37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_22100 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_22100  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  532  1e-150  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00255841 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1609  hypothetical protein  40.56 
 
 
273 aa  213  3e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3207  TM1410 hypothetical-related protein  25.82 
 
 
918 aa  79.3  6e-14  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.107139  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1621  putative signal peptide protein  25.73 
 
 
286 aa  75.1  1e-12  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.174255  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1831  hypothetical protein  27.8 
 
 
321 aa  73.9  2e-12  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124467 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2532  TM1410 hypothetical-related protein  27.8 
 
 
262 aa  70.9  2e-11  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0372  TM1410 hypothetical-related protein  24 
 
 
518 aa  70.9  2e-11  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2475  TM1410 hypothetical-related protein  25.73 
 
 
980 aa  65.9  7e-10  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5630  hypothetical protein  26.91 
 
 
272 aa  64.3  2e-09  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0773  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 
943 aa  63.5  3e-09  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.430568  normal  0.0849732 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1647  putative signal peptide protein  28.64 
 
 
262 aa  63.5  4e-09  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.053126  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2968  hypothetical protein  35 
 
 
395 aa  63.5  4e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3735  hypothetical protein  34 
 
 
412 aa  62.4  7e-09  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.756384  normal  0.0338258 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5582  hypothetical protein  26.51 
 
 
272 aa  62  9e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1498  hypothetical protein  28.7 
 
 
391 aa  60.1  3e-08  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0535  hypothetical protein  23.97 
 
 
908 aa  58.9  7e-08  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000617771  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1962  hypothetical protein  23.58 
 
 
917 aa  58.9  7e-08  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.23558e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2531  TM1410 hypothetical-related protein  37.5 
 
 
275 aa  58.2  1e-07  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0125598  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5546  putative signal peptide protein  25.82 
 
 
942 aa  57.8  2e-07  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5290  hypothetical protein  26.07 
 
 
961 aa  57.4  2e-07  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.287428  normal  0.279625 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1043  putative signal peptide protein  28.92 
 
 
941 aa  57.8  2e-07  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2432  putative signal peptide protein  23.79 
 
 
939 aa  57  3e-07  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0164247  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2106  hypothetical protein  33.71 
 
 
302 aa  55.8  7e-07  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3133  hypothetical protein  22.13 
 
 
314 aa  54.7  2e-06  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1499  hypothetical protein  23.67 
 
 
305 aa  52.8  5e-06  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.555638  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2974  hypothetical protein  23.28 
 
 
282 aa  52  9e-06  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.261416 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4155  hypothetical protein  23.3 
 
 
953 aa  51.6  1e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432055  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0672  hypothetical protein  28.17 
 
 
322 aa  50.4  3e-05  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3631  hypothetical protein  31.46 
 
 
275 aa  48.9  8e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2276  putative signal peptide protein  23.24 
 
 
948 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806007  normal  0.316994 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0681  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase precusor  34.91 
 
 
268 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02953  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07890)  32.67 
 
 
314 aa  47.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08154  conserved hypothetical protein  33.67 
 
 
336 aa  47.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.809637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4700  TM1410 hypothetical-related protein  30 
 
 
290 aa  45.4  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.267519  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1000  TM1410 hypothetical-related protein  28.7 
 
 
307 aa  43.1  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3951  hypothetical protein  28.95 
 
 
338 aa  42.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0991  cysteinyl-tRNA synthetase  21.97 
 
 
286 aa  42  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00231888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>