More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_24720 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_24720  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  100 
 
 		 362 aa  722    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  55.08 
 
 		 350 aa  362  4e-99  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2222  transport system permease protein  51.55 
 
 		 346 aa  351  1e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.205591  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1533  hexapaptide repeat-containing transferase  50.46 
 
 		 335 aa  328  1.0000000000000001e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.804151  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1614  ABC transporter permease  51.91 
 
 		 341 aa  319  5e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  44.87 
 
 		 369 aa  293  4e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  44.31 
 
 		 344 aa  291  9e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0497  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  45.31 
 
 		 354 aa  279  6e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.760715  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  40.5 
 
 		 372 aa  278  9e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  45.68 
 
 		 343 aa  276  4e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0510  iron compounds ABC transporter, permease protein  45.12 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0028  transport system permease protein  44.57 
 
 		 354 aa  269  4e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  45.22 
 
 		 338 aa  262  6e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5521  transport system permease protein  45.98 
 
 		 341 aa  261  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1994  transport system permease protein  44.24 
 
 		 331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1043  hypothetical protein  43.77 
 
 		 334 aa  251  1e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.696998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01860  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  44.35 
 
 		 358 aa  250  2e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0684072 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4152  transport system permease protein  44.61 
 
 		 349 aa  250  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0813  HmuU protein  44.88 
 
 		 336 aa  249  5e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00319044  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3843  transport system permease protein  44.31 
 
 		 349 aa  249  5e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1986  transport system permease protein  43.71 
 
 		 340 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  41.56 
 
 		 336 aa  246  6e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1695  transport system permease protein  44.09 
 
 		 349 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0857998  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4263  transport system permease protein  43.95 
 
 		 337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000122038  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  40.37 
 
 		 332 aa  242  7.999999999999999e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  41.27 
 
 		 336 aa  241  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4300  transport system permease protein  43.73 
 
 		 349 aa  239  5e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1424  transport system permease protein  41.93 
 
 		 350 aa  239  5.999999999999999e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.320274  normal  0.156715 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  37.2 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_28  iron ion transport system, inner membrane component  38.11 
 
 		 347 aa  237  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260829  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1676  transport system permease protein  43.31 
 
 		 349 aa  236  3e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1287  response regulator  41.53 
 
 		 336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.023456  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  38.79 
 
 		 359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  38.05 
 
 		 356 aa  231  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2329  transport system permease protein  37.33 
 
 		 348 aa  232  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  36.81 
 
 		 368 aa  230  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  39.49 
 
 		 347 aa  230  3e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3529  transport system permease protein  38.25 
 
 		 348 aa  229  5e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.914078  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1482  transport system permease protein  39.82 
 
 		 338 aa  227  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2735  transport system permease protein  45.16 
 
 		 353 aa  226  6e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0854593  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2479  transport system permease protein  48 
 
 		 340 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.158013 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0248  transport system permease protein  44.48 
 
 		 331 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2064  transport system permease protein  43.13 
 
 		 338 aa  223  3e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4649  transport system permease protein  45.96 
 
 		 337 aa  223  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978499 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0891  ABC transporter permease  37.85 
 
 		 324 aa  223  4.9999999999999996e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1542  transport system permease protein  38.98 
 
 		 340 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1490  ABC transporter, permease protein, FecCD family  38.66 
 
 		 327 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1205  transport system permease protein  38.66 
 
 		 327 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150198 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1538  transport system permease protein  41.27 
 
 		 341 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0602  ABC transporter permease  41.43 
 
 		 333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2552  transport system permease protein  36.29 
 
 		 363 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.822821  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1202  ABC transporter permease  40.22 
 
 		 326 aa  220  3.9999999999999997e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.820499  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  38.73 
 
 		 340 aa  219  5e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3222  transport system permease protein  44.79 
 
 		 358 aa  217  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1948  iron(III) ABC transporter, permease protein  42.67 
 
 		 326 aa  216  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0628531 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1373  transport system permease protein  42.44 
 
 		 332 aa  214  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1425  transport system permease protein  41.54 
 
 		 339 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0954  transport system permease protein  41.77 
 
 		 356 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.492896  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0865  transport system permease protein  46.24 
 
 		 322 aa  213  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0154  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  39.75 
 
 		 351 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26440  iron(III) ABC transporter-permease protein  44.76 
 
 		 332 aa  212  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2846  transport system permease protein  39.64 
 
 		 345 aa  211  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1462  transport system permease protein  40.79 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.868  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2075  ABC-type Fe3+-siderophore transport system permease component  41.49 
 
 		 333 aa  207  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3469  transport system permease protein  39.49 
 
 		 339 aa  206  5e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1656  transport system permease protein  40.63 
 
 		 354 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636963  normal  0.143618 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2005  transport system permease protein  38.1 
 
 		 349 aa  203  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0934692  normal  0.372795 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0529  transport system permease protein  40.54 
 
 		 342 aa  202  6e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550834  normal  0.720175 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  34.25 
 
 		 367 aa  202  8e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3031  transport system permease protein  39.56 
 
 		 337 aa  202  8e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47150  transport system permease protein  44.79 
 
 		 334 aa  202  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.507238  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3703  transport system permease protein  38.14 
 
 		 341 aa  200  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.912274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  37.8 
 
 		 363 aa  199  7e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  37.27 
 
 		 363 aa  196  7e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1514  transport system permease protein  39.71 
 
 		 335 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  35.97 
 
 		 330 aa  194  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  35.76 
 
 		 337 aa  194  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  35.97 
 
 		 330 aa  193  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0372  transport system permease protein  36.89 
 
 		 346 aa  193  4e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.314263  normal  0.28598 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0279  ABC transporter permease  35.49 
 
 		 326 aa  193  4e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.590868  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2393  iron ABC transporter, permease protein  36.64 
 
 		 359 aa  191  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1753  transport system permease protein  37.89 
 
 		 348 aa  191  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000172591  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1169  transport system permease protein  38.32 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0232  transport system permease protein  41.97 
 
 		 346 aa  188  2e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.691146 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  32.49 
 
 		 347 aa  186  6e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  35.76 
 
 		 452 aa  186  8e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  36.44 
 
 		 367 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1213  transport system permease protein  40.31 
 
 		 327 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0536991  hitchhiker  0.0000000935619 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1495  ABC transporter, permease protein, FecCD family  40.19 
 
 		 341 aa  182  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  35.24 
 
 		 343 aa  182  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  33.14 
 
 		 353 aa  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  34.12 
 
 		 346 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  35.74 
 
 		 354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  32.04 
 
 		 368 aa  179  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  33.76 
 
 		 370 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  34.9 
 
 		 355 aa  177  2e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  32.21 
 
 		 350 aa  176  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1546  ABC transporter, inner membrane subunit  34.29 
 
 		 387 aa  177  4e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1297  iron chelate ABC transporter permease protein  31.71 
 
 		 343 aa  176  4e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0147613  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  33.12 
 
 		 366 aa  176  4e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>