72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_25520 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  100 
 
 		 613 aa  1256    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07880  glucan-binding domain-containing protein  48.66 
 
 		 651 aa  205  2e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352799 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0611  cell wall binding repeat-containing protein  45.98 
 
 		 430 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  34.66 
 
 		 602 aa  199  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  43.05 
 
 		 550 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  43.92 
 
 		 454 aa  190  8e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00880  putative cell wall binding protein  48.53 
 
 		 478 aa  187  4e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  0.955176 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0550  cell wall binding repeat-containing protein  43.64 
 
 		 330 aa  187  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.515915  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14470  putative cell wall binding protein  35.93 
 
 		 512 aa  184  4.0000000000000006e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.444931 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  43.4 
 
 		 2495 aa  183  8.000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11330  putative cell wall binding protein  47 
 
 		 502 aa  183  9.000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.307599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14450  glucan-binding domain-containing protein  39.76 
 
 		 532 aa  175  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.521361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0605  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  39.23 
 
 		 807 aa  172  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  45.81 
 
 		 811 aa  172  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  42.11 
 
 		 592 aa  170  6e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05950  glucan-binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 753 aa  161  4e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000330124  hitchhiker  0.0000000000107499 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  43.58 
 
 		 750 aa  160  9e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14460  glucan-binding domain-containing protein  40 
 
 		 757 aa  158  3e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.706218  normal  0.855897 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06260  glucan-binding domain-containing protein  41.95 
 
 		 324 aa  149  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0591  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  36.21 
 
 		 573 aa  147  5e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000159659  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0592  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  38.5 
 
 		 891 aa  145  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0288009  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16000  putative cell wall binding protein  35.29 
 
 		 316 aa  143  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000272933 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16990  glucan-binding domain-containing protein  41.89 
 
 		 342 aa  143  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0593  cell wall binding repeat-containing protein  38.25 
 
 		 552 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000201841  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14440  subtilase family protease  39.37 
 
 		 817 aa  139  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  53.96 
 
 		 302 aa  135  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0597  surface protein pspA precursor  39.8 
 
 		 434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05190  putative cell wall binding protein  51.22 
 
 		 440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09550  putative cell wall binding protein  35.06 
 
 		 331 aa  119  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0189396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  45.81 
 
 		 1732 aa  115  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02530  glucan-binding domain-containing protein  38.54 
 
 		 377 aa  116  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459016  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0490  cell wall binding repeat-containing protein  26.78 
 
 		 1557 aa  114  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.22 
 
 		 762 aa  102  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0223841  normal  0.138276 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11960  putative cell wall binding protein  37.7 
 
 		 578 aa  99.8  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000480831  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  39.07 
 
 		 1131 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  39.07 
 
 		 1131 aa  97.8  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  36.17 
 
 		 697 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04260  putative cell wall binding protein  27.17 
 
 		 465 aa  94  7e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.878918  normal  0.401989 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0888  cell wall hydrolase/autolysin  30.23 
 
 		 890 aa  92.4  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000852469  normal  0.142876 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02590  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.71 
 
 		 339 aa  90.1  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000561164 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  29.33 
 
 		 2821 aa  87.4  8e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1752  glycosyl hydrolase  34.29 
 
 		 1514 aa  85.5  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05010  putative cell wall binding protein  53.16 
 
 		 203 aa  83.2  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5584  cell wall binding repeat-containing protein  27.75 
 
 		 737 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0595  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  36.61 
 
 		 350 aa  79.7  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0114709  normal  0.325418 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0013  peptidoglycan hydrolase  22.87 
 
 		 589 aa  74.7  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0013556  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  24.48 
 
 		 1527 aa  74.3  0.000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2363  hypothetical protein  27.1 
 
 		 381 aa  73.2  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  46.48 
 
 		 2207 aa  66.6  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2644  cell wall/surface repeat protein  44.87 
 
 		 2178 aa  65.1  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.615501  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02470  putative cell wall binding protein  38.27 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  26.95 
 
 		 1363 aa  63.2  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0544  YG repeat-containing glycosyl hydrolase  29.61 
 
 		 1475 aa  62.4  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1336  cell wall binding repeat-containing protein  25 
 
 		 184 aa  59.7  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0091  hypothetical protein  22.04 
 
 		 587 aa  57  0.0000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1367  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  24.09 
 
 		 474 aa  56.2  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000955772  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15380  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.18 
 
 		 268 aa  55.5  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00636935  normal  0.0253427 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  26.84 
 
 		 420 aa  55.1  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26600  hypothetical protein  24.82 
 
 		 380 aa  54.7  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.61546  normal  0.94722 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1355  hypothetical protein  25.13 
 
 		 532 aa  51.2  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0180624  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1365  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.46 
 
 		 514 aa  50.8  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0022042  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1411  hypothetical protein  24.37 
 
 		 1002 aa  49.7  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1409  hypothetical protein  24.37 
 
 		 1009 aa  48.9  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0422  cell wall/surface repeat protein  47.83 
 
 		 1729 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00920532  hitchhiker  0.0000607429 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1410  hypothetical protein  26.61 
 
 		 1025 aa  48.9  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3366  hypothetical protein  29.9 
 
 		 226 aa  47.4  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.204348  hitchhiker  0.000467396 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  40.85 
 
 		 1452 aa  47.4  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0859  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.82 
 
 		 399 aa  47  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000303579  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1573  metallo-beta-lactamase family protein  28.02 
 
 		 626 aa  46.2  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1094  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.27 
 
 		 399 aa  46.2  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000219862  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0298  hypothetical protein  48 
 
 		 1457 aa  45.4  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00924887  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2050  NLP/P60 protein  24.32 
 
 		 696 aa  44.7  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.426387  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>