More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_26270 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  75.99 
 
 		 429 aa  697    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 428 aa  894    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  72.17 
 
 		 427 aa  660    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  69.58 
 
 		 427 aa  603  1.0000000000000001e-171  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  57.38 
 
 		 424 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  56.81 
 
 		 424 aa  489  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  55.42 
 
 		 421 aa  486  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  54.89 
 
 		 420 aa  481  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  52.83 
 
 		 423 aa  479  1e-134  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  55.63 
 
 		 424 aa  476  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  54.57 
 
 		 425 aa  476  1e-133  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  54.76 
 
 		 422 aa  477  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  56.21 
 
 		 424 aa  477  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  54.39 
 
 		 422 aa  475  1e-133  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  51.76 
 
 		 427 aa  476  1e-133  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  55.16 
 
 		 425 aa  474  1e-133  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  55.4 
 
 		 423 aa  473  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  54.1 
 
 		 427 aa  472  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  54.8 
 
 		 424 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  54.8 
 
 		 424 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  54.8 
 
 		 424 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  54.8 
 
 		 424 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  54.8 
 
 		 424 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  55.53 
 
 		 424 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  54.8 
 
 		 424 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  54.8 
 
 		 424 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  55.04 
 
 		 423 aa  470  1.0000000000000001e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  54.57 
 
 		 424 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  54.52 
 
 		 426 aa  466  9.999999999999999e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  54.57 
 
 		 424 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  54.12 
 
 		 423 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  54.1 
 
 		 424 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  54.31 
 
 		 425 aa  464  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  54.57 
 
 		 424 aa  462  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  55.63 
 
 		 425 aa  464  1e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  53.44 
 
 		 417 aa  461  9.999999999999999e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  52.93 
 
 		 422 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  52.46 
 
 		 422 aa  455  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  52.82 
 
 		 423 aa  456  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  53.4 
 
 		 428 aa  457  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  54.03 
 
 		 424 aa  457  1e-127  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  51.53 
 
 		 423 aa  456  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  53.4 
 
 		 428 aa  457  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  52.69 
 
 		 422 aa  457  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  52.71 
 
 		 422 aa  457  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  53.02 
 
 		 427 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  52.58 
 
 		 425 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 423 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2384  seryl-tRNA synthetase  54.48 
 
 		 426 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617953 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  53.41 
 
 		 423 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  53.32 
 
 		 428 aa  449  1e-125  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  55.4 
 
 		 425 aa  449  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3582  seryl-tRNA synthetase  54.02 
 
 		 426 aa  451  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0780205  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  53.5 
 
 		 425 aa  450  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  52.91 
 
 		 431 aa  448  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  51.73 
 
 		 433 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  52.42 
 
 		 433 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  51.64 
 
 		 427 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  53.27 
 
 		 426 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  51.51 
 
 		 427 aa  448  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  51.73 
 
 		 433 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  51.41 
 
 		 424 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  52.71 
 
 		 432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  51.76 
 
 		 423 aa  446  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3345  seryl-tRNA synthetase  52.57 
 
 		 426 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0468703  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  51.73 
 
 		 433 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3175  seryl-tRNA synthetase  52.8 
 
 		 426 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.499903  normal  0.106811 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  53.2 
 
 		 426 aa  444  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3072  seryl-tRNA synthetase  51.73 
 
 		 433 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0946131  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4082  seryl-tRNA synthetase  51.96 
 
 		 433 aa  443  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.159254  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  51.73 
 
 		 433 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1986  seryl-tRNA synthetase  51.73 
 
 		 433 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1747  seryl-tRNA synthetase  52.2 
 
 		 428 aa  442  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.387448  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0500  seryl-tRNA synthetase  51.96 
 
 		 433 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0912435  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1828  seryl-tRNA synthetase  52.25 
 
 		 430 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  53.04 
 
 		 426 aa  443  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  51.73 
 
 		 433 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  51.96 
 
 		 433 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  52.68 
 
 		 431 aa  444  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  51.73 
 
 		 433 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 422 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4000  seryl-tRNA synthetase  53.27 
 
 		 426 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.279963  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  52 
 
 		 425 aa  439  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  51.06 
 
 		 427 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  51.88 
 
 		 426 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0851  seryl-tRNA synthetase  51.73 
 
 		 433 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1833  seryl-tRNA synthetase  53.27 
 
 		 426 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000844174 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2729  seryl-tRNA synthetase  51.06 
 
 		 426 aa  440  9.999999999999999e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0940  seryl-tRNA synthetase  51.5 
 
 		 433 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0839  seryl-tRNA synthetase  51.73 
 
 		 433 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2681  seryl-tRNA synthetase  51.73 
 
 		 430 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1724  seryl-tRNA synthetase  51.06 
 
 		 426 aa  437  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2593  seryl-tRNA synthetase  51.73 
 
 		 430 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2932  seryl-tRNA synthetase  51.54 
 
 		 427 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3186  seryl-tRNA synthetase  51.77 
 
 		 427 aa  438  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1616  seryl-tRNA synthetase  51.73 
 
 		 430 aa  437  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.466666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3605  seryl-tRNA synthetase  53.33 
 
 		 426 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837669 
 
 
-
 
NC_004310  BR0885  seryl-tRNA synthetase  51.18 
 
 		 427 aa  433  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2435  seryl-tRNA synthetase  51.5 
 
 		 430 aa  432  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.881624  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  51.28 
 
 		 427 aa  433  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>