245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_24190 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  69.89 
 
 		 469 aa  696    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24190  SNF family Na+-dependent transporter  100 
 
 		 468 aa  935    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  62.85 
 
 		 484 aa  618  1e-176  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  63.79 
 
 		 483 aa  620  1e-176  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  55.65 
 
 		 470 aa  516  1.0000000000000001e-145  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0404  sodium:neurotransmitter symporter  57.97 
 
 		 463 aa  511  1e-144  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.630301  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0854  sodium:neurotransmitter symporter  49.13 
 
 		 461 aa  437  1e-121  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226539  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0461  sodium:neurotransmitter symporter  45.36 
 
 		 462 aa  412  1e-114  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183421  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0801  sodium:neurotransmitter symporter  49.56 
 
 		 461 aa  402  1e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  36.67 
 
 		 453 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  36.82 
 
 		 449 aa  278  1e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  37.29 
 
 		 455 aa  276  7e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  37.29 
 
 		 455 aa  273  6e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  37.24 
 
 		 446 aa  266  5e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  38.42 
 
 		 452 aa  265  2e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  35.99 
 
 		 453 aa  264  2e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  34.18 
 
 		 453 aa  262  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  40.36 
 
 		 452 aa  258  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  36.47 
 
 		 461 aa  258  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  33.88 
 
 		 453 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2394  sodium:neurotransmitter symporter  37.5 
 
 		 453 aa  254  3e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  34.41 
 
 		 454 aa  254  3e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2742  sodium:neurotransmitter symporter  35.78 
 
 		 460 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0480  sodium:neurotransmitter symporter  33.33 
 
 		 446 aa  251  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000696171  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0493  sodium:neurotransmitter symporter  33.33 
 
 		 446 aa  251  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000262524  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  33.89 
 
 		 470 aa  249  5e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  33.57 
 
 		 446 aa  249  8e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  33.7 
 
 		 476 aa  249  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  34.16 
 
 		 464 aa  247  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  35.01 
 
 		 450 aa  246  4.9999999999999997e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  33.82 
 
 		 446 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  35.01 
 
 		 450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  33.97 
 
 		 446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  33.33 
 
 		 446 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  33.33 
 
 		 446 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  33.33 
 
 		 446 aa  243  6e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  31.5 
 
 		 452 aa  243  7e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  33.33 
 
 		 446 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  33.17 
 
 		 446 aa  241  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  33.33 
 
 		 446 aa  242  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  33.41 
 
 		 446 aa  241  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  33.33 
 
 		 446 aa  242  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  37.47 
 
 		 453 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  35.12 
 
 		 454 aa  240  5e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  35.65 
 
 		 450 aa  238  1e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  36.81 
 
 		 448 aa  237  4e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  35.75 
 
 		 443 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  35.56 
 
 		 475 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  35.97 
 
 		 468 aa  236  9e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  34.68 
 
 		 464 aa  236  9e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  32.67 
 
 		 456 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  35.66 
 
 		 451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  33.33 
 
 		 486 aa  233  6e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  34.2 
 
 		 455 aa  232  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  35.71 
 
 		 452 aa  232  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  35.19 
 
 		 449 aa  231  2e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  33.56 
 
 		 466 aa  229  7e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  32.94 
 
 		 447 aa  229  9e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0629  sodium-dependent transporter, putative  32.94 
 
 		 447 aa  229  9e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1069  putative sodium-dependent transporter  32.46 
 
 		 447 aa  228  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.291946  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  30.34 
 
 		 454 aa  228  2e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  32.2 
 
 		 457 aa  226  6e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  35.45 
 
 		 452 aa  226  7e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  30.42 
 
 		 456 aa  226  9e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  33.17 
 
 		 445 aa  224  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  33.17 
 
 		 445 aa  224  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  30.72 
 
 		 454 aa  224  3e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  33.17 
 
 		 445 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4060  sodium:neurotransmitter symporter  31.65 
 
 		 473 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  33.42 
 
 		 445 aa  223  8e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  33.42 
 
 		 445 aa  223  8e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2107  sodium:neurotransmitter symporter  33.97 
 
 		 461 aa  223  8e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0608619  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  33.97 
 
 		 486 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  35.38 
 
 		 459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  31.91 
 
 		 457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  33.17 
 
 		 445 aa  220  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  32.92 
 
 		 445 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  32.92 
 
 		 445 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  30.92 
 
 		 458 aa  220  3.9999999999999997e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3113  sodium:neurotransmitter symporter  31.9 
 
 		 468 aa  220  5e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3840  sodium:neurotransmitter symporter  31.9 
 
 		 486 aa  220  5e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  33.75 
 
 		 445 aa  218  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0756  Sodium:neurotransmitter symporter  33.49 
 
 		 467 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0775  sodium-dependent transporter  30.87 
 
 		 454 aa  217  5e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000147052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1520  putative sodium-dependent transporter  33.26 
 
 		 452 aa  216  7e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0966400000000004e-30 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1338  sodium-dependent transporter  33.26 
 
 		 452 aa  216  7e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1448  sodium-dependent transporter  33.26 
 
 		 451 aa  216  7e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0041724  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0250  sodium-dependent transporter, putative  32.57 
 
 		 441 aa  215  9.999999999999999e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.024876  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1311  sodium-dependent transporter  33.26 
 
 		 452 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00219151  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  33.01 
 
 		 447 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1552  sodium-dependent transporter, putative  33.04 
 
 		 451 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.110657  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0271  sodium/proline symporter  35.92 
 
 		 463 aa  214  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.639807  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1818  sodium-dependent transporter  30.57 
 
 		 458 aa  214  2.9999999999999995e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000435894  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  32.64 
 
 		 457 aa  214  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  35.44 
 
 		 455 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03634  putative sodium-dependent transporter  32.07 
 
 		 473 aa  214  3.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.439665  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1590  putative sodium-dependent transporter  33.04 
 
 		 452 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000025951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1312  sodium-dependent transporter  33.04 
 
 		 452 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00101935  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0092  sodium-dependent transporter, putative  33.92 
 
 		 442 aa  212  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  32.52 
 
 		 447 aa  212  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>