37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_22100 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_22100  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  532  1e-150  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00255841 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1609  hypothetical protein  40.56 
 
 		 273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3207  TM1410 hypothetical-related protein  25.82 
 
 		 918 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.107139  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1621  putative signal peptide protein  25.73 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.174255  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1831  hypothetical protein  27.8 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124467 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2532  TM1410 hypothetical-related protein  27.8 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0372  TM1410 hypothetical-related protein  24 
 
 		 518 aa  70.9  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2475  TM1410 hypothetical-related protein  25.73 
 
 		 980 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5630  hypothetical protein  26.91 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0773  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 943 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.430568  normal  0.0849732 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1647  putative signal peptide protein  28.64 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.053126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2968  hypothetical protein  35 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3735  hypothetical protein  34 
 
 		 412 aa  62.4  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.756384  normal  0.0338258 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5582  hypothetical protein  26.51 
 
 		 272 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1498  hypothetical protein  28.7 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0535  hypothetical protein  23.97 
 
 		 908 aa  58.9  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000617771  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1962  hypothetical protein  23.58 
 
 		 917 aa  58.9  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000223558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2531  TM1410 hypothetical-related protein  37.5 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0125598  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1043  putative signal peptide protein  28.92 
 
 		 941 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5290  hypothetical protein  26.07 
 
 		 961 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.287428  normal  0.279625 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5546  putative signal peptide protein  25.82 
 
 		 942 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2432  putative signal peptide protein  23.79 
 
 		 939 aa  57  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0164247  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2106  hypothetical protein  33.71 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3133  hypothetical protein  22.13 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1499  hypothetical protein  23.67 
 
 		 305 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.555638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2974  hypothetical protein  23.28 
 
 		 282 aa  52  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261416 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4155  hypothetical protein  23.3 
 
 		 953 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432055  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0672  hypothetical protein  28.17 
 
 		 322 aa  50.4  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3631  hypothetical protein  31.46 
 
 		 275 aa  48.9  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2276  putative signal peptide protein  23.24 
 
 		 948 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806007  normal  0.316994 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08154  conserved hypothetical protein  33.67 
 
 		 336 aa  47.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.809637 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0681  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase precusor  34.91 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02953  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07890)  32.67 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4700  TM1410 hypothetical-related protein  30 
 
 		 290 aa  45.4  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.267519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1000  TM1410 hypothetical-related protein  28.7 
 
 		 307 aa  43.1  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3951  hypothetical protein  28.95 
 
 		 338 aa  42.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0991  cysteinyl-tRNA synthetase  21.97 
 
 		 286 aa  42  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00231888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>