More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_23490 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  100 
 
 		 820 aa  1652    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  45.25 
 
 		 807 aa  690    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  47.92 
 
 		 791 aa  762    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  46.44 
 
 		 801 aa  671    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  42.71 
 
 		 800 aa  622  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  44.44 
 
 		 804 aa  617  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  41.21 
 
 		 839 aa  608  9.999999999999999e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  45.61 
 
 		 804 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  43.4 
 
 		 801 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  39.32 
 
 		 804 aa  590  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  44.99 
 
 		 804 aa  587  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  43.66 
 
 		 806 aa  587  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  39.13 
 
 		 819 aa  566  1e-160  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  43.7 
 
 		 811 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  42.82 
 
 		 813 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  39.47 
 
 		 803 aa  547  1e-154  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  39.4 
 
 		 841 aa  538  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  40.3 
 
 		 804 aa  537  1e-151  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  40.23 
 
 		 802 aa  530  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  36.67 
 
 		 841 aa  532  1e-149  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  38.08 
 
 		 818 aa  528  1e-148  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  40.35 
 
 		 804 aa  524  1e-147  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  40.65 
 
 		 816 aa  519  1e-146  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  36.12 
 
 		 768 aa  483  1e-135  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  35.83 
 
 		 768 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  32.84 
 
 		 781 aa  449  1.0000000000000001e-124  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  33.25 
 
 		 774 aa  429  1e-119  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  33.66 
 
 		 780 aa  429  1e-118  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  34.97 
 
 		 1196 aa  413  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  32.8 
 
 		 793 aa  411  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  35.84 
 
 		 1150 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0087  methionine synthase  36.81 
 
 		 1149 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.834345  normal  0.210518 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  36 
 
 		 1150 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  36 
 
 		 1150 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  33.67 
 
 		 1208 aa  401  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0064  methionine synthase  32.58 
 
 		 1254 aa  394  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496444 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  32.71 
 
 		 1180 aa  386  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  32.98 
 
 		 1158 aa  379  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  32.73 
 
 		 1183 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  31.84 
 
 		 1191 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  31.84 
 
 		 1191 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  33.45 
 
 		 1189 aa  370  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  32.79 
 
 		 1223 aa  370  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  32.57 
 
 		 1178 aa  368  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  31.23 
 
 		 1178 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  32.38 
 
 		 1224 aa  368  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12156  5-methyltetrahydrofolate-homocystein methyltransferase metH  31.36 
 
 		 1192 aa  360  4e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.726643 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1372  methionine synthase (B12-dependent)  31.15 
 
 		 1190 aa  360  4e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.477278 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27020  methionine synthase (B12-dependent)  31.4 
 
 		 1184 aa  359  9e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12372  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  31.85 
 
 		 1176 aa  358  1.9999999999999998e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  31.06 
 
 		 1197 aa  358  1.9999999999999998e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1488  methionine synthase  32.05 
 
 		 1156 aa  356  1e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.128181  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  31.55 
 
 		 1215 aa  355  1e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5363  methionine synthase  31.81 
 
 		 1169 aa  356  1e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.816675 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.91 
 
 		 1163 aa  355  2e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  31.25 
 
 		 1154 aa  353  8.999999999999999e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5917  methionine synthase  31.64 
 
 		 1154 aa  352  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0712476  normal  0.0446229 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  31.18 
 
 		 1208 aa  347  6e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  29.71 
 
 		 1182 aa  347  7e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  29.71 
 
 		 1182 aa  346  8.999999999999999e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0723  methionine synthase  33.65 
 
 		 1151 aa  346  1e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.830371  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  30.28 
 
 		 1132 aa  346  1e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  30.65 
 
 		 1132 aa  345  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14891  putative methionine synthase  30.6 
 
 		 1214 aa  345  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.123192 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  30.65 
 
 		 1132 aa  345  2e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  31.62 
 
 		 1136 aa  344  5e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.37 
 
 		 1208 aa  343  7e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  31.01 
 
 		 1132 aa  343  7e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.27 
 
 		 1132 aa  342  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.27 
 
 		 1132 aa  342  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16010  methionine synthase (B12-dependent)  32.9 
 
 		 1176 aa  341  2.9999999999999998e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471767  normal  0.0779461 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  31.3 
 
 		 1157 aa  340  4e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.14 
 
 		 1133 aa  340  5e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  30.98 
 
 		 1171 aa  340  7e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.14 
 
 		 1132 aa  340  7e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2445  methionine synthase  31.49 
 
 		 1199 aa  340  7e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.795669  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  30.71 
 
 		 1158 aa  340  8e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2786  methionine synthase  32.14 
 
 		 1195 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000283973  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  31.88 
 
 		 1168 aa  338  1.9999999999999998e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  30.04 
 
 		 1132 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09821  putative methionine synthase  28.52 
 
 		 1188 aa  337  5.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  30.53 
 
 		 1132 aa  337  7e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3503  methionine synthase  31 
 
 		 1212 aa  337  7e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929135  normal  0.479801 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0923  putative methionine synthase  29.09 
 
 		 1188 aa  336  1e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.02 
 
 		 1133 aa  335  3e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  30.7 
 
 		 1171 aa  334  5e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  30.63 
 
 		 1136 aa  333  6e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  31.8 
 
 		 1169 aa  332  2e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1418  methionine synthase  31.55 
 
 		 1181 aa  330  5.0000000000000004e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.156555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09591  putative methionine synthase  28.87 
 
 		 1187 aa  330  5.0000000000000004e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1549  methionine synthase  30.86 
 
 		 1156 aa  329  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.217391 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1940  methionine synthase  31.91 
 
 		 1193 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.092673  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09841  putative methionine synthase  28.81 
 
 		 1188 aa  328  3e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2171  methionine synthase  30.55 
 
 		 1167 aa  328  3e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.657352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4499  methionine synthase  29.22 
 
 		 1173 aa  327  4.0000000000000003e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.629663  hitchhiker  0.00843884 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  28.17 
 
 		 1191 aa  327  6e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2144  methionine synthase  30.87 
 
 		 1243 aa  311  2e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.212238  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2159  B12-dependent methionine synthase  30.22 
 
 		 1236 aa  310  9e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.088857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3149  B12-dependent methionine synthase  30.43 
 
 		 1220 aa  309  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3211  B12-dependent methionine synthase  30.43 
 
 		 1264 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.509178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>