73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_25740 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_25740  conserved protein of DIM6/NTAB family  100 
 
 
187 aa  386  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0249  flavoredoxin, putative  45.95 
 
 
187 aa  163  1e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  3.03002e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  42.78 
 
 
189 aa  158  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  40.32 
 
 
189 aa  147  1e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.78 
 
 
190 aa  146  2e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  39.04 
 
 
189 aa  144  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.66 
 
 
192 aa  143  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  39.78 
 
 
188 aa  140  1e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  39.89 
 
 
191 aa  137  7e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.57 
 
 
190 aa  137  9e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.23527e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  39.46 
 
 
188 aa  136  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.5 
 
 
190 aa  135  3e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.63 
 
 
189 aa  133  1e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.63 
 
 
194 aa  130  1e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.61 
 
 
189 aa  125  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  34.95 
 
 
190 aa  122  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  34.95 
 
 
189 aa  121  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.48 
 
 
190 aa  121  7e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  34.76 
 
 
190 aa  118  5e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.87 
 
 
195 aa  117  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00650  conserved protein of DIM6/NTAB family  32.02 
 
 
194 aa  105  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  30.6 
 
 
189 aa  104  7e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  32.28 
 
 
200 aa  102  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  5.00824e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  31.18 
 
 
216 aa  88.2  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  7.09652e-06 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.41 
 
 
195 aa  80.5  1e-14  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  30.52 
 
 
200 aa  79.7  2e-14  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  27.92 
 
 
209 aa  76.3  2e-13  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.96 
 
 
186 aa  72  5e-12  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  31.9 
 
 
184 aa  70.9  1e-11  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.81 
 
 
186 aa  66.2  2e-10  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  4.89831e-08 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.4 
 
 
186 aa  67  2e-10  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  31.9 
 
 
186 aa  66.6  2e-10  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  24.52 
 
 
195 aa  65.9  3e-10  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  25.28 
 
 
189 aa  65.5  5e-10  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  26.09 
 
 
192 aa  65.5  5e-10  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  26.09 
 
 
192 aa  65.5  5e-10  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.09 
 
 
215 aa  64.3  9e-10  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  28.57 
 
 
185 aa  63.9  1e-09  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1592  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  27.61 
 
 
193 aa  63.9  1e-09  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  34.82 
 
 
183 aa  62.4  3e-09  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7867  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.24 
 
 
233 aa  52.8  3e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.358358 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0437  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.63 
 
 
185 aa  52.4  3e-06  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1555  flavin reductase domain-containing protein  28.06 
 
 
186 aa  49.3  3e-05  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0883  hypothetical protein  27.37 
 
 
165 aa  49.7  3e-05  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0253557  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  26.81 
 
 
160 aa  48.9  4e-05  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0511  hypothetical protein  22.22 
 
 
253 aa  49.3  4e-05  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140824  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.57 
 
 
185 aa  48.1  7e-05  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1553  hypothetical protein  22.99 
 
 
190 aa  47.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  28.47 
 
 
197 aa  47  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5786  hypothetical protein  25.68 
 
 
208 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.756136  hitchhiker  0.00296108 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06060  conserved hypothetical protein  30.06 
 
 
155 aa  46.2  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1850  hypothetical protein  26.06 
 
 
180 aa  45.4  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.147622 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0762  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.57 
 
 
203 aa  45.1  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1270  flavin reductase domain-containing protein  26.26 
 
 
181 aa  44.7  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.285703  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.85 
 
 
295 aa  43.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00640  conserved protein of DIM6/NTAB family  45 
 
 
171 aa  43.5  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1593  hypothetical protein  32.47 
 
 
291 aa  43.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1051  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  23.5 
 
 
216 aa  43.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.136443 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  25 
 
 
203 aa  43.5  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  28.3 
 
 
210 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  24.44 
 
 
192 aa  43.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5134  hypothetical protein  23.17 
 
 
220 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5370  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.17 
 
 
223 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.480853 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2559  hypothetical protein  22.49 
 
 
183 aa  42.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  25.71 
 
 
204 aa  43.1  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7599  hypothetical protein  23.17 
 
 
220 aa  42.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1050  hypothetical protein  22.15 
 
 
191 aa  42  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1499  FMN-binding protein  36.96 
 
 
202 aa  42  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.23332  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  23.78 
 
 
200 aa  42  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0420  hypothetical protein  25 
 
 
199 aa  42  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0595779  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.73 
 
 
203 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  28.38 
 
 
203 aa  41.2  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7521  hypothetical protein  27.07 
 
 
236 aa  41.2  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>