216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_24350 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_24350  glycerate kinase  100 
 
 		 376 aa  752    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  51.49 
 
 		 383 aa  320  3e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  49.33 
 
 		 381 aa  315  7e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3291  Glycerate kinase  48.53 
 
 		 380 aa  305  7e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000409322  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  45.33 
 
 		 380 aa  299  5e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  46.01 
 
 		 379 aa  296  6e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  46.26 
 
 		 384 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0571  glycerate kinase II  44.92 
 
 		 382 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0578  glycerate kinase II  44.92 
 
 		 382 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.837942 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0632  glycerate kinase II  44.92 
 
 		 382 aa  288  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.82847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0573  glycerate kinase II  44.92 
 
 		 382 aa  288  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0615  glycerate kinase II  45.6 
 
 		 381 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3109  glycerate kinase II  45.33 
 
 		 381 aa  286  4e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0587  glycerate kinase II  45.33 
 
 		 381 aa  286  4e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00464  glycerate kinase II  45.33 
 
 		 381 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00469  hypothetical protein  45.33 
 
 		 381 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1896  glycerate kinase  43.85 
 
 		 384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1135  glycerate kinase  44.59 
 
 		 374 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0551  glycerate kinase II  45.07 
 
 		 381 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3099  Glycerate kinase  45.07 
 
 		 381 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3602  glycerate kinase  43.27 
 
 		 381 aa  281  9e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0197  glycerate kinase  43.88 
 
 		 381 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0775115  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  45.96 
 
 		 380 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0153  glycerate kinase  43.88 
 
 		 381 aa  281  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0559  glycerate kinase II  44.53 
 
 		 381 aa  281  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0645  glycerate kinase  43.21 
 
 		 383 aa  280  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  47.87 
 
 		 381 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  44.83 
 
 		 378 aa  280  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0176  glycerate kinase  44.72 
 
 		 381 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.246906 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0148  glycerate kinase  43.35 
 
 		 385 aa  277  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0146  glycerate kinase  43.62 
 
 		 385 aa  278  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.214827  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  44.56 
 
 		 378 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  44.3 
 
 		 378 aa  277  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1439  glycerate kinase  46.28 
 
 		 380 aa  277  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  50.58 
 
 		 388 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0147  glycerate kinase  44.17 
 
 		 381 aa  277  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  50.58 
 
 		 388 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  48.88 
 
 		 394 aa  276  5e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  50.58 
 
 		 388 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  42.78 
 
 		 381 aa  276  5e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  43.05 
 
 		 373 aa  275  9e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2685  glycerate kinase  43.9 
 
 		 381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  44.39 
 
 		 379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  46.22 
 
 		 388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  45.89 
 
 		 378 aa  273  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  43.05 
 
 		 373 aa  273  3e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0925  glycerate kinase  46.09 
 
 		 381 aa  273  3e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000221042  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50760  hypothetical protein  49.57 
 
 		 381 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0151848 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5139  glycerate kinase  44.72 
 
 		 381 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2685  Glycerate kinase  42.93 
 
 		 381 aa  271  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2458  glycerate kinase  43.32 
 
 		 380 aa  271  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2507  glycerate kinase  43.32 
 
 		 380 aa  271  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.724279  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  45.63 
 
 		 381 aa  270  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.109938 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2519  glycerate kinase  43.36 
 
 		 381 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122569 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1478  glycerate kinase  41.82 
 
 		 378 aa  271  2e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2714  glycerate kinase  43.05 
 
 		 384 aa  271  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426289  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  43.17 
 
 		 379 aa  271  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  45.63 
 
 		 408 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0581  Glycerate kinase  45.63 
 
 		 381 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  45.63 
 
 		 408 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0576  glycerate kinase I  45.63 
 
 		 381 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  43.35 
 
 		 382 aa  270  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3313  glycerate kinase I  45.63 
 
 		 381 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1470  glycerate kinase  42.59 
 
 		 394 aa  269  5e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  43.73 
 
 		 381 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  45.35 
 
 		 381 aa  269  7e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0151  glycerate kinase  47.47 
 
 		 381 aa  268  8e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219073  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  38.44 
 
 		 380 aa  268  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5030  glycerate kinase  42.63 
 
 		 380 aa  268  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3234  glycerate kinase I  45.07 
 
 		 381 aa  268  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000882  glycerate kinase  44.12 
 
 		 378 aa  267  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1770  glycerate kinase, putative  43.28 
 
 		 384 aa  266  4e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2587  glycerate kinase  43.63 
 
 		 381 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3134  glycerate kinase  40.89 
 
 		 392 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  42.78 
 
 		 379 aa  265  7e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4927  glycerate kinase  44.41 
 
 		 395 aa  265  7e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3566  glycerate kinase I  43.73 
 
 		 381 aa  265  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3178  glycerate kinase  43.77 
 
 		 379 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  44.44 
 
 		 380 aa  264  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0146  glycerate kinase  44.54 
 
 		 380 aa  264  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000400769  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  44.17 
 
 		 381 aa  263  3e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1604  glycerate kinase  41.28 
 
 		 402 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.395644  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2012  glycerate kinase 2  42.82 
 
 		 383 aa  261  1e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.197664  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3623  glycerate kinase  45.03 
 
 		 386 aa  261  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2773  Glycerate kinase  41.03 
 
 		 402 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.567771  hitchhiker  0.000390297 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1575  glycerate kinase  40.92 
 
 		 403 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2672  glycerate kinase  44.41 
 
 		 381 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.16173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  43.61 
 
 		 380 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0185  glycerate kinase  44.72 
 
 		 381 aa  260  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000580262  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  42.18 
 
 		 387 aa  260  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2690  glycerate kinase  42.97 
 
 		 379 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0812  glycerate kinase  43.01 
 
 		 380 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2611  glycerate kinase  40.48 
 
 		 376 aa  258  8e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1592  glycerate kinase  41.94 
 
 		 391 aa  257  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  43.77 
 
 		 377 aa  257  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  43.06 
 
 		 380 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  43.06 
 
 		 380 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1524  glycerate kinase  43.47 
 
 		 380 aa  256  5e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1570  glycerate kinase  41.03 
 
 		 403 aa  256  6e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.769204  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3228  glycerate kinase  45.21 
 
 		 384 aa  255  7e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0890898  normal  0.844973 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>