More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_24670 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0729  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  56.35 
 
 		 623 aa  649    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1857  NADH dehydrogenase (quinone)  52.78 
 
 		 600 aa  640    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_635  [Fe] hydrogenase, HymB subunit  55.2 
 
 		 626 aa  642    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  53.73 
 
 		 607 aa  645    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  53.73 
 
 		 607 aa  645    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1701  NADH dehydrogenase (quinone)  55.93 
 
 		 604 aa  673    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0661  NADH dehydrogenase (quinone)  55.03 
 
 		 623 aa  640    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.435318  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24670  NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit  100 
 
 		 597 aa  1211    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  52.7 
 
 		 626 aa  622  1e-177  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  51.18 
 
 		 597 aa  617  1e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  52.12 
 
 		 597 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1887  NADH dehydrogenase (quinone)  52.96 
 
 		 592 aa  613  9.999999999999999e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0864  hydrogenase subunit HymB, putative  51.63 
 
 		 640 aa  607  9.999999999999999e-173  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  52.96 
 
 		 596 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2080  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  51.19 
 
 		 635 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0429  NADH dehydrogenase (quinone)  50.17 
 
 		 624 aa  605  9.999999999999999e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_767  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit E subfamily  51.86 
 
 		 641 aa  598  1e-170  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  49.49 
 
 		 610 aa  598  1e-170  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  50 
 
 		 597 aa  601  1e-170  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01800  NADH dehydrogenase I subunit F  51.59 
 
 		 624 aa  601  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.235185  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  52.99 
 
 		 636 aa  596  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  52.65 
 
 		 636 aa  595  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0782  NADH dehydrogenase (quinone)  51.26 
 
 		 640 aa  597  1e-169  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  49.92 
 
 		 602 aa  597  1e-169  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  50.17 
 
 		 597 aa  592  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  50.34 
 
 		 595 aa  589  1e-167  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0332  NADH dehydrogenase (quinone)  51.01 
 
 		 629 aa  588  1e-167  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  47.8 
 
 		 614 aa  590  1e-167  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  51.36 
 
 		 594 aa  589  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1655  NADH dehydrogenase (quinone)  50.42 
 
 		 627 aa  590  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0471  NADH dehydrogenase (quinone)  51.69 
 
 		 620 aa  588  1e-166  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000177124  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  51.36 
 
 		 596 aa  587  1e-166  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  48.81 
 
 		 588 aa  587  1e-166  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2304  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  47.75 
 
 		 623 aa  588  1e-166  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  51.35 
 
 		 596 aa  578  1e-164  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0109  NADH dehydrogenase (quinone)  50.08 
 
 		 656 aa  579  1e-164  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  49.75 
 
 		 597 aa  578  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  48.81 
 
 		 677 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0166  NADH dehydrogenase (quinone)  52.39 
 
 		 612 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  47.65 
 
 		 624 aa  568  1e-161  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0532  NADH dehydrogenase (quinone)  49.26 
 
 		 620 aa  568  1e-161  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0280377  normal  0.055647 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1248  NADH dehydrogenase (quinone)  48.98 
 
 		 604 aa  566  1e-160  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.600832  normal  0.0289049 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  46.88 
 
 		 614 aa  565  1e-160  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  48.68 
 
 		 626 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  48.35 
 
 		 626 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0472  NADH dehydrogenase (quinone)  49.83 
 
 		 594 aa  560  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3505  NADH dehydrogenase (quinone)  49.75 
 
 		 619 aa  561  1e-158  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.960223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0657  NADH dehydrogenase (quinone)  49.41 
 
 		 590 aa  560  1e-158  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210561  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0088  NADH dehydrogenase (quinone)  47.93 
 
 		 628 aa  555  1e-157  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.296083  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  48.81 
 
 		 603 aa  558  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0834  NADH dehydrogenase I, F subunit  49.83 
 
 		 617 aa  553  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  50.7 
 
 		 598 aa  546  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0491  NADH dehydrogenase (quinone)  46.31 
 
 		 623 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1718  NADH dehydrogenase (quinone)  50.67 
 
 		 619 aa  539  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.081204  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4005  NADH dehydrogenase (quinone)  48.41 
 
 		 593 aa  538  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42089e-25 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0226  NADH dehydrogenase (quinone)  46.48 
 
 		 632 aa  536  1e-151  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.096685  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3921  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  48.74 
 
 		 593 aa  538  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3350  NADH dehydrogenase I, F subunit  48.06 
 
 		 591 aa  533  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.051471 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4239  NADH dehydrogenase (quinone)  48.24 
 
 		 593 aa  535  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0343  NADH dehydrogenase I, F subunit  47.55 
 
 		 591 aa  529  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3133  NADH dehydrogenase (quinone)  47.8 
 
 		 590 aa  530  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.846536  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2708  NADH dehydrogenase I, F subunit  50.83 
 
 		 488 aa  526  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  51.7 
 
 		 572 aa  527  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  50.58 
 
 		 562 aa  528  1e-148  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  50.28 
 
 		 572 aa  527  1e-148  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1604  NADP-reducing hydrogenase chain C  51.13 
 
 		 486 aa  523  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1634  NADP-reducing hydrogenase chain C  51.13 
 
 		 486 aa  523  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000096005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1844  NADP-reducing hydrogenase chain C  51.13 
 
 		 486 aa  523  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0724  NADH dehydrogenase (quinone)  52.82 
 
 		 485 aa  517  1.0000000000000001e-145  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2713  NADH dehydrogenase (quinone)  48.59 
 
 		 552 aa  511  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  45.68 
 
 		 634 aa  505  9.999999999999999e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0860011  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1086  NADH dehydrogenase (quinone)  49.7 
 
 		 526 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1489  NADH dehydrogenase (quinone)  48.36 
 
 		 570 aa  503  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2721  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  47.55 
 
 		 570 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3516  NADH dehydrogenase (quinone)  50.94 
 
 		 488 aa  489  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  48.69 
 
 		 569 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3291  NADH dehydrogenase (quinone)  48.11 
 
 		 575 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0098  NADH dehydrogenase (quinone)  48.28 
 
 		 535 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0095  NADH dehydrogenase (quinone)  48.08 
 
 		 535 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.693174 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1110  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  47.27 
 
 		 569 aa  478  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3542  NADH dehydrogenase (quinone)  49.03 
 
 		 537 aa  474  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1365  NADH dehydrogenase (quinone)  48.45 
 
 		 532 aa  471  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2479  NADH dehydrogenase (quinone)  47.88 
 
 		 535 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.858375  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1274  NADH dehydrogenase (quinone)  45.35 
 
 		 562 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2794  NADH dehydrogenase (quinone)  47.08 
 
 		 572 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4166  NADH dehydrogenase (quinone)  47.18 
 
 		 530 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1923  NADH dehydrogenase (quinone)  46.48 
 
 		 539 aa  463  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1545  NADH dehydrogenase (quinone)  49.69 
 
 		 668 aa  460  9.999999999999999e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0844  NADH dehydrogenase (quinone)  46.61 
 
 		 562 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0257852  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4654  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  45.8 
 
 		 535 aa  457  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4052  NADH dehydrogenase (quinone)  46.99 
 
 		 543 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0914  NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit  45.05 
 
 		 571 aa  451  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0279  NADH dehydrogenase (quinone)  45.26 
 
 		 534 aa  435  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  42.31 
 
 		 545 aa  420  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0991  NADH dehydrogenase (quinone)  42.88 
 
 		 539 aa  422  1e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0720  NADH dehydrogenase (quinone)  42.31 
 
 		 545 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00999729  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1168  NADH dehydrogenase (quinone)  41.02 
 
 		 538 aa  412  1e-114  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.073062  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1539  NADH dehydrogenase (quinone)  42.22 
 
 		 580 aa  415  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  39.7 
 
 		 545 aa  414  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0388  NADH dehydrogenase (quinone)  44.32 
 
 		 523 aa  392  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>