More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_25280 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4998  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.08 
 
 
953 aa  704    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217845  hitchhiker  0.000835215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1809  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.04 
 
 
960 aa  697    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550904  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0727  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.06 
 
 
979 aa  687    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216931  normal  0.398444 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.09 
 
 
1424 aa  636    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  42.51 
 
 
1385 aa  657    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2185  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.11 
 
 
960 aa  698    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.602321  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1391  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.72 
 
 
947 aa  698    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.7 
 
 
925 aa  661    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.36 
 
 
676 aa  679    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1708  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.52 
 
 
959 aa  687    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2058  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.08 
 
 
967 aa  683    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.896651  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4024  formate dehydrogenase, alpha subunit  40 
 
 
966 aa  692    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.09 
 
 
1428 aa  649    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3925  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.86 
 
 
959 aa  667    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287134  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1861  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.61 
 
 
978 aa  658    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.14 
 
 
1421 aa  640    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.84 
 
 
917 aa  828    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2274  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.81 
 
 
956 aa  650    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.217783 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2366  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.09 
 
 
983 aa  694    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.739285 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.6 
 
 
879 aa  753    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0450  formate dehydrogenase, alpha subunit  41 
 
 
984 aa  696    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.858013  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0967  formate dehydrogenase, alpha subunit  41 
 
 
984 aa  696    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0619  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.11 
 
 
956 aa  679    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.961077  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.82 
 
 
937 aa  638    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2249  formate dehydrogenase, alpha subunit  71.87 
 
 
903 aa  1365    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.580662  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0255  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.42 
 
 
952 aa  721    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0971632  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0337  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.91 
 
 
955 aa  636    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3012  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  41.11 
 
 
984 aa  698    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.467116  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1080  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  38.55 
 
 
960 aa  648    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4144  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.09 
 
 
983 aa  692    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110494  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0389  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.47 
 
 
944 aa  684    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.36 
 
 
676 aa  678    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  68.66 
 
 
906 aa  1333    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3479  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.55 
 
 
946 aa  664    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.389807 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.93 
 
 
1410 aa  640    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2897  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.24 
 
 
959 aa  660    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2902  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.11 
 
 
984 aa  698    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679741  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  46.1 
 
 
899 aa  827    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1622  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.11 
 
 
984 aa  697    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.437101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2964  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.89 
 
 
984 aa  693    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2853  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.97 
 
 
960 aa  640    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.771386 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0724  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.32 
 
 
948 aa  660    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.696908  normal  0.792249 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0735  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.35 
 
 
952 aa  637    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3023  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.95 
 
 
982 aa  675    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162015  normal  0.0152175 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3089  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.29 
 
 
959 aa  678    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440267  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0031  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.96 
 
 
1000 aa  696    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.93 
 
 
893 aa  821    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2750  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.21 
 
 
969 aa  662    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0453604 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2558  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.35 
 
 
973 aa  654    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.779669  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.7 
 
 
900 aa  780    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.93 
 
 
676 aa  672    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.61 
 
 
886 aa  736    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4645  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.41 
 
 
948 aa  669    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0720  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.65 
 
 
949 aa  679    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.15 
 
 
945 aa  674    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0964  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  39.06 
 
 
982 aa  674    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133867  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0623  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.94 
 
 
948 aa  665    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.816724  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  100 
 
 
911 aa  1896    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0555  formate dehydrogenase subunit alpha  38.9 
 
 
957 aa  680    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.358497 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.02 
 
 
1440 aa  645    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0907  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.87 
 
 
983 aa  691    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.979482  decreased coverage  0.00925571 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0552  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.2 
 
 
983 aa  694    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.918724  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4914  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.41 
 
 
950 aa  692    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.263268 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3656  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.13 
 
 
948 aa  656    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.480327 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.86 
 
 
893 aa  845    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.15 
 
 
901 aa  802    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.2 
 
 
983 aa  694    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.656443 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2684  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.43 
 
 
951 aa  665    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.801873  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0895  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.54 
 
 
983 aa  686    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.99873  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0805  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.94 
 
 
948 aa  667    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624345  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4097  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.2 
 
 
959 aa  662    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1031  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.2 
 
 
983 aa  694    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52357  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4406  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.3 
 
 
950 aa  696    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.16 
 
 
920 aa  721    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3636  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.97 
 
 
959 aa  671    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.234983 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0839  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.15 
 
 
946 aa  676    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.331727  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3552  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.17 
 
 
960 aa  698    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4869  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.41 
 
 
950 aa  699    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0187329 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3019  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.52 
 
 
957 aa  668    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.98 
 
 
898 aa  747    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.78 
 
 
905 aa  758    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0180  formate dehydrogenase, alpha subunit  41 
 
 
984 aa  696    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.95 
 
 
904 aa  901    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2856  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.64 
 
 
959 aa  652    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.13 
 
 
900 aa  840    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.85 
 
 
893 aa  837    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3710  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  39.87 
 
 
977 aa  680    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.749683  normal  0.699855 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.13 
 
 
951 aa  687    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2595  formate dehydrogenase, alpha subunit  41 
 
 
984 aa  696    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.619743  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2383  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.34 
 
 
959 aa  655    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2741  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.45 
 
 
960 aa  645    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.313061 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3198  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.21 
 
 
1432 aa  633  1e-180  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.554904 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.98 
 
 
1432 aa  631  1e-179  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.81 
 
 
674 aa  626  1e-178  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  47.05 
 
 
745 aa  625  1e-178  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.26 
 
 
1425 aa  628  1e-178  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.26 
 
 
1425 aa  627  1e-178  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0825  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.75 
 
 
1432 aa  629  1e-178  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00541451 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.42 
 
 
1425 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.67 
 
 
674 aa  625  1e-177  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>