More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_23440 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_23440  LSU ribosomal protein L2P  100 
 
 
276 aa  559  1e-158  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  5.61637e-06  decreased coverage  1.03379e-08 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  91.67 
 
 
276 aa  522  1e-147  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  91.67 
 
 
276 aa  519  1e-146  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  1.65173e-06 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1158  ribosomal protein L2  77.9 
 
 
278 aa  449  1e-125  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  1.62145e-06  hitchhiker  6.63071e-07 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  69.57 
 
 
276 aa  402  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  68.84 
 
 
276 aa  398  1e-110  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.80933e-09  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  68.84 
 
 
276 aa  397  1e-110  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  2.04251e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  68.84 
 
 
276 aa  398  1e-110  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  2.49417e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  68.48 
 
 
276 aa  396  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.87869e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  70.18 
 
 
275 aa  394  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  68.12 
 
 
276 aa  395  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  9.01221e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  68.84 
 
 
276 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  2.90971e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  68.48 
 
 
276 aa  394  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  68.12 
 
 
276 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  5.12601e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  68.12 
 
 
276 aa  395  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  68.12 
 
 
276 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  1.38046e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  68.12 
 
 
276 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  68.12 
 
 
276 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.00516e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  68.12 
 
 
276 aa  395  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  2.00839e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  69.57 
 
 
275 aa  387  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  69.2 
 
 
276 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  68.84 
 
 
275 aa  384  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  68.25 
 
 
275 aa  380  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  65.22 
 
 
276 aa  381  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  69.2 
 
 
275 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  67.27 
 
 
277 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0061  50S ribosomal protein L2  66.67 
 
 
277 aa  380  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.41006  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1181  ribosomal protein L2  66.3 
 
 
274 aa  375  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000178958  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0565  50S ribosomal protein L2  69.68 
 
 
277 aa  376  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1904  50S ribosomal protein L2  65.58 
 
 
277 aa  376  1e-103  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2062  50S ribosomal protein L2  66.67 
 
 
275 aa  374  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  3.31539e-08  normal  0.228916 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  65.82 
 
 
275 aa  376  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.5035e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  65.58 
 
 
277 aa  373  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  64.86 
 
 
277 aa  372  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  2.99614e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5046  50S ribosomal protein L2  69.57 
 
 
279 aa  371  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.126955 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2904  ribosomal protein L2  67.03 
 
 
275 aa  372  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1308  50S ribosomal protein L2  69.2 
 
 
278 aa  371  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186589  normal  0.118426 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  64.49 
 
 
274 aa  372  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  64.86 
 
 
277 aa  372  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  2.90927e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4318  ribosomal protein L2  67.87 
 
 
277 aa  367  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1762  50S ribosomal protein L2  66.42 
 
 
276 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00807764  normal  0.409688 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10718  50S ribosomal protein L2  68.84 
 
 
280 aa  369  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0762488  normal  0.210258 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  68.12 
 
 
279 aa  367  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  65.7 
 
 
275 aa  368  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0082  50S ribosomal protein L2  66.42 
 
 
276 aa  368  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173583 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1043  50S ribosomal protein L2  68.84 
 
 
278 aa  364  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1033  50S ribosomal protein L2  68.84 
 
 
278 aa  364  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0850  50S ribosomal protein L2  66.55 
 
 
277 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104266  decreased coverage  1.30499e-05 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0590  50S ribosomal protein L2  66.67 
 
 
278 aa  365  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.886345 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0683  50S ribosomal protein L2  65.94 
 
 
274 aa  364  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4312  50S ribosomal protein L2  69.09 
 
 
279 aa  365  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1343  ribosomal protein L2  67.9 
 
 
279 aa  365  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1016  50S ribosomal protein L2  68.84 
 
 
278 aa  364  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  63.77 
 
 
274 aa  366  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3920  50S ribosomal protein L2  69.09 
 
 
279 aa  363  1e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5127  ribosomal protein L2  68.01 
 
 
279 aa  364  1e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.840283 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1349  50S ribosomal protein L2  64.86 
 
 
274 aa  363  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1070  50S ribosomal protein L2  64.86 
 
 
274 aa  363  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.47453e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  64.23 
 
 
277 aa  362  3e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2643  50S ribosomal protein L2  67.15 
 
 
277 aa  362  3e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.331406  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2254  50S ribosomal protein L2  65.33 
 
 
276 aa  362  3e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000201463  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  64.23 
 
 
277 aa  362  3e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1182  50S ribosomal protein L2  66.43 
 
 
275 aa  362  4e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0630  ribosomal protein L2  65.58 
 
 
278 aa  361  6e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  63.04 
 
 
276 aa  360  1e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.10614e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3902  50S ribosomal protein L2  69.2 
 
 
278 aa  360  1e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2854  50S ribosomal protein L2  65.22 
 
 
274 aa  359  3e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.16125  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3432  ribosomal protein L2  68.48 
 
 
278 aa  359  3e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2330  50S ribosomal protein L2  63.27 
 
 
275 aa  359  3e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3755  ribosomal protein L2  67.39 
 
 
278 aa  358  4e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168054  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2399  50S ribosomal protein L2  64.1 
 
 
276 aa  358  6e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00287166  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0663  50S ribosomal protein L2  64.64 
 
 
282 aa  358  7e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000112808  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  62.64 
 
 
280 aa  357  8e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0936  50S ribosomal protein L2  63.77 
 
 
274 aa  357  1e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  1.4248e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29710  LSU ribosomal protein L2P  65.22 
 
 
279 aa  356  2e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0629  50S ribosomal protein L2  64.49 
 
 
274 aa  356  2e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  8.33663e-07  hitchhiker  8.56838e-12 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0691  50S ribosomal protein L2  65.58 
 
 
278 aa  357  2e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0934  50S ribosomal protein L2  65.94 
 
 
278 aa  355  3e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0813346  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3325  50S ribosomal protein L2  63.41 
 
 
274 aa  355  4e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.29312e-15 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1089  50S ribosomal protein L2  67.65 
 
 
278 aa  355  5e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.062286 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0309  50S ribosomal protein L2  66.67 
 
 
278 aa  354  7e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237082 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  64.98 
 
 
275 aa  354  7e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  6.88583e-06 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  61.37 
 
 
279 aa  354  8e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1295  50S ribosomal protein L2  64.26 
 
 
276 aa  354  9e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.22183e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1391  50S ribosomal protein L2  64.26 
 
 
276 aa  354  9e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  2.32502e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  61.23 
 
 
277 aa  354  1e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.95488e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2972  50S ribosomal protein L2  65.22 
 
 
279 aa  353  2e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.373119  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6046  50S ribosomal protein L2  67.53 
 
 
277 aa  353  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.966383  normal  0.220559 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2771  50S ribosomal protein L2  65.69 
 
 
276 aa  353  2e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00347741  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1558  50S ribosomal protein L2  63.27 
 
 
273 aa  352  3e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2656  ribosomal protein L2  64.49 
 
 
278 aa  352  4e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2684  50S ribosomal protein L2  64.49 
 
 
279 aa  352  4e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.795972 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  59.49 
 
 
283 aa  351  7e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1135  50S ribosomal protein L2  64 
 
 
275 aa  351  8e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  9.03374e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17130  50S ribosomal protein L2  65.58 
 
 
279 aa  351  8e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.411927  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3140  50S ribosomal protein L2  64.86 
 
 
278 aa  350  1e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.524365  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1943  50S ribosomal protein L2  63.14 
 
 
282 aa  350  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  61.96 
 
 
277 aa  350  1e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0037  50S ribosomal protein L2  63.77 
 
 
276 aa  350  1e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00257974  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0585  50S ribosomal protein L2  66.42 
 
 
277 aa  349  2e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>