More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_26020 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  100 
 
 
200 aa  395  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  42.93 
 
 
205 aa  138  6e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  35.71 
 
 
197 aa  77.4  1e-13  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  51.52 
 
 
149 aa  77.4  1e-13  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.85883e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  51.52 
 
 
149 aa  77  2e-13  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  49.33 
 
 
338 aa  77  2e-13  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  50 
 
 
149 aa  76.6  2e-13  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  2.09993e-08 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
149 aa  75.9  4e-13  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  4.14379e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  50 
 
 
149 aa  75.5  5e-13  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  1.16919e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  50 
 
 
149 aa  75.1  6e-13  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  35.19 
 
 
143 aa  74.3  1e-12  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  50 
 
 
92 aa  73.6  2e-12  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  35.51 
 
 
192 aa  73.6  2e-12  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2589  transcriptional regulator, XRE family  49.23 
 
 
320 aa  72.4  4e-12  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0136414  hitchhiker  0.0041808 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  41.24 
 
 
196 aa  71.6  7e-12  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  2.0134e-07 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  28.37 
 
 
206 aa  69.7  2e-11  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  30.77 
 
 
186 aa  68.9  4e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  32.28 
 
 
194 aa  68.6  6e-11  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  47.69 
 
 
262 aa  68.2  8e-11  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  48.39 
 
 
137 aa  67.8  1e-10  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  49.21 
 
 
262 aa  67.4  1e-10  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  49.21 
 
 
262 aa  67.4  1e-10  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  49.21 
 
 
262 aa  67.4  1e-10  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1096  Xre family transcriptional regulator  49.23 
 
 
362 aa  66.6  2e-10  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0300761  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  47.54 
 
 
114 aa  66.2  3e-10  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  47.54 
 
 
114 aa  66.2  3e-10  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  45.45 
 
 
145 aa  65.9  4e-10  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  43.66 
 
 
210 aa  65.1  6e-10  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 
135 aa  65.1  7e-10  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  46.97 
 
 
142 aa  64.7  8e-10  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  35.2 
 
 
208 aa  64.7  8e-10  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.56006e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0150  transcriptional regulator, XRE family  40.23 
 
 
197 aa  64.3  1e-09  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172339  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 
134 aa  63.9  1e-09  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  43.84 
 
 
459 aa  64.3  1e-09  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  46.97 
 
 
334 aa  63.5  2e-09  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  7.90722e-13 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  44.62 
 
 
322 aa  63.2  2e-09  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
273 aa  63.5  2e-09  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  37.88 
 
 
142 aa  62.8  3e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  39.13 
 
 
146 aa  62.8  4e-09  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2981  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 
312 aa  62.8  4e-09  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  35.25 
 
 
395 aa  62  5e-09  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 
261 aa  62.4  5e-09  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  2.09596e-07  hitchhiker  2.9e-14 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A15  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
204 aa  62  6e-09  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.659709  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  40.24 
 
 
296 aa  62  6e-09  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  35.87 
 
 
293 aa  61.6  7e-09  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  5.39653e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1239  transcriptional regulator, XRE family  49.18 
 
 
235 aa  61.6  8e-09  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 
107 aa  60.8  1e-08  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 
268 aa  61.2  1e-08  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.6802e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 
176 aa  60.8  1e-08  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0099  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 
178 aa  60.5  2e-08  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2448  transcriptional regulator, XRE family  34.02 
 
 
196 aa  60.5  2e-08  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000416057  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  30.63 
 
 
163 aa  60.5  2e-08  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  7.70328e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  43.55 
 
 
369 aa  60.5  2e-08  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 
115 aa  60.1  2e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  2.83783e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  32.93 
 
 
183 aa  59.7  3e-08  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1889  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 
203 aa  58.9  4e-08  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 
244 aa  58.5  6e-08  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  35.05 
 
 
118 aa  58.5  6e-08  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  45.28 
 
 
374 aa  57.8  9e-08  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0067  hypothetical protein  40.62 
 
 
240 aa  58.2  9e-08  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  37.33 
 
 
368 aa  57.8  9e-08  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  45.28 
 
 
374 aa  58.2  9e-08  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  37.1 
 
 
189 aa  57.4  1e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  45.28 
 
 
374 aa  57.8  1e-07  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  45.28 
 
 
374 aa  57.8  1e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0012  Cro/CI family transcriptional regulator  35.38 
 
 
189 aa  57.4  1e-07  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  45.28 
 
 
374 aa  57.8  1e-07  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  45.28 
 
 
374 aa  57.8  1e-07  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 
189 aa  57.4  1e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 
361 aa  57.8  1e-07  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  43.28 
 
 
328 aa  57  2e-07  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 
374 aa  57  2e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  46.15 
 
 
374 aa  57  2e-07  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  39.68 
 
 
206 aa  57  2e-07  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 
163 aa  56.6  2e-07  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  38.57 
 
 
114 aa  56.6  2e-07  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  44.23 
 
 
374 aa  56.6  2e-07  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  31.03 
 
 
380 aa  55.8  4e-07  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  45 
 
 
436 aa  56.2  4e-07  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0308  transcriptional regulator, XRE family  35.24 
 
 
144 aa  55.8  4e-07  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 
114 aa  55.8  4e-07  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  7.59518e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1998  transcriptional regulator, XRE family  49.18 
 
 
131 aa  55.5  5e-07  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1445  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 
147 aa  55.5  5e-07  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.432426 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0016  XRE family transcriptional regulator  28.43 
 
 
185 aa  55.1  6e-07  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25890  predicted transcriptional regulator  54.17 
 
 
272 aa  55.5  6e-07  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2628  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
364 aa  55.1  7e-07  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0359208  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 
242 aa  54.7  8e-07  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3833  prophage LambdaBa02, repressor protein  35 
 
 
114 aa  54.7  9e-07  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4130  prophage lambdaba02, repressor protein  35 
 
 
114 aa  54.7  9e-07  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.05101  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0006  XRE family transcriptional regulator  47.73 
 
 
185 aa  54.3  1e-06  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000100303  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  43.33 
 
 
123 aa  54.3  1e-06  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  2.12762e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11300  predicted transcriptional regulator  38.36 
 
 
197 aa  54.3  1e-06  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1912  helix-turn-helix domain protein  37.93 
 
 
258 aa  54.3  1e-06  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.978099  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 
115 aa  53.9  2e-06  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.42648e-12  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0630  helix-turn-helix domain protein  31.53 
 
 
139 aa  53.5  2e-06  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 
152 aa  53.9  2e-06  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  39.71 
 
 
380 aa  53.1  2e-06  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 
115 aa  53.9  2e-06  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.52617e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18420  predicted transcriptional regulator  47.92 
 
 
149 aa  52.8  3e-06  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.189768  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  43.28 
 
 
364 aa  52.8  3e-06  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>