  34.44 
 
 
618 aa  295  3e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.232701  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2196  hypothetical protein  34.16 
 
 
809 aa  294  4e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0425055  normal  0.864475 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2194  hypothetical protein  33.85 
 
 
809 aa  289  2e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193525  normal  0.292653 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2540  putative lipoprotein  27.77 
 
 
928 aa  182  2.9999999999999997e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189497  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2158  hypothetical protein  22.87 
 
 
706 aa  100  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0413102 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04540  sporulation related protein  41.24 
 
 
272 aa  59.3  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000449317 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02160  hypothetical protein  36.36 
 
 
272 aa  50.1  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2148  hypothetical protein  23.72 
 
 
443 aa  47.8  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0122  hypothetical protein  27.27 
 
 
390 aa  47.8  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  4.979419999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01220  hypothetical protein  34.21 
 
 
432 aa  44.7  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5037  FHA domain containing protein  36.96 
 
 
235 aa  44.3  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332272 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>